Protein–RNA interactions for Protein: Q08826

SNX3, Sorting nexin-3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX3Q08826 PRP4YPR178W 1398 nt10.69□□□□□ -0.7
SNX3Q08826 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.66□□□□□ -0.7
SNX3Q08826 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.65□□□□□ -0.7
SNX3Q08826 YEL076CYEL076C 651 nt10.65□□□□□ -0.7
SNX3Q08826 YLR464WYLR464W 651 nt10.65□□□□□ -0.7
SNX3Q08826 BNA2YJR078W 1362 nt10.64□□□□□ -0.71
SNX3Q08826 DPS1YLL018C 1674 nt10.63□□□□□ -0.71
SNX3Q08826 AAC1YMR056C 930 nt10.61□□□□□ -0.71
SNX3Q08826 ANP1YEL036C 1503 nt10.61□□□□□ -0.71
SNX3Q08826 PTH1YHR189W 573 nt10.59□□□□□ -0.71
SNX3Q08826 DUS1YML080W 1272 nt10.58□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 AGP1YCL025C 1902 nt10.56□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.56□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 BMT6YLR063W 1098 nt10.56□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 YKR005CYKR005C 1578 nt10.56□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 STB1YNL309W 1263 nt10.54□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 AQY1YPR192W 918 nt10.54□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 MIC12YBR262C 321 nt10.53□□□□□ -0.72
SNX3Q08826 FEN2YCR028C 1539 nt10.52□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 NAR1YNL240C 1476 nt10.51□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 WSC2YNL283C 1512 nt10.51□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 YCL074WYCL074W 927 nt10.49□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 SPC25YER018C 666 nt10.49□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 YLR179CYLR179C 606 nt10.49□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 TIM23YNR017W 669 nt10.49□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 HHO1YPL127C 777 nt10.49□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 SNF1YDR477W 1902 nt10.48□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 BIO5YNR056C 1686 nt10.48□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 GPI16YHR188C 1833 nt10.47□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 YGR259CYGR259C 441 nt10.46□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 SPP1YPL138C 1062 nt10.46□□□□□ -0.73
SNX3Q08826 YLR235CYLR235C 399 nt10.45□□□□□ -0.74
SNX3Q08826 VPS60YDR486C 690 nt10.44□□□□□ -0.74
SNX3Q08826 Q0182Q0182 405 nt10.44□□□□□ -0.74
SNX3Q08826 YIR016WYIR016W 798 nt10.43□□□□□ -0.74
SNX3Q08826 ALG3YBL082C 1377 nt10.39□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 CCT4YDL143W 1587 nt10.39□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 SWC5YBR231C 912 nt10.37□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.37□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.37□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 XDJ1YLR090W 1380 nt10.37□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 DUT1YBR252W 444 nt10.36□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 YGR201CYGR201C 678 nt10.34□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 AHT1YHR093W 549 nt10.34□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 IRC24YIR036C 792 nt10.34□□□□□ -0.75
SNX3Q08826 PBP1YGR178C 2169 nt10.32□□□□□ -0.76
SNX3Q08826 STR3YGL184C 1398 nt10.31□□□□□ -0.76
SNX3Q08826 AQY2YLL052C 450 nt10.3□□□□□ -0.76
SNX3Q08826 YJL225CYJL225C 5277 nt10.3□□□□□ -0.76
SNX3Q08826 YKL030WYKL030W 606 nt10.29□□□□□ -0.76
SNX3Q08826 CYT2YKL087C 675 nt10.29□□□□□ -0.76
SNX3Q08826 YPR064WYPR064W 420 nt10.27□□□□□ -0.77
SNX3Q08826 AVT6YER119C 1347 nt10.27□□□□□ -0.77
SNX3Q08826 GOR1YNL274C 1053 nt10.23□□□□□ -0.77
SNX3Q08826 GDH3YAL062W 1374 nt10.21□□□□□ -0.78
SNX3Q08826 TAD3YLR316C 969 nt10.19□□□□□ -0.78
SNX3Q08826 MOT3YMR070W 1473 nt10.17□□□□□ -0.78
SNX3Q08826 RTN2YDL204W 1182 nt10.15□□□□□ -0.78
SNX3Q08826 CMP2YML057W 1815 nt10.11□□□□□ -0.79
SNX3Q08826 YAT1YAR035W 2064 nt10.11□□□□□ -0.79
SNX3Q08826 SHM2YLR058C 1410 nt10.1□□□□□ -0.79
SNX3Q08826 BDH1YAL060W 1149 nt10.09□□□□□ -0.79
SNX3Q08826 YLR415CYLR415C 339 nt10.07□□□□□ -0.8
SNX3Q08826 TIM17YJL143W 477 nt10.03□□□□□ -0.8
SNX3Q08826 PLB1YMR008C 1995 nt10.01□□□□□ -0.81
SNX3Q08826 NIT1YIL164C 600 nt9.98□□□□□ -0.81
SNX3Q08826 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.97□□□□□ -0.81
SNX3Q08826 DAT1YML113W 747 nt9.97□□□□□ -0.81
SNX3Q08826 RTG1YOL067C 534 nt9.97□□□□□ -0.81
SNX3Q08826 PRM5YIL117C 957 nt9.96□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 NDI1YML120C 1542 nt9.96□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 YSP3YOR003W 1437 nt9.94□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 NBP35YGL091C 987 nt9.94□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 HIF1YLL022C 1158 nt9.94□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 SGT2YOR007C 1041 nt9.94□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 YCR102CYCR102C 1107 nt9.92□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 ARP6YLR085C 1317 nt9.9□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 ALD4YOR374W 1560 nt9.9□□□□□ -0.82
SNX3Q08826 SPT20YOL148C 1815 nt9.85□□□□□ -0.83
SNX3Q08826 YNL115CYNL115C 1935 nt9.85□□□□□ -0.83
SNX3Q08826 INA1YLR413W 2028 nt9.85□□□□□ -0.83
SNX3Q08826 RPC82YPR190C 1965 nt9.84□□□□□ -0.83
SNX3Q08826 UTR1YJR049C 1593 nt9.84□□□□□ -0.83
SNX3Q08826 HSL7YBR133C 2484 nt9.81□□□□□ -0.84
SNX3Q08826 HUA1YGR268C 597 nt9.8□□□□□ -0.84
SNX3Q08826 GAP1YKR039W 1809 nt9.77□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 PEX25YPL112C 1185 nt9.76□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 SHH4YLR164W 507 nt9.75□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 YFL066CYFL066C 1179 nt9.73□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 TIR3YIL011W 810 nt9.73□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 PRO1YDR300C 1287 nt9.72□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 SAM35YHR083W 990 nt9.72□□□□□ -0.85
SNX3Q08826 VPS75YNL246W 795 nt9.71□□□□□ -0.86
SNX3Q08826 LSC2YGR244C 1284 nt9.7□□□□□ -0.86
SNX3Q08826 ZRT3YKL175W 1512 nt9.69□□□□□ -0.86
SNX3Q08826 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.68□□□□□ -0.86
SNX3Q08826 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.68□□□□□ -0.86
SNX3Q08826 ATG15YCR068W 1563 nt9.67□□□□□ -0.86
SNX3Q08826 YJL067WYJL067W 351 nt9.64□□□□□ -0.87
SNX3Q08826 POM34YLR018C 900 nt9.64□□□□□ -0.87
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