Protein–RNA interactions for Protein: Q08285

RRP40, Exosome complex component RRP40, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP40Q08285 YFL067WYFL067W 528 nt10.41□□□□□ -0.74
RRP40Q08285 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.4□□□□□ -0.74
RRP40Q08285 TAD3YLR316C 969 nt10.39□□□□□ -0.75
RRP40Q08285 STB1YNL309W 1263 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP40Q08285 DDR2YOL052C-A 186 nt10.37□□□□□ -0.75
RRP40Q08285 SPC25YER018C 666 nt10.36□□□□□ -0.75
RRP40Q08285 SNG1YGR197C 1644 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 HEM12YDR047W 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 UBX6YJL048C 1191 nt10.33□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 UME6YDR207C 2511 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 YDR094WYDR094W 336 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 MIC10YCL057C-A 294 nt10.32□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 ANP1YEL036C 1503 nt10.31□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 GPI16YHR188C 1833 nt10.3□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 CCT4YDL143W 1587 nt10.3□□□□□ -0.76
RRP40Q08285 VPS60YDR486C 690 nt10.27□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 FEN2YCR028C 1539 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 BDH1YAL060W 1149 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 YFL054CYFL054C 1941 nt10.25□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 BOR1YNL275W 1731 nt10.24□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 YFR018CYFR018C 1092 nt10.23□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 SWC5YBR231C 912 nt10.23□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 ALG3YBL082C 1377 nt10.23□□□□□ -0.77
RRP40Q08285 YLR415CYLR415C 339 nt10.2□□□□□ -0.78
RRP40Q08285 YSP3YOR003W 1437 nt10.19□□□□□ -0.78
RRP40Q08285 PEX25YPL112C 1185 nt10.17□□□□□ -0.78
RRP40Q08285 YIR016WYIR016W 798 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP40Q08285 SPT8YLR055C 1809 nt10.16□□□□□ -0.78
RRP40Q08285 PRE6YOL038W 765 nt10.15□□□□□ -0.78
RRP40Q08285 RAX1YOR301W 1308 nt10.14□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 YNL115CYNL115C 1935 nt10.12□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 MIC12YBR262C 321 nt10.12□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 YJL225CYJL225C 5277 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 YFL066CYFL066C 1179 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 BNA2YJR078W 1362 nt10.11□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 PAU16YKL224C 372 nt10.09□□□□□ -0.79
RRP40Q08285 RRT5YFR032C 870 nt10.08□□□□□ -0.8
RRP40Q08285 Q0182Q0182 405 nt10.06□□□□□ -0.8
RRP40Q08285 SWE1YJL187C 2460 nt10.05□□□□□ -0.8
RRP40Q08285 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.04□□□□□ -0.8
RRP40Q08285 XDJ1YLR090W 1380 nt10.01□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 VPS75YNL246W 795 nt10□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 TIM17YJL143W 477 nt9.99□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 CCA1YER168C 1641 nt9.99□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 YGR201CYGR201C 678 nt9.98□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 SHM2YLR058C 1410 nt9.98□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 HHO1YPL127C 777 nt9.97□□□□□ -0.81
RRP40Q08285 MCH5YOR306C 1566 nt9.96□□□□□ -0.82
RRP40Q08285 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.94□□□□□ -0.82
RRP40Q08285 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.94□□□□□ -0.82
RRP40Q08285 GDH3YAL062W 1374 nt9.92□□□□□ -0.82
RRP40Q08285 AGP1YCL025C 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
RRP40Q08285 ALG12YNR030W 1656 nt9.9□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 NIT1YIL164C 600 nt9.89□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 MIR1YJR077C 936 nt9.89□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 HSP60YLR259C 1719 nt9.86□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 SGT2YOR007C 1041 nt9.86□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 AVT6YER119C 1347 nt9.85□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 GLK1YCL040W 1503 nt9.84□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 NAT4YMR069W 858 nt9.84□□□□□ -0.83
RRP40Q08285 PAU7YAR020C 168 nt9.83□□□□□ -0.84
RRP40Q08285 DUT1YBR252W 444 nt9.83□□□□□ -0.84
RRP40Q08285 THI74YDR438W 1113 nt9.81□□□□□ -0.84
RRP40Q08285 DAT1YML113W 747 nt9.81□□□□□ -0.84
RRP40Q08285 GOR1YNL274C 1053 nt9.81□□□□□ -0.84
RRP40Q08285 MSF1YPR047W 1410 nt9.78□□□□□ -0.84
RRP40Q08285 SHB17YKR043C 816 nt9.77□□□□□ -0.85
RRP40Q08285 DUS1YML080W 1272 nt9.76□□□□□ -0.85
RRP40Q08285 YDR010CYDR010C 333 nt9.74□□□□□ -0.85
RRP40Q08285 UBA4YHR111W 1323 nt9.73□□□□□ -0.85
RRP40Q08285 FUR4YBR021W 1902 nt9.72□□□□□ -0.85
RRP40Q08285 YCR102CYCR102C 1107 nt9.71□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 YCL074WYCL074W 927 nt9.7□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 STR3YGL184C 1398 nt9.68□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.68□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.68□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 RET2YFR051C 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 RPM1RPM1 483 nt9.67□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 YSR3YKR053C 1215 nt9.66□□□□□ -0.86
RRP40Q08285 YGL034CYGL034C 366 nt9.64□□□□□ -0.87
RRP40Q08285 SBA1YKL117W 651 nt9.64□□□□□ -0.87
RRP40Q08285 NBP35YGL091C 987 nt9.63□□□□□ -0.87
RRP40Q08285 AQY2YLL052C 450 nt9.63□□□□□ -0.87
RRP40Q08285 PHO89YBR296C 1725 nt9.62□□□□□ -0.87
RRP40Q08285 YCR087WYCR087W 516 nt9.59□□□□□ -0.87
RRP40Q08285 SFA1YDL168W 1161 nt9.58□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 XYL2YLR070C 1071 nt9.58□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 NAR1YNL240C 1476 nt9.58□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 TIR3YIL011W 810 nt9.56□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 SHH4YLR164W 507 nt9.56□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.54□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 COQ2YNR041C 1119 nt9.53□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 AIM45YPR004C 1035 nt9.53□□□□□ -0.88
RRP40Q08285 RTN2YDL204W 1182 nt9.52□□□□□ -0.89
RRP40Q08285 YKR005CYKR005C 1578 nt9.52□□□□□ -0.89
RRP40Q08285 MRP20YDR405W 792 nt9.5□□□□□ -0.89
RRP40Q08285 LSC2YGR244C 1284 nt9.49□□□□□ -0.89
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