Protein–RNA interactions for Protein: Q08957

AFT2, Iron-regulated transcriptional activator AFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFT2Q08957 AQY1YPR192W 918 nt12.08□□□□□ -0.48
AFT2Q08957 ANP1YEL036C 1503 nt12.06□□□□□ -0.48
AFT2Q08957 AHT1YHR093W 549 nt12.05□□□□□ -0.48
AFT2Q08957 STB1YNL309W 1263 nt12.05□□□□□ -0.48
AFT2Q08957 SPC25YER018C 666 nt12.04□□□□□ -0.48
AFT2Q08957 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.02□□□□□ -0.49
AFT2Q08957 RAX1YOR301W 1308 nt11.98□□□□□ -0.49
AFT2Q08957 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.98□□□□□ -0.49
AFT2Q08957 YEL076CYEL076C 651 nt11.98□□□□□ -0.49
AFT2Q08957 YLR464WYLR464W 651 nt11.98□□□□□ -0.49
AFT2Q08957 FEN2YCR028C 1539 nt11.97□□□□□ -0.49
AFT2Q08957 YPR064WYPR064W 420 nt11.95□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 GPI16YHR188C 1833 nt11.95□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 CCT4YDL143W 1587 nt11.94□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 VPS60YDR486C 690 nt11.94□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 CCA1YER168C 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 ALG3YBL082C 1377 nt11.92□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 TAD3YLR316C 969 nt11.9□□□□□ -0.5
AFT2Q08957 MRPL8YJL063C 717 nt11.89□□□□□ -0.51
AFT2Q08957 MIC12YBR262C 321 nt11.89□□□□□ -0.51
AFT2Q08957 YIR016WYIR016W 798 nt11.87□□□□□ -0.51
AFT2Q08957 NVJ2YPR091C 2313 nt11.87□□□□□ -0.51
AFT2Q08957 HUA1YGR268C 597 nt11.84□□□□□ -0.51
AFT2Q08957 BNA2YJR078W 1362 nt11.83□□□□□ -0.52
AFT2Q08957 SWC5YBR231C 912 nt11.82□□□□□ -0.52
AFT2Q08957 AGP1YCL025C 1902 nt11.82□□□□□ -0.52
AFT2Q08957 BDH1YAL060W 1149 nt11.81□□□□□ -0.52
AFT2Q08957 ADO1YJR105W 1023 nt11.79□□□□□ -0.52
AFT2Q08957 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.78□□□□□ -0.52
AFT2Q08957 FUR4YBR021W 1902 nt11.74□□□□□ -0.53
AFT2Q08957 HHO1YPL127C 777 nt11.73□□□□□ -0.53
AFT2Q08957 HSP60YLR259C 1719 nt11.72□□□□□ -0.53
AFT2Q08957 BOR1YNL275W 1731 nt11.71□□□□□ -0.54
AFT2Q08957 YSP3YOR003W 1437 nt11.7□□□□□ -0.54
AFT2Q08957 YLR415CYLR415C 339 nt11.69□□□□□ -0.54
AFT2Q08957 XDJ1YLR090W 1380 nt11.68□□□□□ -0.54
AFT2Q08957 DUT1YBR252W 444 nt11.66□□□□□ -0.54
AFT2Q08957 YGR201CYGR201C 678 nt11.65□□□□□ -0.54
AFT2Q08957 GLK1YCL040W 1503 nt11.65□□□□□ -0.55
AFT2Q08957 SHM2YLR058C 1410 nt11.59□□□□□ -0.55
AFT2Q08957 GDH3YAL062W 1374 nt11.58□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 YNL115CYNL115C 1935 nt11.58□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 YJL225CYJL225C 5277 nt11.57□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 YFL066CYFL066C 1179 nt11.56□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 DUS1YML080W 1272 nt11.56□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 PEX25YPL112C 1185 nt11.55□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.54□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.54□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 AVT6YER119C 1347 nt11.54□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 YCL074WYCL074W 927 nt11.53□□□□□ -0.56
AFT2Q08957 NIT1YIL164C 600 nt11.51□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 YFR018CYFR018C 1092 nt11.5□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 TIM17YJL143W 477 nt11.5□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 STR3YGL184C 1398 nt11.5□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 PRE6YOL038W 765 nt11.49□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 PRP4YPR178W 1398 nt11.49□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 GOR1YNL274C 1053 nt11.47□□□□□ -0.57
AFT2Q08957 YKR005CYKR005C 1578 nt11.45□□□□□ -0.58
AFT2Q08957 DPS1YLL018C 1674 nt11.44□□□□□ -0.58
AFT2Q08957 YDR094WYDR094W 336 nt11.43□□□□□ -0.58
AFT2Q08957 SGT2YOR007C 1041 nt11.42□□□□□ -0.58
AFT2Q08957 DAT1YML113W 747 nt11.4□□□□□ -0.58
AFT2Q08957 VPS75YNL246W 795 nt11.4□□□□□ -0.58
AFT2Q08957 AQY2YLL052C 450 nt11.39□□□□□ -0.59
AFT2Q08957 YGR259CYGR259C 441 nt11.37□□□□□ -0.59
AFT2Q08957 UBX6YJL048C 1191 nt11.36□□□□□ -0.59
AFT2Q08957 ALG12YNR030W 1656 nt11.33□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 SNF1YDR477W 1902 nt11.33□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 AAC1YMR056C 930 nt11.31□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 NBP35YGL091C 987 nt11.3□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 YCR102CYCR102C 1107 nt11.29□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 PAU16YKL224C 372 nt11.28□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 BMT6YLR063W 1098 nt11.28□□□□□ -0.6
AFT2Q08957 RRT5YFR032C 870 nt11.25□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 RTN2YDL204W 1182 nt11.23□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 BIO5YNR056C 1686 nt11.23□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 YDR010CYDR010C 333 nt11.21□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 Q0182Q0182 405 nt11.21□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 IRC24YIR036C 792 nt11.21□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 MIR1YJR077C 936 nt11.21□□□□□ -0.61
AFT2Q08957 UME6YDR207C 2511 nt11.2□□□□□ -0.62
AFT2Q08957 SHH4YLR164W 507 nt11.18□□□□□ -0.62
AFT2Q08957 SHB17YKR043C 816 nt11.17□□□□□ -0.62
AFT2Q08957 PAU7YAR020C 168 nt11.17□□□□□ -0.62
AFT2Q08957 ARP6YLR085C 1317 nt11.16□□□□□ -0.62
AFT2Q08957 PLB1YMR008C 1995 nt11.16□□□□□ -0.62
AFT2Q08957 TIR3YIL011W 810 nt11.11□□□□□ -0.63
AFT2Q08957 SFA1YDL168W 1161 nt11.1□□□□□ -0.63
AFT2Q08957 MCH5YOR306C 1566 nt11.09□□□□□ -0.63
AFT2Q08957 UBA4YHR111W 1323 nt11.08□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 THI74YDR438W 1113 nt11.07□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 PBP1YGR178C 2169 nt11.07□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 RET2YFR051C 1641 nt11.06□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 PRO1YDR300C 1287 nt11.05□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 POM34YLR018C 900 nt11.04□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.03□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 LSC2YGR244C 1284 nt11.03□□□□□ -0.64
AFT2Q08957 NAR1YNL240C 1476 nt11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms