Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 AQY1YPR192W 918 nt11.23□□□□□ -0.61
LCB4Q12246 STB1YNL309W 1263 nt11.22□□□□□ -0.61
LCB4Q12246 NCP1YHR042W 2076 nt11.21□□□□□ -0.61
LCB4Q12246 DDR2YOL052C-A 186 nt11.21□□□□□ -0.61
LCB4Q12246 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.2□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 ERF2YLR246W 1080 nt11.2□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 BDH1YAL060W 1149 nt11.19□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 RRT5YFR032C 870 nt11.18□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 CCT4YDL143W 1587 nt11.17□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 SPC25YER018C 666 nt11.17□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 CRR1YLR213C 1269 nt11.17□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 YFL067WYFL067W 528 nt11.15□□□□□ -0.62
LCB4Q12246 VPS60YDR486C 690 nt11.14□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 PEX25YPL112C 1185 nt11.14□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 YSP3YOR003W 1437 nt11.13□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 MIC10YCL057C-A 294 nt11.13□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 YNL115CYNL115C 1935 nt11.13□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 LYS4YDR234W 2082 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 RTF1YGL244W 1677 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 YLR415CYLR415C 339 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 SWC5YBR231C 912 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 GPI16YHR188C 1833 nt11.12□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 BOP3YNL042W 1191 nt11.11□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 ALG3YBL082C 1377 nt11.11□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 SNG1YGR197C 1644 nt11.1□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 PIB2YGL023C 1908 nt11.1□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 FEN2YCR028C 1539 nt11.09□□□□□ -0.63
LCB4Q12246 HEM12YDR047W 1089 nt11.08□□□□□ -0.64
LCB4Q12246 ANP1YEL036C 1503 nt11.07□□□□□ -0.64
LCB4Q12246 NVJ2YPR091C 2313 nt11.04□□□□□ -0.64
LCB4Q12246 SBA1YKL117W 651 nt11.01□□□□□ -0.65
LCB4Q12246 YIR016WYIR016W 798 nt10.98□□□□□ -0.65
LCB4Q12246 PTK1YKL198C 1989 nt10.96□□□□□ -0.65
LCB4Q12246 SPT8YLR055C 1809 nt10.93□□□□□ -0.66
LCB4Q12246 NAT4YMR069W 858 nt10.93□□□□□ -0.66
LCB4Q12246 GLK1YCL040W 1503 nt10.92□□□□□ -0.66
LCB4Q12246 MIR1YJR077C 936 nt10.89□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 VPS75YNL246W 795 nt10.89□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.87□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 THI74YDR438W 1113 nt10.85□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 MSF1YPR047W 1410 nt10.84□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 YFL054CYFL054C 1941 nt10.84□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 BNA2YJR078W 1362 nt10.84□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 SHM2YLR058C 1410 nt10.84□□□□□ -0.67
LCB4Q12246 TIM17YJL143W 477 nt10.83□□□□□ -0.68
LCB4Q12246 XDJ1YLR090W 1380 nt10.82□□□□□ -0.68
LCB4Q12246 PAU7YAR020C 168 nt10.82□□□□□ -0.68
LCB4Q12246 RAX1YOR301W 1308 nt10.8□□□□□ -0.68
LCB4Q12246 MIC12YBR262C 321 nt10.78□□□□□ -0.68
LCB4Q12246 GDH3YAL062W 1374 nt10.77□□□□□ -0.69
LCB4Q12246 DAT1YML113W 747 nt10.76□□□□□ -0.69
LCB4Q12246 HHO1YPL127C 777 nt10.75□□□□□ -0.69
LCB4Q12246 SGT2YOR007C 1041 nt10.74□□□□□ -0.69
LCB4Q12246 SHB17YKR043C 816 nt10.73□□□□□ -0.69
LCB4Q12246 NIT1YIL164C 600 nt10.72□□□□□ -0.69
LCB4Q12246 UBA4YHR111W 1323 nt10.7□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 AVT6YER119C 1347 nt10.66□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 YGL034CYGL034C 366 nt10.66□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 YDR010CYDR010C 333 nt10.65□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 YGR201CYGR201C 678 nt10.65□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 YSR3YKR053C 1215 nt10.65□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 DUT1YBR252W 444 nt10.65□□□□□ -0.7
LCB4Q12246 CCA1YER168C 1641 nt10.64□□□□□ -0.71
LCB4Q12246 XYL2YLR070C 1071 nt10.63□□□□□ -0.71
LCB4Q12246 AGP1YCL025C 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
LCB4Q12246 SWE1YJL187C 2460 nt10.58□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 PHO89YBR296C 1725 nt10.58□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 GOR1YNL274C 1053 nt10.57□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 RBG1YAL036C 1110 nt10.56□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 YMR244WYMR244W 1068 nt10.55□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 NDI1YML120C 1542 nt10.53□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 RET2YFR051C 1641 nt10.53□□□□□ -0.72
LCB4Q12246 YJL225CYJL225C 5277 nt10.52□□□□□ -0.73
LCB4Q12246 GLR1YPL091W 1452 nt10.51□□□□□ -0.73
LCB4Q12246 DUS1YML080W 1272 nt10.47□□□□□ -0.73
LCB4Q12246 YCR102CYCR102C 1107 nt10.45□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 SFA1YDL168W 1161 nt10.44□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 COQ2YNR041C 1119 nt10.44□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 AIM45YPR004C 1035 nt10.44□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 YCR087WYCR087W 516 nt10.43□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 MRP20YDR405W 792 nt10.41□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.41□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 SHH4YLR164W 507 nt10.4□□□□□ -0.74
LCB4Q12246 AQY2YLL052C 450 nt10.39□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 NBP35YGL091C 987 nt10.36□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 STR3YGL184C 1398 nt10.36□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 BOR1YNL275W 1731 nt10.35□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.35□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.35□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 RBG2YGR173W 1107 nt10.34□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 UME6YDR207C 2511 nt10.34□□□□□ -0.75
LCB4Q12246 TOM6YOR045W 186 nt10.31□□□□□ -0.76
LCB4Q12246 YCL074WYCL074W 927 nt10.28□□□□□ -0.76
LCB4Q12246 TIR3YIL011W 810 nt10.28□□□□□ -0.76
LCB4Q12246 PEX2YJL210W 816 nt10.26□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 RPL4BYDR012W 1089 nt10.24□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 RPL4AYBR031W 1089 nt10.24□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 FUR4YBR021W 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 PRO1YDR300C 1287 nt10.23□□□□□ -0.77
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