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Protein–RNA interactions for Protein: Q08729
DSE3, Protein DSE3, yeast
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430 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE3
Q08729
PIB2
YGL023C
1908 nt
12.4
□□□□□ -0.42
DSE3
Q08729
YFL067W
YFL067W
528 nt
12.38
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
12.37
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
YFR018C
YFR018C
1092 nt
12.37
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
CRR1
YLR213C
1269 nt
12.37
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
SPC25
YER018C
666 nt
12.36
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
PRE6
YOL038W
765 nt
12.36
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
LYS4
YDR234W
2082 nt
12.35
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
CCT4
YDL143W
1587 nt
12.34
□□□□□ -0.43
DSE3
Q08729
YFL015W-A
YFL015W-A
318 nt
12.33
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
12.32
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
YFL066C
YFL066C
1179 nt
12.31
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
BDH1
YAL060W
1149 nt
12.31
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
GPI16
YHR188C
1833 nt
12.3
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
PAU16
YKL224C
372 nt
12.3
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
VPS60
YDR486C
690 nt
12.29
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
MIC10
YCL057C-A
294 nt
12.29
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
SNG1
YGR197C
1644 nt
12.29
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
RRT5
YFR032C
870 nt
12.28
□□□□□ -0.44
DSE3
Q08729
HEM12
YDR047W
1089 nt
12.27
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
FEN2
YCR028C
1539 nt
12.27
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
YLR415C
YLR415C
339 nt
12.26
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
SWC5
YBR231C
912 nt
12.26
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
YSP3
YOR003W
1437 nt
12.26
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
ALG3
YBL082C
1377 nt
12.25
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
ANP1
YEL036C
1503 nt
12.25
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
PTK1
YKL198C
1989 nt
12.23
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
PEX25
YPL112C
1185 nt
12.23
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
YNL115C
YNL115C
1935 nt
12.21
□□□□□ -0.45
DSE3
Q08729
YIR016W
YIR016W
798 nt
12.16
□□□□□ -0.46
DSE3
Q08729
YHR056W-A
YHR056W-A
435 nt
12.08
□□□□□ -0.48
DSE3
Q08729
YFL054C
YFL054C
1941 nt
12.07
□□□□□ -0.48
DSE3
Q08729
SPT8
YLR055C
1809 nt
12.07
□□□□□ -0.48
DSE3
Q08729
BNA2
YJR078W
1362 nt
12.03
□□□□□ -0.48
DSE3
Q08729
VPS75
YNL246W
795 nt
12.01
□□□□□ -0.49
DSE3
Q08729
RAX1
YOR301W
1308 nt
12
□□□□□ -0.49
DSE3
Q08729
TIM17
YJL143W
477 nt
11.97
□□□□□ -0.49
DSE3
Q08729
NAT4
YMR069W
858 nt
11.97
□□□□□ -0.49
DSE3
Q08729
MIC12
YBR262C
321 nt
11.97
□□□□□ -0.49
DSE3
Q08729
GLK1
YCL040W
1503 nt
11.96
□□□□□ -0.49
DSE3
Q08729
SHM2
YLR058C
1410 nt
11.95
□□□□□ -0.5
DSE3
Q08729
XDJ1
YLR090W
1380 nt
11.95
□□□□□ -0.5
DSE3
Q08729
MIR1
YJR077C
936 nt
11.94
□□□□□ -0.5
DSE3
Q08729
SBA1
YKL117W
651 nt
11.92
□□□□□ -0.5
DSE3
Q08729
HHO1
YPL127C
777 nt
11.91
□□□□□ -0.5
DSE3
Q08729
THI74
YDR438W
1113 nt
11.9
□□□□□ -0.5
DSE3
Q08729
PAU7
YAR020C
168 nt
11.89
□□□□□ -0.51
DSE3
Q08729
GDH3
YAL062W
1374 nt
11.89
□□□□□ -0.51
DSE3
Q08729
MSF1
YPR047W
1410 nt
11.88
□□□□□ -0.51
DSE3
Q08729
NIT1
YIL164C
600 nt
11.83
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
SGT2
YOR007C
1041 nt
11.83
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
YGR201C
YGR201C
678 nt
11.82
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
CCA1
YER168C
1641 nt
11.8
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
DAT1
YML113W
747 nt
11.8
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
