Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 YLR235CYLR235C 399 nt10.76□□□□□ -0.69
YLL054CQ12244 PTH1YHR189W 573 nt10.75□□□□□ -0.69
YLL054CQ12244 DIC1YLR348C 897 nt10.74□□□□□ -0.69
YLL054CQ12244 GID7YCL039W 2238 nt10.73□□□□□ -0.69
YLL054CQ12244 NPP1YCR026C 2229 nt10.72□□□□□ -0.69
YLL054CQ12244 YLL053CYLL053C 459 nt10.7□□□□□ -0.7
YLL054CQ12244 CSM2YIL132C 642 nt10.69□□□□□ -0.7
YLL054CQ12244 ERF2YLR246W 1080 nt10.68□□□□□ -0.7
YLL054CQ12244 LYS4YDR234W 2082 nt10.67□□□□□ -0.7
YLL054CQ12244 YKL030WYKL030W 606 nt10.65□□□□□ -0.7
YLL054CQ12244 TIM23YNR017W 669 nt10.64□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 FTR1YER145C 1215 nt10.63□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 GLK1YCL040W 1503 nt10.63□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 RTG1YOL067C 534 nt10.62□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 CRR1YLR213C 1269 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 YLR179CYLR179C 606 nt10.6□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 MRPL8YJL063C 717 nt10.59□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 AQY1YPR192W 918 nt10.59□□□□□ -0.71
YLL054CQ12244 GAL1YBR020W 1587 nt10.58□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 YFL067WYFL067W 528 nt10.58□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.57□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 YEL076CYEL076C 651 nt10.57□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 YLR464WYLR464W 651 nt10.57□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 TRM5YHR070W 1500 nt10.56□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 ATF2YGR177C 1608 nt10.55□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 DDR2YOL052C-A 186 nt10.55□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 ADO1YJR105W 1023 nt10.53□□□□□ -0.72
YLL054CQ12244 HEM12YDR047W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 FUR4YBR021W 1902 nt10.52□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 HUA1YGR268C 597 nt10.51□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 CYT2YKL087C 675 nt10.5□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 YPR064WYPR064W 420 nt10.5□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 PBP1YGR178C 2169 nt10.5□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.48□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 STB1YNL309W 1263 nt10.47□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 SNG1YGR197C 1644 nt10.47□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 AHT1YHR093W 549 nt10.46□□□□□ -0.73
YLL054CQ12244 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.45□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 SPC25YER018C 666 nt10.45□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 MIC10YCL057C-A 294 nt10.45□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 WSC2YNL283C 1512 nt10.44□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 HMG2YLR450W 3138 nt10.44□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 GPI16YHR188C 1833 nt10.44□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 ESBP6YNL125C 2022 nt10.43□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.42□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 TAD3YLR316C 969 nt10.41□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 AAC1YMR056C 930 nt10.41□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 ANP1YEL036C 1503 nt10.41□□□□□ -0.74
YLL054CQ12244 PRP4YPR178W 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 TPO4YOR273C 1980 nt10.39□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 FRE6YLL051C 2139 nt10.39□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 MAE1YKL029C 2010 nt10.38□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.38□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 CCT4YDL143W 1587 nt10.38□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 RAX1YOR301W 1308 nt10.37□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 FEN2YCR028C 1539 nt10.37□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 SWC5YBR231C 912 nt10.36□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 CCA1YER168C 1641 nt10.36□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 DPS1YLL018C 1674 nt10.35□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 BNA2YJR078W 1362 nt10.35□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 BIO5YNR056C 1686 nt10.34□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 VPS60YDR486C 690 nt10.34□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 PAU21YOR394W 495 nt10.34□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 PAU22YPL282C 495 nt10.34□□□□□ -0.75
YLL054CQ12244 ILV2YMR108W 2064 nt10.32□□□□□ -0.76
YLL054CQ12244 UGA4YDL210W 1716 nt10.32□□□□□ -0.76
YLL054CQ12244 ARO7YPR060C 771 nt10.28□□□□□ -0.76
YLL054CQ12244 ALG3YBL082C 1377 nt10.27□□□□□ -0.76
YLL054CQ12244 URA8YJR103W 1737 nt10.27□□□□□ -0.76
YLL054CQ12244 RIM8YGL045W 1629 nt10.27□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 YIR016WYIR016W 798 nt10.27□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 YLR415CYLR415C 339 nt10.26□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 NDI1YML120C 1542 nt10.25□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 SNF1YDR477W 1902 nt10.25□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 BSP1YPR171W 1731 nt10.24□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 GTB1YDR221W 2109 nt10.24□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 MIC12YBR262C 321 nt10.24□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 BDH1YAL060W 1149 nt10.23□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 BMT6YLR063W 1098 nt10.22□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 RFC1YOR217W 2586 nt10.22□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 DTR1YBR180W 1719 nt10.21□□□□□ -0.77
YLL054CQ12244 YKR005CYKR005C 1578 nt10.21□□□□□ -0.78
YLL054CQ12244 HHO1YPL127C 777 nt10.19□□□□□ -0.78
YLL054CQ12244 MET8YBR213W 825 nt10.19□□□□□ -0.78
YLL054CQ12244 UBX6YJL048C 1191 nt10.18□□□□□ -0.78
YLL054CQ12244 YGL114WYGL114W 2178 nt10.15□□□□□ -0.78
YLL054CQ12244 YGR201CYGR201C 678 nt10.15□□□□□ -0.78
YLL054CQ12244 YSP3YOR003W 1437 nt10.15□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 ACO2YJL200C 2370 nt10.11□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 PEX25YPL112C 1185 nt10.11□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 XDJ1YLR090W 1380 nt10.11□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 YDR094WYDR094W 336 nt10.1□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 YFR018CYFR018C 1092 nt10.1□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 TIM17YJL143W 477 nt10.1□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 GAL2YLR081W 1725 nt10.1□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 YNL115CYNL115C 1935 nt10.09□□□□□ -0.79
YLL054CQ12244 YGR259CYGR259C 441 nt10.08□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 GDH3YAL062W 1374 nt10.06□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 AGP1YCL025C 1902 nt10.06□□□□□ -0.8
YLL054CQ12244 SHM2YLR058C 1410 nt10.05□□□□□ -0.8
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