Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 ALG12YNR030W 1656 nt9.75□□□□□ -0.85
TIR4Q12218 Q0182Q0182 405 nt9.74□□□□□ -0.85
TIR4Q12218 ANP1YEL036C 1503 nt9.7□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.69□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 DDR2YOL052C-A 186 nt9.69□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 MCH5YOR306C 1566 nt9.67□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 PRP4YPR178W 1398 nt9.65□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.65□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 YEL076CYEL076C 651 nt9.65□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 YLR464WYLR464W 651 nt9.65□□□□□ -0.86
TIR4Q12218 AQY1YPR192W 918 nt9.64□□□□□ -0.87
TIR4Q12218 MIC12YBR262C 321 nt9.64□□□□□ -0.87
TIR4Q12218 AGP1YCL025C 1902 nt9.62□□□□□ -0.87
TIR4Q12218 DPS1YLL018C 1674 nt9.61□□□□□ -0.87
TIR4Q12218 SPC25YER018C 666 nt9.6□□□□□ -0.87
TIR4Q12218 STB1YNL309W 1263 nt9.59□□□□□ -0.87
TIR4Q12218 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.58□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 AAC1YMR056C 930 nt9.58□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 PTH1YHR189W 573 nt9.57□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 BNA2YJR078W 1362 nt9.57□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 YKR005CYKR005C 1578 nt9.56□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 FEN2YCR028C 1539 nt9.56□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 WSC2YNL283C 1512 nt9.56□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 TIM23YNR017W 669 nt9.55□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 SPP1YPL138C 1062 nt9.54□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 YLR235CYLR235C 399 nt9.53□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 SNF1YDR477W 1902 nt9.52□□□□□ -0.88
TIR4Q12218 GPI16YHR188C 1833 nt9.52□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 YLR179CYLR179C 606 nt9.51□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 YCL074WYCL074W 927 nt9.5□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 VPS60YDR486C 690 nt9.5□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 BIO5YNR056C 1686 nt9.49□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 YIR016WYIR016W 798 nt9.49□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 BMT6YLR063W 1098 nt9.49□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 AHT1YHR093W 549 nt9.48□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 HHO1YPL127C 777 nt9.48□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 XDJ1YLR090W 1380 nt9.48□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 ALG3YBL082C 1377 nt9.48□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 NAR1YNL240C 1476 nt9.47□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 CCT4YDL143W 1587 nt9.47□□□□□ -0.89
TIR4Q12218 DUS1YML080W 1272 nt9.46□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 YGR259CYGR259C 441 nt9.45□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 PBP1YGR178C 2169 nt9.42□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 YGR201CYGR201C 678 nt9.42□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.42□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.42□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 IRC24YIR036C 792 nt9.4□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 DUT1YBR252W 444 nt9.4□□□□□ -0.9
TIR4Q12218 STR3YGL184C 1398 nt9.38□□□□□ -0.91
TIR4Q12218 YKL030WYKL030W 606 nt9.38□□□□□ -0.91
TIR4Q12218 SWC5YBR231C 912 nt9.37□□□□□ -0.91
TIR4Q12218 CYT2YKL087C 675 nt9.35□□□□□ -0.91
TIR4Q12218 YPR064WYPR064W 420 nt9.34□□□□□ -0.91
TIR4Q12218 MOT3YMR070W 1473 nt9.34□□□□□ -0.91
TIR4Q12218 TAD3YLR316C 969 nt9.3□□□□□ -0.92
TIR4Q12218 AVT6YER119C 1347 nt9.27□□□□□ -0.93
TIR4Q12218 BDH1YAL060W 1149 nt9.25□□□□□ -0.93
TIR4Q12218 GDH3YAL062W 1374 nt9.24□□□□□ -0.93
TIR4Q12218 RTN2YDL204W 1182 nt9.24□□□□□ -0.93
TIR4Q12218 AQY2YLL052C 450 nt9.24□□□□□ -0.93
TIR4Q12218 GOR1YNL274C 1053 nt9.23□□□□□ -0.93
TIR4Q12218 RTG1YOL067C 534 nt9.2□□□□□ -0.94
TIR4Q12218 SHM2YLR058C 1410 nt9.2□□□□□ -0.94
TIR4Q12218 YLR415CYLR415C 339 nt9.16□□□□□ -0.94
TIR4Q12218 YAT1YAR035W 2064 nt9.15□□□□□ -0.94
TIR4Q12218 DAT1YML113W 747 nt9.14□□□□□ -0.95
TIR4Q12218 NIT1YIL164C 600 nt9.13□□□□□ -0.95
TIR4Q12218 YSP3YOR003W 1437 nt9.13□□□□□ -0.95
TIR4Q12218 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.11□□□□□ -0.95
TIR4Q12218 TIM17YJL143W 477 nt9.1□□□□□ -0.95
TIR4Q12218 NBP35YGL091C 987 nt9.09□□□□□ -0.95
TIR4Q12218 PLB1YMR008C 1995 nt9.08□□□□□ -0.96
TIR4Q12218 CMP2YML057W 1815 nt9.08□□□□□ -0.96
TIR4Q12218 ARP6YLR085C 1317 nt9.07□□□□□ -0.96
TIR4Q12218 HSL7YBR133C 2484 nt9.05□□□□□ -0.96
TIR4Q12218 SGT2YOR007C 1041 nt9.03□□□□□ -0.96
TIR4Q12218 YCR102CYCR102C 1107 nt9.02□□□□□ -0.97
TIR4Q12218 HIF1YLL022C 1158 nt9.02□□□□□ -0.97
TIR4Q12218 NDI1YML120C 1542 nt9.01□□□□□ -0.97
TIR4Q12218 PRM5YIL117C 957 nt9.01□□□□□ -0.97
TIR4Q12218 YNL115CYNL115C 1935 nt8.97□□□□□ -0.97
TIR4Q12218 ALD4YOR374W 1560 nt8.97□□□□□ -0.97
TIR4Q12218 HUA1YGR268C 597 nt8.95□□□□□ -0.98
TIR4Q12218 PEX25YPL112C 1185 nt8.94□□□□□ -0.98
TIR4Q12218 UTR1YJR049C 1593 nt8.94□□□□□ -0.98
TIR4Q12218 RPC82YPR190C 1965 nt8.93□□□□□ -0.98
TIR4Q12218 SPT20YOL148C 1815 nt8.92□□□□□ -0.98
TIR4Q12218 SHH4YLR164W 507 nt8.9□□□□□ -0.98
TIR4Q12218 TIR3YIL011W 810 nt8.89□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 VPS75YNL246W 795 nt8.89□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.88□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.88□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 LSC2YGR244C 1284 nt8.88□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 INA1YLR413W 2028 nt8.88□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 GAP1YKR039W 1809 nt8.87□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 YFL066CYFL066C 1179 nt8.86□□□□□ -0.99
TIR4Q12218 PRO1YDR300C 1287 nt8.83□□□□□ -1
TIR4Q12218 MRPL8YJL063C 717 nt8.81□□□□□ -1
TIR4Q12218 POM34YLR018C 900 nt8.81□□□□□ -1
TIR4Q12218 ZRT3YKL175W 1512 nt8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 281.7 ms