Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 BIO5YNR056C 1686 nt10.42□□□□□ -0.74
NFI1Q12216 YIH1YCR059C 777 nt10.39□□□□□ -0.75
NFI1Q12216 YLL053CYLL053C 459 nt10.36□□□□□ -0.75
NFI1Q12216 ERF2YLR246W 1080 nt10.36□□□□□ -0.75
NFI1Q12216 RNQ1YCL028W 1218 nt10.35□□□□□ -0.75
NFI1Q12216 CRR1YLR213C 1269 nt10.34□□□□□ -0.75
NFI1Q12216 HMG2YLR450W 3138 nt10.33□□□□□ -0.76
NFI1Q12216 MAE1YKL029C 2010 nt10.31□□□□□ -0.76
NFI1Q12216 TPO4YOR273C 1980 nt10.3□□□□□ -0.76
NFI1Q12216 PRP4YPR178W 1398 nt10.29□□□□□ -0.76
NFI1Q12216 ATF2YGR177C 1608 nt10.29□□□□□ -0.76
NFI1Q12216 FRE6YLL051C 2139 nt10.28□□□□□ -0.76
NFI1Q12216 DIC1YLR348C 897 nt10.27□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 FUR4YBR021W 1902 nt10.27□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 MIC10YCL057C-A 294 nt10.26□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 RIM8YGL045W 1629 nt10.25□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 HEM12YDR047W 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 FTR1YER145C 1215 nt10.25□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 DPS1YLL018C 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.24□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 TRM5YHR070W 1500 nt10.23□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 GAL1YBR020W 1587 nt10.22□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 SNG1YGR197C 1644 nt10.22□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 ESBP6YNL125C 2022 nt10.22□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 NDI1YML120C 1542 nt10.22□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.21□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 YEL076CYEL076C 651 nt10.21□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 YFL067WYFL067W 528 nt10.21□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 YLR464WYLR464W 651 nt10.21□□□□□ -0.77
NFI1Q12216 UGA4YDL210W 1716 nt10.21□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 SNF1YDR477W 1902 nt10.2□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 SPP1YPL138C 1062 nt10.2□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 PTH1YHR189W 573 nt10.18□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 URA8YJR103W 1737 nt10.17□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 DDR2YOL052C-A 186 nt10.17□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 RAX1YOR301W 1308 nt10.15□□□□□ -0.78
NFI1Q12216 CCA1YER168C 1641 nt10.12□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.12□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 YGL114WYGL114W 2178 nt10.11□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 YLR235CYLR235C 399 nt10.1□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 GTB1YDR221W 2109 nt10.1□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 ANP1YEL036C 1503 nt10.09□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 TIM23YNR017W 669 nt10.09□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 AQY1YPR192W 918 nt10.09□□□□□ -0.79
NFI1Q12216 ILV2YMR108W 2064 nt10.08□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 YLR179CYLR179C 606 nt10.07□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 ACO2YJL200C 2370 nt10.06□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.05□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 STB1YNL309W 1263 nt10.05□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 RFC1YOR217W 2586 nt10.04□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 GPI16YHR188C 1833 nt10.04□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 SPT20YOL148C 1815 nt10.04□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 SPC25YER018C 666 nt10.03□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 BNA2YJR078W 1362 nt10.02□□□□□ -0.8
NFI1Q12216 FEN2YCR028C 1539 nt10.02□□□□□ -0.81
NFI1Q12216 DTR1YBR180W 1719 nt9.99□□□□□ -0.81
NFI1Q12216 BMT6YLR063W 1098 nt9.99□□□□□ -0.81
NFI1Q12216 WSC2YNL283C 1512 nt9.98□□□□□ -0.81
NFI1Q12216 YKL030WYKL030W 606 nt9.98□□□□□ -0.81
NFI1Q12216 MIC12YBR262C 321 nt9.98□□□□□ -0.81
NFI1Q12216 VPS60YDR486C 690 nt9.96□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 AHT1YHR093W 549 nt9.96□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 AGP1YCL025C 1902 nt9.95□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 CCT4YDL143W 1587 nt9.94□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 YIR016WYIR016W 798 nt9.93□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 ALG3YBL082C 1377 nt9.91□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 BSP1YPR171W 1731 nt9.9□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 HHO1YPL127C 777 nt9.9□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 YPR064WYPR064W 420 nt9.9□□□□□ -0.82
NFI1Q12216 GAL2YLR081W 1725 nt9.9□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 SWC5YBR231C 912 nt9.89□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 DUS1YML080W 1272 nt9.88□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 MUP1YGR055W 1725 nt9.87□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 THI72YOR192C 1800 nt9.87□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 YKR005CYKR005C 1578 nt9.87□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 UBX6YJL048C 1191 nt9.85□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 TOK1YJL093C 2076 nt9.85□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 TAD3YLR316C 969 nt9.84□□□□□ -0.83
NFI1Q12216 YCL074WYCL074W 927 nt9.82□□□□□ -0.84
NFI1Q12216 RTG1YOL067C 534 nt9.82□□□□□ -0.84
NFI1Q12216 YGR201CYGR201C 678 nt9.81□□□□□ -0.84
NFI1Q12216 RPC82YPR190C 1965 nt9.81□□□□□ -0.84
NFI1Q12216 XDJ1YLR090W 1380 nt9.79□□□□□ -0.84
NFI1Q12216 IRC24YIR036C 792 nt9.78□□□□□ -0.84
NFI1Q12216 DUT1YBR252W 444 nt9.77□□□□□ -0.85
NFI1Q12216 BDH1YAL060W 1149 nt9.74□□□□□ -0.85
NFI1Q12216 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.74□□□□□ -0.85
NFI1Q12216 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.74□□□□□ -0.85
NFI1Q12216 YGR259CYGR259C 441 nt9.72□□□□□ -0.85
NFI1Q12216 AVT6YER119C 1347 nt9.71□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 STR3YGL184C 1398 nt9.71□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 GDH3YAL062W 1374 nt9.71□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.69□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 YLR415CYLR415C 339 nt9.69□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 GOR1YNL274C 1053 nt9.68□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 YHL008CYHL008C 1884 nt9.68□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 INA1YLR413W 2028 nt9.66□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 NRT1YOR071C 1797 nt9.65□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 AQY2YLL052C 450 nt9.65□□□□□ -0.86
NFI1Q12216 SHM2YLR058C 1410 nt9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms