Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 AQY1YPR192W 918 nt17.13■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 SWC5YBR231C 912 nt17.13■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt17.12■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 RAD51YER095W 1203 nt17.12■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 SDH1YKL148C 1923 nt17.12■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 NDI1YML120C 1542 nt17.1■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 DAT1YML113W 747 nt17.1■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 CCT4YDL143W 1587 nt17.09■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 ATF2YGR177C 1608 nt17.08■□□□□ 0.33
TY1B-GR3Q12316 ALG3YBL082C 1377 nt17.03■□□□□ 0.32
TY1B-GR3Q12316 STB1YNL309W 1263 nt17.02■□□□□ 0.31
TY1B-GR3Q12316 SPC25YER018C 666 nt17■□□□□ 0.31
TY1B-GR3Q12316 YMR090WYMR090W 684 nt17■□□□□ 0.31
TY1B-GR3Q12316 RBG1YAL036C 1110 nt17■□□□□ 0.31
TY1B-GR3Q12316 VPS60YDR486C 690 nt16.97■□□□□ 0.31
TY1B-GR3Q12316 RRT12YCR045C 1476 nt16.96■□□□□ 0.31
TY1B-GR3Q12316 YGL034CYGL034C 366 nt16.95■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 GPI16YHR188C 1833 nt16.95■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 SPT8YLR055C 1809 nt16.94■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 UBA4YHR111W 1323 nt16.93■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 PAU7YAR020C 168 nt16.93■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 SIM1YIL123W 1431 nt16.91■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 SHB17YKR043C 816 nt16.91■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 DDR2YOL052C-A 186 nt16.91■□□□□ 0.3
TY1B-GR3Q12316 XYL2YLR070C 1071 nt16.89■□□□□ 0.29
TY1B-GR3Q12316 YNL195CYNL195C 786 nt16.87■□□□□ 0.29
TY1B-GR3Q12316 YBR220CYBR220C 1683 nt16.85■□□□□ 0.29
TY1B-GR3Q12316 YFL067WYFL067W 528 nt16.79■□□□□ 0.28
TY1B-GR3Q12316 RPM1RPM1 483 nt16.77■□□□□ 0.27
TY1B-GR3Q12316 YDR010CYDR010C 333 nt16.76■□□□□ 0.27
TY1B-GR3Q12316 TIM17YJL143W 477 nt16.75■□□□□ 0.27
TY1B-GR3Q12316 CRR1YLR213C 1269 nt16.74■□□□□ 0.27
TY1B-GR3Q12316 SAM1YLR180W 1149 nt16.72■□□□□ 0.27
TY1B-GR3Q12316 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt16.71■□□□□ 0.27
TY1B-GR3Q12316 SGT2YOR007C 1041 nt16.7■□□□□ 0.26
TY1B-GR3Q12316 ANP1YEL036C 1503 nt16.69■□□□□ 0.26
TY1B-GR3Q12316 ERF2YLR246W 1080 nt16.69■□□□□ 0.26
TY1B-GR3Q12316 MIC10YCL057C-A 294 nt16.68■□□□□ 0.26
TY1B-GR3Q12316 YSR3YKR053C 1215 nt16.66■□□□□ 0.26
TY1B-GR3Q12316 YHL050CYHL050C 2094 nt16.65■□□□□ 0.26
TY1B-GR3Q12316 FEN2YCR028C 1539 nt16.64■□□□□ 0.25
TY1B-GR3Q12316 AIM45YPR004C 1035 nt16.63■□□□□ 0.25
TY1B-GR3Q12316 YNR029CYNR029C 1290 nt16.61■□□□□ 0.25
TY1B-GR3Q12316 SSA4YER103W 1929 nt16.58■□□□□ 0.24
TY1B-GR3Q12316 PHO89YBR296C 1725 nt16.57■□□□□ 0.24
TY1B-GR3Q12316 SHM2YLR058C 1410 nt16.55■□□□□ 0.24
TY1B-GR3Q12316 RET2YFR051C 1641 nt16.54■□□□□ 0.24
TY1B-GR3Q12316 ADH7YCR105W 1086 nt16.52■□□□□ 0.24
TY1B-GR3Q12316 SNG1YGR197C 1644 nt16.51■□□□□ 0.23
TY1B-GR3Q12316 CAB5YDR196C 726 nt16.51■□□□□ 0.23
TY1B-GR3Q12316 YIR016WYIR016W 798 nt16.48■□□□□ 0.23
