Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 TAD3YLR316C 969 nt11.5□□□□□ -0.57
VPS54Q12071 LYS4YDR234W 2082 nt11.49□□□□□ -0.57
VPS54Q12071 AQY1YPR192W 918 nt11.49□□□□□ -0.57
VPS54Q12071 CRR1YLR213C 1269 nt11.47□□□□□ -0.57
VPS54Q12071 YFL067WYFL067W 528 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS54Q12071 STB1YNL309W 1263 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS54Q12071 DDR2YOL052C-A 186 nt11.44□□□□□ -0.58
VPS54Q12071 PTK1YKL198C 1989 nt11.42□□□□□ -0.58
VPS54Q12071 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.41□□□□□ -0.58
VPS54Q12071 SPC25YER018C 666 nt11.41□□□□□ -0.58
VPS54Q12071 CCT4YDL143W 1587 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 MIC10YCL057C-A 294 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 SNG1YGR197C 1644 nt11.38□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 HEM12YDR047W 1089 nt11.36□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 GPI16YHR188C 1833 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 YFR018CYFR018C 1092 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 BDH1YAL060W 1149 nt11.35□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 VPS60YDR486C 690 nt11.34□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 ANP1YEL036C 1503 nt11.34□□□□□ -0.59
VPS54Q12071 PRE6YOL038W 765 nt11.33□□□□□ -0.6
VPS54Q12071 FEN2YCR028C 1539 nt11.32□□□□□ -0.6
VPS54Q12071 ALG3YBL082C 1377 nt11.3□□□□□ -0.6
VPS54Q12071 YSP3YOR003W 1437 nt11.29□□□□□ -0.6
VPS54Q12071 YFL066CYFL066C 1179 nt11.29□□□□□ -0.6
VPS54Q12071 SWC5YBR231C 912 nt11.29□□□□□ -0.6
VPS54Q12071 YLR415CYLR415C 339 nt11.27□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 PAU16YKL224C 372 nt11.26□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 PEX25YPL112C 1185 nt11.25□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.24□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 YFL054CYFL054C 1941 nt11.23□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 YNL115CYNL115C 1935 nt11.23□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 RRT5YFR032C 870 nt11.21□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.21□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 YIR016WYIR016W 798 nt11.21□□□□□ -0.61
VPS54Q12071 YJL225CYJL225C 5277 nt11.16□□□□□ -0.62
VPS54Q12071 SPT8YLR055C 1809 nt11.13□□□□□ -0.63
VPS54Q12071 RAX1YOR301W 1308 nt11.11□□□□□ -0.63
VPS54Q12071 BNA2YJR078W 1362 nt11.11□□□□□ -0.63
VPS54Q12071 MIC12YBR262C 321 nt11.09□□□□□ -0.63
VPS54Q12071 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
VPS54Q12071 VPS75YNL246W 795 nt11.04□□□□□ -0.64
VPS54Q12071 XDJ1YLR090W 1380 nt11.03□□□□□ -0.64
VPS54Q12071 SHM2YLR058C 1410 nt11.02□□□□□ -0.64
VPS54Q12071 TIM17YJL143W 477 nt11.01□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 HHO1YPL127C 777 nt11□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 BOR1YNL275W 1731 nt11□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 SWE1YJL187C 2460 nt10.99□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 MIR1YJR077C 936 nt10.97□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 GDH3YAL062W 1374 nt10.97□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 CCA1YER168C 1641 nt10.96□□□□□ -0.65
VPS54Q12071 YGR201CYGR201C 678 nt10.94□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 NAT4YMR069W 858 nt10.94□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 GLK1YCL040W 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 NIT1YIL164C 600 nt10.93□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 AGP1YCL025C 1902 nt10.92□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 THI74YDR438W 1113 nt10.9□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 SGT2YOR007C 1041 nt10.9□□□□□ -0.66
VPS54Q12071 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.89□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.89□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 PAU7YAR020C 168 nt10.89□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 MSF1YPR047W 1410 nt10.88□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 AVT6YER119C 1347 nt10.87□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 DUT1YBR252W 444 nt10.87□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 SBA1YKL117W 651 nt10.85□□□□□ -0.67
VPS54Q12071 SHB17YKR043C 816 nt10.83□□□□□ -0.68
VPS54Q12071 DAT1YML113W 747 nt10.82□□□□□ -0.68
VPS54Q12071 GOR1YNL274C 1053 nt10.81□□□□□ -0.68
VPS54Q12071 YDR010CYDR010C 333 nt10.8□□□□□ -0.68
VPS54Q12071 UBA4YHR111W 1323 nt10.8□□□□□ -0.68
VPS54Q12071 DUS1YML080W 1272 nt10.73□□□□□ -0.69
VPS54Q12071 YSR3YKR053C 1215 nt10.72□□□□□ -0.69
VPS54Q12071 YGL034CYGL034C 366 nt10.71□□□□□ -0.69
VPS54Q12071 YCR102CYCR102C 1107 nt10.69□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 RET2YFR051C 1641 nt10.69□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 MCH5YOR306C 1566 nt10.69□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 XYL2YLR070C 1071 nt10.68□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 PHO89YBR296C 1725 nt10.67□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 STR3YGL184C 1398 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS54Q12071 FUR4YBR021W 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS54Q12071 YCL074WYCL074W 927 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS54Q12071 NBP35YGL091C 987 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS54Q12071 AQY2YLL052C 450 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS54Q12071 SFA1YDL168W 1161 nt10.6□□□□□ -0.71
VPS54Q12071 RBG1YAL036C 1110 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 SHH4YLR164W 507 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 ALG12YNR030W 1656 nt10.57□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 YCR087WYCR087W 516 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 COQ2YNR041C 1119 nt10.56□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 NDI1YML120C 1542 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 HSP60YLR259C 1719 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 AIM45YPR004C 1035 nt10.54□□□□□ -0.72
VPS54Q12071 MRP20YDR405W 792 nt10.52□□□□□ -0.73
VPS54Q12071 TIR3YIL011W 810 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS54Q12071 YMR244WYMR244W 1068 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS54Q12071 GLR1YPL091W 1452 nt10.49□□□□□ -0.73
VPS54Q12071 TOM6YOR045W 186 nt10.46□□□□□ -0.73
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