Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 TRM5YHR070W 1500 nt10.58□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 ERF2YLR246W 1080 nt10.57□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 ATF2YGR177C 1608 nt10.57□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 CRR1YLR213C 1269 nt10.56□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 YPR064WYPR064W 420 nt10.56□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 AQY1YPR192W 918 nt10.55□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 SPT8YLR055C 1809 nt10.55□□□□□ -0.72
HAL9Q12180 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.51□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 TAD3YLR316C 969 nt10.51□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 YFL067WYFL067W 528 nt10.5□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 NME1NME1 340 nt10.49□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 BOR1YNL275W 1731 nt10.49□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 SPC25YER018C 666 nt10.48□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 STB1YNL309W 1263 nt10.48□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 DDR2YOL052C-A 186 nt10.48□□□□□ -0.73
HAL9Q12180 SNG1YGR197C 1644 nt10.44□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.44□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.44□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 MIC10YCL057C-A 294 nt10.44□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 HEM12YDR047W 1089 nt10.43□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 CCT4YDL143W 1587 nt10.42□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 ANP1YEL036C 1503 nt10.42□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 GPI16YHR188C 1833 nt10.4□□□□□ -0.74
HAL9Q12180 VPS60YDR486C 690 nt10.39□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 BDH1YAL060W 1149 nt10.39□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 YFR018CYFR018C 1092 nt10.38□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 FEN2YCR028C 1539 nt10.38□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.35□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 SWE1YJL187C 2460 nt10.35□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 ALG3YBL082C 1377 nt10.35□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.34□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.34□□□□□ -0.75
HAL9Q12180 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.33□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 YSP3YOR003W 1437 nt10.33□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 SWC5YBR231C 912 nt10.32□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 PRE6YOL038W 765 nt10.31□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 YLR415CYLR415C 339 nt10.3□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 PAU16YKL224C 372 nt10.29□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 RRT5YFR032C 870 nt10.28□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 YIR016WYIR016W 798 nt10.28□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 PEX25YPL112C 1185 nt10.28□□□□□ -0.76
HAL9Q12180 YFL066CYFL066C 1179 nt10.27□□□□□ -0.77
HAL9Q12180 HSP60YLR259C 1719 nt10.27□□□□□ -0.77
HAL9Q12180 YNL115CYNL115C 1935 nt10.25□□□□□ -0.77
HAL9Q12180 MCH5YOR306C 1566 nt10.24□□□□□ -0.77
HAL9Q12180 RAX1YOR301W 1308 nt10.23□□□□□ -0.77
HAL9Q12180 MIC12YBR262C 321 nt10.21□□□□□ -0.77
HAL9Q12180 BNA2YJR078W 1362 nt10.19□□□□□ -0.78
HAL9Q12180 GLK1YCL040W 1503 nt10.14□□□□□ -0.79
HAL9Q12180 ALG12YNR030W 1656 nt10.13□□□□□ -0.79
HAL9Q12180 XDJ1YLR090W 1380 nt10.11□□□□□ -0.79
HAL9Q12180 RPM1RPM1 483 nt10.1□□□□□ -0.79
HAL9Q12180 VPS75YNL246W 795 nt10.1□□□□□ -0.79
HAL9Q12180 CCA1YER168C 1641 nt10.09□□□□□ -0.79
HAL9Q12180 SHM2YLR058C 1410 nt10.08□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 TIM17YJL143W 477 nt10.08□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 HHO1YPL127C 777 nt10.08□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 YGR201CYGR201C 678 nt10.07□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 FRE6YLL051C 2139 nt10.07□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 FUR4YBR021W 1902 nt10.07□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 AGP1YCL025C 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 GDH3YAL062W 1374 nt10.03□□□□□ -0.8
HAL9Q12180 NIT1YIL164C 600 nt10.02□□□□□ -0.81
HAL9Q12180 NAT4YMR069W 858 nt10.02□□□□□ -0.81
HAL9Q12180 MIR1YJR077C 936 nt10.01□□□□□ -0.81
HAL9Q12180 SBA1YKL117W 651 nt9.98□□□□□ -0.81
HAL9Q12180 SGT2YOR007C 1041 nt9.98□□□□□ -0.81
HAL9Q12180 DUT1YBR252W 444 nt9.96□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 AVT6YER119C 1347 nt9.95□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 MSF1YPR047W 1410 nt9.94□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 THI74YDR438W 1113 nt9.94□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 PRP4YPR178W 1398 nt9.93□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 PAU7YAR020C 168 nt9.92□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 DAT1YML113W 747 nt9.9□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 GOR1YNL274C 1053 nt9.9□□□□□ -0.82
HAL9Q12180 YGR139WYGR139W 339 nt9.89□□□□□ -0.83
HAL9Q12180 AAC1YMR056C 930 nt9.89□□□□□ -0.83
HAL9Q12180 DPS1YLL018C 1674 nt9.89□□□□□ -0.83
HAL9Q12180 SHB17YKR043C 816 nt9.88□□□□□ -0.83
HAL9Q12180 YDR010CYDR010C 333 nt9.87□□□□□ -0.83
HAL9Q12180 UBA4YHR111W 1323 nt9.84□□□□□ -0.83
HAL9Q12180 DUS1YML080W 1272 nt9.83□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 NAR1YNL240C 1476 nt9.82□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 YCR102CYCR102C 1107 nt9.8□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 STR3YGL184C 1398 nt9.79□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 YKR005CYKR005C 1578 nt9.79□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 YCL074WYCL074W 927 nt9.78□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 BMT6YLR063W 1098 nt9.78□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 RET2YFR051C 1641 nt9.78□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 BIO5YNR056C 1686 nt9.77□□□□□ -0.84
HAL9Q12180 SNF1YDR477W 1902 nt9.76□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 YGL034CYGL034C 366 nt9.76□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 YSR3YKR053C 1215 nt9.76□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 NBP35YGL091C 987 nt9.75□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 PHO89YBR296C 1725 nt9.73□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 PBP1YGR178C 2169 nt9.73□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 AQY2YLL052C 450 nt9.72□□□□□ -0.85
HAL9Q12180 XYL2YLR070C 1071 nt9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 137.4 ms