Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.69□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 WSC2YNL283C 1512 nt9.69□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.69□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.69□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 TAD3YLR316C 969 nt9.68□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 STB1YNL309W 1263 nt9.68□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.66□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.66□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 YJL225CYJL225C 5277 nt9.65□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 SPC25YER018C 666 nt9.65□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 GPI16YHR188C 1833 nt9.65□□□□□ -0.86
NIP7Q08962 YFL054CYFL054C 1941 nt9.64□□□□□ -0.87
NIP7Q08962 SNG1YGR197C 1644 nt9.64□□□□□ -0.87
NIP7Q08962 MIC10YCL057C-A 294 nt9.61□□□□□ -0.87
NIP7Q08962 CCT4YDL143W 1587 nt9.61□□□□□ -0.87
NIP7Q08962 SWC5YBR231C 912 nt9.6□□□□□ -0.87
NIP7Q08962 ANP1YEL036C 1503 nt9.6□□□□□ -0.87
NIP7Q08962 FEN2YCR028C 1539 nt9.58□□□□□ -0.88
NIP7Q08962 VPS60YDR486C 690 nt9.57□□□□□ -0.88
NIP7Q08962 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.57□□□□□ -0.88
NIP7Q08962 BNA2YJR078W 1362 nt9.54□□□□□ -0.88
NIP7Q08962 YLR415CYLR415C 339 nt9.53□□□□□ -0.88
NIP7Q08962 RAX1YOR301W 1308 nt9.53□□□□□ -0.88
NIP7Q08962 YDR094WYDR094W 336 nt9.52□□□□□ -0.89
NIP7Q08962 SPT8YLR055C 1809 nt9.52□□□□□ -0.89
NIP7Q08962 BDH1YAL060W 1149 nt9.5□□□□□ -0.89
NIP7Q08962 YIR016WYIR016W 798 nt9.49□□□□□ -0.89
NIP7Q08962 ALG3YBL082C 1377 nt9.49□□□□□ -0.89
NIP7Q08962 UBX6YJL048C 1191 nt9.48□□□□□ -0.89
NIP7Q08962 YFR018CYFR018C 1092 nt9.45□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 YSP3YOR003W 1437 nt9.44□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 PEX25YPL112C 1185 nt9.43□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 MIC12YBR262C 321 nt9.42□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 Q0182Q0182 405 nt9.41□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 SWE1YJL187C 2460 nt9.4□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 RRT5YFR032C 870 nt9.4□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 YNL115CYNL115C 1935 nt9.4□□□□□ -0.9
NIP7Q08962 PAC11YDR488C 1602 nt9.38□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 NVJ2YPR091C 2313 nt9.38□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 HHO1YPL127C 777 nt9.38□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 YFL066CYFL066C 1179 nt9.36□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 TIM17YJL143W 477 nt9.36□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 YGR201CYGR201C 678 nt9.35□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 XDJ1YLR090W 1380 nt9.35□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 PRE6YOL038W 765 nt9.34□□□□□ -0.91
NIP7Q08962 CCA1YER168C 1641 nt9.33□□□□□ -0.92
NIP7Q08962 PAU16YKL224C 372 nt9.31□□□□□ -0.92
NIP7Q08962 VPS75YNL246W 795 nt9.31□□□□□ -0.92
NIP7Q08962 GDH3YAL062W 1374 nt9.3□□□□□ -0.92
NIP7Q08962 SHM2YLR058C 1410 nt9.3□□□□□ -0.92
NIP7Q08962 AVT6YER119C 1347 nt9.26□□□□□ -0.93
NIP7Q08962 PAU7YAR020C 168 nt9.24□□□□□ -0.93
NIP7Q08962 GOR1YNL274C 1053 nt9.24□□□□□ -0.93
NIP7Q08962 DUS1YML080W 1272 nt9.23□□□□□ -0.93
NIP7Q08962 AGP1YCL025C 1902 nt9.22□□□□□ -0.93
NIP7Q08962 GLK1YCL040W 1503 nt9.21□□□□□ -0.94
NIP7Q08962 SGT2YOR007C 1041 nt9.19□□□□□ -0.94
NIP7Q08962 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.17□□□□□ -0.94
NIP7Q08962 NIT1YIL164C 600 nt9.17□□□□□ -0.94
NIP7Q08962 NAT4YMR069W 858 nt9.17□□□□□ -0.94
NIP7Q08962 MIR1YJR077C 936 nt9.14□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 DAT1YML113W 747 nt9.13□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 DUT1YBR252W 444 nt9.13□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 YCL074WYCL074W 927 nt9.12□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 THI74YDR438W 1113 nt9.12□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 FUR4YBR021W 1902 nt9.11□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 YCR102CYCR102C 1107 nt9.1□□□□□ -0.95
NIP7Q08962 MSF1YPR047W 1410 nt9.08□□□□□ -0.96
NIP7Q08962 SHB17YKR043C 816 nt9.08□□□□□ -0.96
NIP7Q08962 AQY2YLL052C 450 nt9.07□□□□□ -0.96
NIP7Q08962 UBA4YHR111W 1323 nt9.05□□□□□ -0.96
NIP7Q08962 STR3YGL184C 1398 nt9.04□□□□□ -0.96
NIP7Q08962 YDR010CYDR010C 333 nt9.02□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 YSR3YKR053C 1215 nt9.01□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 HSP60YLR259C 1719 nt9.01□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 BOR1YNL275W 1731 nt9□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 RET2YFR051C 1641 nt8.99□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 PHO89YBR296C 1725 nt8.98□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 NBP35YGL091C 987 nt8.98□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 YCR087WYCR087W 516 nt8.97□□□□□ -0.97
NIP7Q08962 YGL034CYGL034C 366 nt8.95□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 PRP4YPR178W 1398 nt8.95□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 BMT6YLR063W 1098 nt8.94□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 YKR005CYKR005C 1578 nt8.94□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 RTN2YDL204W 1182 nt8.93□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 TIR3YIL011W 810 nt8.93□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 YGR259CYGR259C 441 nt8.92□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.91□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 XYL2YLR070C 1071 nt8.91□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 MRP20YDR405W 792 nt8.9□□□□□ -0.98
NIP7Q08962 SFA1YDL168W 1161 nt8.88□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 LSC2YGR244C 1284 nt8.87□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 DPS1YLL018C 1674 nt8.87□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 AIM45YPR004C 1035 nt8.86□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 SHH4YLR164W 507 nt8.85□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 COQ2YNR041C 1119 nt8.85□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 ARP6YLR085C 1317 nt8.84□□□□□ -0.99
NIP7Q08962 RBG1YAL036C 1110 nt8.84□□□□□ -0.99
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