Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 STB1YNL309W 1263 nt11.73□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 PRE6YOL038W 765 nt11.73□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 PAU16YKL224C 372 nt11.72□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 PIB2YGL023C 1908 nt11.71□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 YFL067WYFL067W 528 nt11.71□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 BDH1YAL060W 1149 nt11.71□□□□□ -0.53
SHS1Q07657 BOP3YNL042W 1191 nt11.69□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 DDR2YOL052C-A 186 nt11.69□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 RTF1YGL244W 1677 nt11.68□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 LYS4YDR234W 2082 nt11.67□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 CCT4YDL143W 1587 nt11.67□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.67□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 RRT5YFR032C 870 nt11.67□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 YSP3YOR003W 1437 nt11.67□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 PEX25YPL112C 1185 nt11.66□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 GPI16YHR188C 1833 nt11.65□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.65□□□□□ -0.54
SHS1Q07657 ANP1YEL036C 1503 nt11.62□□□□□ -0.55
SHS1Q07657 VPS60YDR486C 690 nt11.62□□□□□ -0.55
SHS1Q07657 YFL066CYFL066C 1179 nt11.62□□□□□ -0.55
SHS1Q07657 YLR415CYLR415C 339 nt11.61□□□□□ -0.55
SHS1Q07657 SNG1YGR197C 1644 nt11.6□□□□□ -0.55
SHS1Q07657 ALG3YBL082C 1377 nt11.58□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 HEM12YDR047W 1089 nt11.58□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 MIC10YCL057C-A 294 nt11.58□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 FEN2YCR028C 1539 nt11.58□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 YNL115CYNL115C 1935 nt11.58□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 SWC5YBR231C 912 nt11.57□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 PTK1YKL198C 1989 nt11.52□□□□□ -0.56
SHS1Q07657 YIR016WYIR016W 798 nt11.48□□□□□ -0.57
SHS1Q07657 SPT8YLR055C 1809 nt11.45□□□□□ -0.58
SHS1Q07657 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.44□□□□□ -0.58
SHS1Q07657 VPS75YNL246W 795 nt11.44□□□□□ -0.58
SHS1Q07657 SBA1YKL117W 651 nt11.38□□□□□ -0.59
SHS1Q07657 MIR1YJR077C 936 nt11.37□□□□□ -0.59
SHS1Q07657 NAT4YMR069W 858 nt11.37□□□□□ -0.59
SHS1Q07657 MIC12YBR262C 321 nt11.37□□□□□ -0.59
SHS1Q07657 Q0182Q0182 405 nt11.36□□□□□ -0.59
SHS1Q07657 GLK1YCL040W 1503 nt11.34□□□□□ -0.59
SHS1Q07657 RAX1YOR301W 1308 nt11.33□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 TIM17YJL143W 477 nt11.32□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 BNA2YJR078W 1362 nt11.31□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 MSF1YPR047W 1410 nt11.3□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 THI74YDR438W 1113 nt11.3□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 YFL054CYFL054C 1941 nt11.3□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 XDJ1YLR090W 1380 nt11.29□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 SHM2YLR058C 1410 nt11.29□□□□□ -0.6
SHS1Q07657 YJL225CYJL225C 5277 nt11.26□□□□□ -0.61
SHS1Q07657 YGR201CYGR201C 678 nt11.22□□□□□ -0.61
SHS1Q07657 NIT1YIL164C 600 nt11.22□□□□□ -0.61
SHS1Q07657 GDH3YAL062W 1374 nt11.2□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 PAU7YAR020C 168 nt11.2□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 DAT1YML113W 747 nt11.19□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 SGT2YOR007C 1041 nt11.19□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 HHO1YPL127C 777 nt11.19□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 UBA4YHR111W 1323 nt11.16□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 SHB17YKR043C 816 nt11.16□□□□□ -0.62
SHS1Q07657 YDR010CYDR010C 333 nt11.14□□□□□ -0.63
SHS1Q07657 CCA1YER168C 1641 nt11.11□□□□□ -0.63
SHS1Q07657 SWE1YJL187C 2460 nt11.11□□□□□ -0.63
SHS1Q07657 AGP1YCL025C 1902 nt11.1□□□□□ -0.63
SHS1Q07657 YGL034CYGL034C 366 nt11.09□□□□□ -0.63
SHS1Q07657 AVT6YER119C 1347 nt11.08□□□□□ -0.64
SHS1Q07657 YSR3YKR053C 1215 nt11.07□□□□□ -0.64
SHS1Q07657 RET2YFR051C 1641 nt11.05□□□□□ -0.64
SHS1Q07657 DUT1YBR252W 444 nt11.03□□□□□ -0.64
SHS1Q07657 GOR1YNL274C 1053 nt11.02□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 XYL2YLR070C 1071 nt11□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 PHO89YBR296C 1725 nt10.98□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 YMR244WYMR244W 1068 nt10.98□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 YCR087WYCR087W 516 nt10.96□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 YCR102CYCR102C 1107 nt10.96□□□□□ -0.65
SHS1Q07657 GLR1YPL091W 1452 nt10.93□□□□□ -0.66
SHS1Q07657 NDI1YML120C 1542 nt10.92□□□□□ -0.66
SHS1Q07657 RBG1YAL036C 1110 nt10.91□□□□□ -0.66
SHS1Q07657 AIM45YPR004C 1035 nt10.91□□□□□ -0.66
SHS1Q07657 SFA1YDL168W 1161 nt10.9□□□□□ -0.66
SHS1Q07657 COQ2YNR041C 1119 nt10.88□□□□□ -0.67
SHS1Q07657 NBP35YGL091C 987 nt10.87□□□□□ -0.67
SHS1Q07657 MRP20YDR405W 792 nt10.84□□□□□ -0.67
SHS1Q07657 STR3YGL184C 1398 nt10.83□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 DUS1YML080W 1272 nt10.83□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.82□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 SHH4YLR164W 507 nt10.82□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 TIR3YIL011W 810 nt10.81□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.81□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.81□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 YCL074WYCL074W 927 nt10.79□□□□□ -0.68
SHS1Q07657 RBG2YGR173W 1107 nt10.77□□□□□ -0.69
SHS1Q07657 AQY2YLL052C 450 nt10.75□□□□□ -0.69
SHS1Q07657 RPL4BYDR012W 1089 nt10.74□□□□□ -0.69
SHS1Q07657 RPL4AYBR031W 1089 nt10.74□□□□□ -0.69
SHS1Q07657 POM34YLR018C 900 nt10.72□□□□□ -0.69
SHS1Q07657 FUR4YBR021W 1902 nt10.71□□□□□ -0.69
SHS1Q07657 LSC2YGR244C 1284 nt10.7□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 RPS14BYJL191W 417 nt10.7□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 TOM6YOR045W 186 nt10.7□□□□□ -0.7
SHS1Q07657 YMR226CYMR226C 804 nt10.69□□□□□ -0.7
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