TY1B-GR3Q12316 NIT1YIL164C 600 nt16.46■□□□□ 0.23
TY1B-GR3Q12316 YLR349WYLR349W 507 nt16.46■□□□□ 0.22
TY1B-GR3Q12316 YLR111WYLR111W 333 nt16.45■□□□□ 0.22
TY1B-GR3Q12316 SDH5YOL071W 489 nt16.45■□□□□ 0.22
TY1B-GR3Q12316 XDJ1YLR090W 1380 nt16.42■□□□□ 0.22
TY1B-GR3Q12316 COQ2YNR041C 1119 nt16.41■□□□□ 0.22
TY1B-GR3Q12316 YLR279WYLR279W 390 nt16.4■□□□□ 0.22
TY1B-GR3Q12316 YMR226CYMR226C 804 nt16.38■□□□□ 0.21
TY1B-GR3Q12316 YCR087WYCR087W 516 nt16.36■□□□□ 0.21
TY1B-GR3Q12316 PAU15YIR041W 375 nt16.33■□□□□ 0.21
TY1B-GR3Q12316 STE4YOR212W 1272 nt16.33■□□□□ 0.21
TY1B-GR3Q12316 HEM12YDR047W 1089 nt16.31■□□□□ 0.2
TY1B-GR3Q12316 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt16.19■□□□□ 0.18
TY1B-GR3Q12316 MRP20YDR405W 792 nt16.18■□□□□ 0.18
TY1B-GR3Q12316 SFA1YDL168W 1161 nt16.16■□□□□ 0.18
TY1B-GR3Q12316 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt16.16■□□□□ 0.18
TY1B-GR3Q12316 LYS4YDR234W 2082 nt16.16■□□□□ 0.18
TY1B-GR3Q12316 RPS14BYJL191W 417 nt16.15■□□□□ 0.18
TY1B-GR3Q12316 GDH3YAL062W 1374 nt16.13■□□□□ 0.17
TY1B-GR3Q12316 MIC12YBR262C 321 nt16.03■□□□□ 0.16
TY1B-GR3Q12316 YGR201CYGR201C 678 nt16.02■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 FUN14YAL008W 597 nt16■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 AVT6YER119C 1347 nt15.99■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 RPL4BYDR012W 1089 nt15.98■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 RPL4AYBR031W 1089 nt15.98■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 GPN2YOR262W 1044 nt15.97■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 BNA2YJR078W 1362 nt15.97■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 YGR012WYGR012W 1182 nt15.96■□□□□ 0.15
TY1B-GR3Q12316 RAD23YEL037C 1197 nt15.94■□□□□ 0.14
TY1B-GR3Q12316 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.94■□□□□ 0.14
TY1B-GR3Q12316 NCP1YHR042W 2076 nt15.92■□□□□ 0.14
TY1B-GR3Q12316 SHH4YLR164W 507 nt15.86■□□□□ 0.13
TY1B-GR3Q12316 HHO1YPL127C 777 nt15.85■□□□□ 0.13
TY1B-GR3Q12316 ADH1YOL086C 1047 nt15.84■□□□□ 0.13
TY1B-GR3Q12316 SEC11YIR022W 504 nt15.82■□□□□ 0.12
TY1B-GR3Q12316 MSB4YOL112W 1479 nt15.81■□□□□ 0.12
TY1B-GR3Q12316 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt15.81■□□□□ 0.12
TY1B-GR3Q12316 YJL195CYJL195C 702 nt15.81■□□□□ 0.12
TY1B-GR3Q12316 TSC10YBR265W 963 nt15.77■□□□□ 0.12
TY1B-GR3Q12316 PEX2YJL210W 816 nt15.76■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 DUT1YBR252W 444 nt15.74■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 CPD1YGR247W 720 nt15.72■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 ESS1YJR017C 513 nt15.72■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 NRT1YOR071C 1797 nt15.72■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 TOM6YOR045W 186 nt15.72■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 PUP1YOR157C 786 nt15.72■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 PCH2YBR186W 1695 nt15.71■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 SEN2YLR105C 1134 nt15.71■□□□□ 0.11
TY1B-GR3Q12316 UTH1YKR042W 1098 nt15.7■□□□□ 0.1
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