Protein–RNA interactions for Protein: Q07468

VAM6, Vacuolar morphogenesis protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM6Q07468 YEL076CYEL076C 651 nt10.82□□□□□ -0.68
VAM6Q07468 YLR464WYLR464W 651 nt10.82□□□□□ -0.68
VAM6Q07468 SPT8YLR055C 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
VAM6Q07468 YFL067WYFL067W 528 nt10.79□□□□□ -0.68
VAM6Q07468 AQY1YPR192W 918 nt10.78□□□□□ -0.68
VAM6Q07468 DDR2YOL052C-A 186 nt10.77□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 HEM12YDR047W 1089 nt10.76□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 MIC10YCL057C-A 294 nt10.76□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 WSC2YNL283C 1512 nt10.75□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 SNG1YGR197C 1644 nt10.74□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 AHT1YHR093W 549 nt10.73□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 ADO1YJR105W 1023 nt10.73□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 HUA1YGR268C 597 nt10.72□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.71□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 STB1YNL309W 1263 nt10.71□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 YPR064WYPR064W 420 nt10.71□□□□□ -0.69
VAM6Q07468 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.7□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 SPC25YER018C 666 nt10.69□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.68□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 ANP1YEL036C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 NAR1YNL240C 1476 nt10.67□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 GPI16YHR188C 1833 nt10.65□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 TAD3YLR316C 969 nt10.65□□□□□ -0.7
VAM6Q07468 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.64□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.64□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 CCT4YDL143W 1587 nt10.63□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 FEN2YCR028C 1539 nt10.63□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 VPS60YDR486C 690 nt10.61□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 SWE1YJL187C 2460 nt10.6□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.59□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 RAX1YOR301W 1308 nt10.58□□□□□ -0.71
VAM6Q07468 GLK1YCL040W 1503 nt10.58□□□□□ -0.72
VAM6Q07468 SWC5YBR231C 912 nt10.57□□□□□ -0.72
VAM6Q07468 ALG3YBL082C 1377 nt10.56□□□□□ -0.72
VAM6Q07468 BNA2YJR078W 1362 nt10.53□□□□□ -0.72
VAM6Q07468 YIR016WYIR016W 798 nt10.53□□□□□ -0.72
VAM6Q07468 BDH1YAL060W 1149 nt10.51□□□□□ -0.73
VAM6Q07468 MIC12YBR262C 321 nt10.5□□□□□ -0.73
VAM6Q07468 HSL7YBR133C 2484 nt10.49□□□□□ -0.73
VAM6Q07468 CCA1YER168C 1641 nt10.48□□□□□ -0.73
VAM6Q07468 YLR415CYLR415C 339 nt10.47□□□□□ -0.73
VAM6Q07468 UBX6YJL048C 1191 nt10.45□□□□□ -0.74
VAM6Q07468 CMP2YML057W 1815 nt10.44□□□□□ -0.74
VAM6Q07468 YSP3YOR003W 1437 nt10.43□□□□□ -0.74
VAM6Q07468 HHO1YPL127C 777 nt10.4□□□□□ -0.74
VAM6Q07468 AGP1YCL025C 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 PEX25YPL112C 1185 nt10.36□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 XDJ1YLR090W 1380 nt10.36□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 YGR201CYGR201C 678 nt10.35□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 AAC1YMR056C 930 nt10.35□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 YNL115CYNL115C 1935 nt10.35□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 YDR094WYDR094W 336 nt10.34□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 YFR018CYFR018C 1092 nt10.34□□□□□ -0.75
VAM6Q07468 PBP1YGR178C 2169 nt10.32□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 YFL066CYFL066C 1179 nt10.32□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 CYT2YKL087C 675 nt10.31□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 SHM2YLR058C 1410 nt10.3□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 GDH3YAL062W 1374 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 FUR4YBR021W 1902 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 BIO5YNR056C 1686 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 TIM17YJL143W 477 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 PRE6YOL038W 765 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 HEL2YDR266C 1920 nt10.29□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 PRP4YPR178W 1398 nt10.27□□□□□ -0.76
VAM6Q07468 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.26□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.26□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 AVT6YER119C 1347 nt10.26□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 DUS1YML080W 1272 nt10.25□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 DUT1YBR252W 444 nt10.25□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 VPS75YNL246W 795 nt10.22□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 DPS1YLL018C 1674 nt10.22□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 GOR1YNL274C 1053 nt10.21□□□□□ -0.77
VAM6Q07468 NIT1YIL164C 600 nt10.2□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 RRT5YFR032C 870 nt10.19□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 YCL074WYCL074W 927 nt10.17□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.17□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 PAU16YKL224C 372 nt10.17□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 SGT2YOR007C 1041 nt10.16□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 RPM1RPM1 483 nt10.15□□□□□ -0.78
VAM6Q07468 DAT1YML113W 747 nt10.13□□□□□ -0.79
VAM6Q07468 SNF1YDR477W 1902 nt10.13□□□□□ -0.79
VAM6Q07468 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
VAM6Q07468 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
VAM6Q07468 STR3YGL184C 1398 nt10.12□□□□□ -0.79
VAM6Q07468 AQY2YLL052C 450 nt10.08□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 PAU7YAR020C 168 nt10.07□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 MIR1YJR077C 936 nt10.05□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 YCR102CYCR102C 1107 nt10.04□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 BMT6YLR063W 1098 nt10.04□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 YKR005CYKR005C 1578 nt10.04□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 YAT1YAR035W 2064 nt10.03□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 NDI1YML120C 1542 nt10.02□□□□□ -0.8
VAM6Q07468 SHB17YKR043C 816 nt10□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 NBP35YGL091C 987 nt9.99□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 MET2YNL277W 1461 nt9.98□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 YDR010CYDR010C 333 nt9.98□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 YGR259CYGR259C 441 nt9.98□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 THI74YDR438W 1113 nt9.97□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 SFP1YLR403W 2052 nt9.97□□□□□ -0.81
VAM6Q07468 NAT4YMR069W 858 nt9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms