Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 AQY1YPR192W 918 nt10.56□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 HUA1YGR268C 597 nt10.54□□□□□ -0.72
NMD4Q12129 YPR064WYPR064W 420 nt10.52□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 HEM12YDR047W 1089 nt10.51□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.48□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 AHT1YHR093W 549 nt10.47□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 STB1YNL309W 1263 nt10.47□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 SNG1YGR197C 1644 nt10.47□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.46□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 MIC10YCL057C-A 294 nt10.46□□□□□ -0.73
NMD4Q12129 WSC2YNL283C 1512 nt10.46□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 SPC25YER018C 666 nt10.44□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 TAD3YLR316C 969 nt10.43□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 GPI16YHR188C 1833 nt10.42□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 SPT8YLR055C 1809 nt10.42□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 ANP1YEL036C 1503 nt10.41□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.4□□□□□ -0.74
NMD4Q12129 CCT4YDL143W 1587 nt10.39□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 FEN2YCR028C 1539 nt10.38□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.38□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.38□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 SWC5YBR231C 912 nt10.36□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 RAX1YOR301W 1308 nt10.35□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 VPS60YDR486C 690 nt10.35□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 BNA2YJR078W 1362 nt10.35□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 UME6YDR207C 2511 nt10.34□□□□□ -0.75
NMD4Q12129 BOR1YNL275W 1731 nt10.3□□□□□ -0.76
NMD4Q12129 SWE1YJL187C 2460 nt10.29□□□□□ -0.76
NMD4Q12129 YIR016WYIR016W 798 nt10.29□□□□□ -0.76
NMD4Q12129 ALG3YBL082C 1377 nt10.28□□□□□ -0.76
NMD4Q12129 YLR415CYLR415C 339 nt10.26□□□□□ -0.77
NMD4Q12129 BDH1YAL060W 1149 nt10.24□□□□□ -0.77
NMD4Q12129 MIC12YBR262C 321 nt10.22□□□□□ -0.77
NMD4Q12129 HHO1YPL127C 777 nt10.19□□□□□ -0.78
NMD4Q12129 CCA1YER168C 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
NMD4Q12129 YSP3YOR003W 1437 nt10.16□□□□□ -0.78
NMD4Q12129 YDR094WYDR094W 336 nt10.14□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 YFR018CYFR018C 1092 nt10.12□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 YGR201CYGR201C 678 nt10.12□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 PEX25YPL112C 1185 nt10.12□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 YNL115CYNL115C 1935 nt10.11□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 XDJ1YLR090W 1380 nt10.11□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 TIM17YJL143W 477 nt10.1□□□□□ -0.79
NMD4Q12129 YFL066CYFL066C 1179 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 GDH3YAL062W 1374 nt10.08□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 UBX6YJL048C 1191 nt10.07□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 SHM2YLR058C 1410 nt10.06□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 AGP1YCL025C 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 RRT5YFR032C 870 nt10.04□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 DUS1YML080W 1272 nt10.03□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 AVT6YER119C 1347 nt10.03□□□□□ -0.8
NMD4Q12129 GOR1YNL274C 1053 nt10.02□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 PRE6YOL038W 765 nt10.02□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 VPS75YNL246W 795 nt10.01□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 HSP60YLR259C 1719 nt9.99□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 FUR4YBR021W 1902 nt9.98□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 MCH5YOR306C 1566 nt9.98□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 ALG12YNR030W 1656 nt9.97□□□□□ -0.81
NMD4Q12129 YCL074WYCL074W 927 nt9.94□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 PAU16YKL224C 372 nt9.94□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 DUT1YBR252W 444 nt9.94□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 NIT1YIL164C 600 nt9.93□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 SGT2YOR007C 1041 nt9.93□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 PAU7YAR020C 168 nt9.92□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 GLK1YCL040W 1503 nt9.92□□□□□ -0.82
NMD4Q12129 DAT1YML113W 747 nt9.87□□□□□ -0.83
NMD4Q12129 AQY2YLL052C 450 nt9.86□□□□□ -0.83
NMD4Q12129 STR3YGL184C 1398 nt9.86□□□□□ -0.83
NMD4Q12129 YCR102CYCR102C 1107 nt9.85□□□□□ -0.83
NMD4Q12129 RPM1RPM1 483 nt9.83□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.82□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.82□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 MIR1YJR077C 936 nt9.81□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 PRP4YPR178W 1398 nt9.8□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 NAT4YMR069W 858 nt9.79□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 YKR005CYKR005C 1578 nt9.78□□□□□ -0.84
NMD4Q12129 THI74YDR438W 1113 nt9.77□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 SHB17YKR043C 816 nt9.77□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 FRE6YLL051C 2139 nt9.76□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 BMT6YLR063W 1098 nt9.76□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 YGR259CYGR259C 441 nt9.75□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 NBP35YGL091C 987 nt9.74□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 DPS1YLL018C 1674 nt9.74□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.73□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 YDR010CYDR010C 333 nt9.72□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 UBA4YHR111W 1323 nt9.72□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 MSF1YPR047W 1410 nt9.72□□□□□ -0.85
NMD4Q12129 RTN2YDL204W 1182 nt9.7□□□□□ -0.86
NMD4Q12129 YSR3YKR053C 1215 nt9.68□□□□□ -0.86
NMD4Q12129 RET2YFR051C 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
NMD4Q12129 TIR3YIL011W 810 nt9.66□□□□□ -0.86
NMD4Q12129 AAC1YMR056C 930 nt9.66□□□□□ -0.86
NMD4Q12129 PHO89YBR296C 1725 nt9.65□□□□□ -0.86
NMD4Q12129 NAR1YNL240C 1476 nt9.64□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.61□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 ARP6YLR085C 1317 nt9.6□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 YCR087WYCR087W 516 nt9.6□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 YGL034CYGL034C 366 nt9.6□□□□□ -0.87
NMD4Q12129 LSC2YGR244C 1284 nt9.6□□□□□ -0.87
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