Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 HEM12YDR047W 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 AHT1YHR093W 549 nt10.62□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 WSC2YNL283C 1512 nt10.62□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 YFL054CYFL054C 1941 nt10.61□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 STB1YNL309W 1263 nt10.6□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 TAD3YLR316C 969 nt10.59□□□□□ -0.71
RRP42Q12277 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.58□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 SNG1YGR197C 1644 nt10.58□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 SPC25YER018C 666 nt10.57□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 Q0182Q0182 405 nt10.57□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 GPI16YHR188C 1833 nt10.56□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 MIC10YCL057C-A 294 nt10.56□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 ANP1YEL036C 1503 nt10.53□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 CCT4YDL143W 1587 nt10.52□□□□□ -0.72
RRP42Q12277 SWC5YBR231C 912 nt10.51□□□□□ -0.73
RRP42Q12277 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.5□□□□□ -0.73
RRP42Q12277 FEN2YCR028C 1539 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP42Q12277 VPS60YDR486C 690 nt10.49□□□□□ -0.73
RRP42Q12277 SPT8YLR055C 1809 nt10.47□□□□□ -0.73
RRP42Q12277 BNA2YJR078W 1362 nt10.44□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 RAX1YOR301W 1308 nt10.44□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 YJL225CYJL225C 5277 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 YLR415CYLR415C 339 nt10.42□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 ALG3YBL082C 1377 nt10.41□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 BDH1YAL060W 1149 nt10.41□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 YIR016WYIR016W 798 nt10.4□□□□□ -0.74
RRP42Q12277 UME6YDR207C 2511 nt10.39□□□□□ -0.75
RRP42Q12277 YDR094WYDR094W 336 nt10.38□□□□□ -0.75
RRP42Q12277 SWE1YJL187C 2460 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP42Q12277 MIC12YBR262C 321 nt10.34□□□□□ -0.75
RRP42Q12277 YSP3YOR003W 1437 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP42Q12277 YFR018CYFR018C 1092 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP42Q12277 UBX6YJL048C 1191 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP42Q12277 PEX25YPL112C 1185 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP42Q12277 YNL115CYNL115C 1935 nt10.29□□□□□ -0.76
RRP42Q12277 HHO1YPL127C 777 nt10.28□□□□□ -0.76
RRP42Q12277 CCA1YER168C 1641 nt10.26□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 YFL066CYFL066C 1179 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 YGR201CYGR201C 678 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 XDJ1YLR090W 1380 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 RRT5YFR032C 870 nt10.24□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 TIM17YJL143W 477 nt10.24□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 PRE6YOL038W 765 nt10.22□□□□□ -0.77
RRP42Q12277 SHM2YLR058C 1410 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP42Q12277 GDH3YAL062W 1374 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP42Q12277 VPS75YNL246W 795 nt10.18□□□□□ -0.78
RRP42Q12277 PAU16YKL224C 372 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP42Q12277 AVT6YER119C 1347 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 AGP1YCL025C 1902 nt10.13□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 DUS1YML080W 1272 nt10.13□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 GOR1YNL274C 1053 nt10.12□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.09□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.09□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 PAU7YAR020C 168 nt10.09□□□□□ -0.79
RRP42Q12277 SGT2YOR007C 1041 nt10.07□□□□□ -0.8
RRP42Q12277 NIT1YIL164C 600 nt10.06□□□□□ -0.8
RRP42Q12277 FUR4YBR021W 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
RRP42Q12277 GLK1YCL040W 1503 nt10.03□□□□□ -0.8
RRP42Q12277 DUT1YBR252W 444 nt10.03□□□□□ -0.8
RRP42Q12277 YCL074WYCL074W 927 nt10.01□□□□□ -0.81
RRP42Q12277 DAT1YML113W 747 nt10.01□□□□□ -0.81
RRP42Q12277 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10□□□□□ -0.81
RRP42Q12277 MIR1YJR077C 936 nt10□□□□□ -0.81
RRP42Q12277 NAT4YMR069W 858 nt10□□□□□ -0.81
RRP42Q12277 YCR102CYCR102C 1107 nt9.96□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 THI74YDR438W 1113 nt9.96□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 AQY2YLL052C 450 nt9.95□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 SHB17YKR043C 816 nt9.94□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 STR3YGL184C 1398 nt9.93□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 HSP60YLR259C 1719 nt9.93□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 BOR1YNL275W 1731 nt9.92□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 MSF1YPR047W 1410 nt9.91□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.9□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.9□□□□□ -0.82
RRP42Q12277 UBA4YHR111W 1323 nt9.88□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 YDR010CYDR010C 333 nt9.88□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 YSR3YKR053C 1215 nt9.85□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 NBP35YGL091C 987 nt9.84□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 RET2YFR051C 1641 nt9.84□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 PRP4YPR178W 1398 nt9.84□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 YKR005CYKR005C 1578 nt9.84□□□□□ -0.83
RRP42Q12277 BMT6YLR063W 1098 nt9.82□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 PHO89YBR296C 1725 nt9.82□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 YGR259CYGR259C 441 nt9.81□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 RTN2YDL204W 1182 nt9.8□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 MCH5YOR306C 1566 nt9.8□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 YCR087WYCR087W 516 nt9.79□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 YGL034CYGL034C 366 nt9.78□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 TIR3YIL011W 810 nt9.78□□□□□ -0.84
RRP42Q12277 DPS1YLL018C 1674 nt9.76□□□□□ -0.85
RRP42Q12277 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.75□□□□□ -0.85
RRP42Q12277 XYL2YLR070C 1071 nt9.75□□□□□ -0.85
RRP42Q12277 SFA1YDL168W 1161 nt9.73□□□□□ -0.85
RRP42Q12277 MRP20YDR405W 792 nt9.73□□□□□ -0.85
RRP42Q12277 SHH4YLR164W 507 nt9.72□□□□□ -0.85
RRP42Q12277 LSC2YGR244C 1284 nt9.71□□□□□ -0.86
RRP42Q12277 ARP6YLR085C 1317 nt9.71□□□□□ -0.86
RRP42Q12277 AAC1YMR056C 930 nt9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.4 ms