AVT6
YER119C
1347 nt
11.79
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
SWE1
YJL187C
2460 nt
11.78
□□□□□ -0.52
DSE3
Q08729
SHB17
YKR043C
816 nt
11.77
□□□□□ -0.53
DSE3
Q08729
AGP1
YCL025C
1902 nt
11.76
□□□□□ -0.53
DSE3
Q08729
UBA4
YHR111W
1323 nt
11.76
□□□□□ -0.53
DSE3
Q08729
DUT1
YBR252W
444 nt
11.75
□□□□□ -0.53
DSE3
Q08729
YDR010C
YDR010C
333 nt
11.72
□□□□□ -0.53
DSE3
Q08729
GOR1
YNL274C
1053 nt
11.72
□□□□□ -0.53
DSE3
Q08729
YGL034C
YGL034C
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□□□□□ -0.54
DSE3
Q08729
YSR3
YKR053C
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11.69
□□□□□ -0.54
DSE3
Q08729
XYL2
YLR070C
1071 nt
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□□□□□ -0.54
DSE3
Q08729
PHO89
YBR296C
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□□□□□ -0.55
DSE3
Q08729
RET2
YFR051C
1641 nt
11.6
□□□□□ -0.55
DSE3
Q08729
DUS1
YML080W
1272 nt
11.6
□□□□□ -0.55
DSE3
Q08729
YCR102C
YCR102C
1107 nt
11.59
□□□□□ -0.55
DSE3
Q08729
RBG1
YAL036C
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11.56
□□□□□ -0.56
DSE3
Q08729
NDI1
YML120C
1542 nt
11.53
□□□□□ -0.56
DSE3
Q08729
YMR244W
YMR244W
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11.52
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
NVJ2
YPR091C
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□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
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YCR087W
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□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
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YDL168W
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DSE3
Q08729
STR3
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DSE3
Q08729
GLR1
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11.5
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
AQY2
YLL052C
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11.49
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
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YGL091C
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11.48
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
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11.48
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
AIM45
YPR004C
1035 nt
11.48
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
MRP20
YDR405W
792 nt
11.47
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
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YHL019W-A
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11.47
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
RDN18-1
RDN18-1
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□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
RDN18-2
RDN18-2
1800 nt
11.46
□□□□□ -0.57
DSE3
Q08729
SHH4
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DSE3
Q08729
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DSE3
Q08729
YCL074W
YCL074W
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□□□□□ -0.58
DSE3
Q08729
FUR4
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□□□□□ -0.59
DSE3
Q08729
TIR3
YIL011W
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11.39
□□□□□ -0.59
DSE3
Q08729
TOM6
YOR045W
186 nt
11.35
□□□□□ -0.59
DSE3
Q08729
POM34
YLR018C
900 nt
11.32
□□□□□ -0.6
DSE3
Q08729
PRO1
YDR300C
1287 nt
11.3
□□□□□ -0.6
DSE3
Q08729
RPL4B
YDR012W
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11.29
□□□□□ -0.6
DSE3
Q08729
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YGR173W
1107 nt
11.29
□□□□□ -0.6
DSE3
Q08729
PEX2
YJL210W
816 nt
11.29
□□□□□ -0.6
DSE3
Q08729
RPL4A
YBR031W
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11.29
□□□□□ -0.6
DSE3
Q08729
CLB6
YGR109C
1143 nt
11.26
□□□□□ -0.61
DSE3
Q08729
LSC2
YGR244C
1284 nt
11.25
□□□□□ -0.61
DSE3
Q08729
RPS14B
YJL191W
417 nt
11.25
□□□□□ -0.61
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