Protein–RNA interactions for Protein: Q06628

ATG13, Autophagy-related protein 13, yeastyeast

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG13Q06628 RRT12YCR045C 1476 nt13.77□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 SIM1YIL123W 1431 nt13.76□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 TRM5YHR070W 1500 nt13.75□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 SPC25YER018C 666 nt13.74□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 STB1YNL309W 1263 nt13.74□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 CCT4YDL143W 1587 nt13.73□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 THI74YDR438W 1113 nt13.72□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 MIR1YJR077C 936 nt13.72□□□□□ -0.21
ATG13Q06628 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG13Q06628 VPS75YNL246W 795 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG13Q06628 GPI16YHR188C 1833 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG13Q06628 DDR2YOL052C-A 186 nt13.64□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 YMR244WYMR244W 1068 nt13.63□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 SWC5YBR231C 912 nt13.63□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 YHL050CYHL050C 2094 nt13.62□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 ATF2YGR177C 1608 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 VPS60YDR486C 690 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 YFL067WYFL067W 528 nt13.6□□□□□ -0.23
ATG13Q06628 ERF2YLR246W 1080 nt13.58□□□□□ -0.24
ATG13Q06628 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG13Q06628 ALG3YBL082C 1377 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG13Q06628 SPT8YLR055C 1809 nt13.54□□□□□ -0.24
ATG13Q06628 DAT1YML113W 747 nt13.53□□□□□ -0.24
ATG13Q06628 FEN2YCR028C 1539 nt13.52□□□□□ -0.25
ATG13Q06628 GLR1YPL091W 1452 nt13.51□□□□□ -0.25
ATG13Q06628 CRR1YLR213C 1269 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG13Q06628 ANP1YEL036C 1503 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG13Q06628 PAU7YAR020C 168 nt13.48□□□□□ -0.25
ATG13Q06628 YGL034CYGL034C 366 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG13Q06628 UBA4YHR111W 1323 nt13.41□□□□□ -0.26
ATG13Q06628 TIM17YJL143W 477 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 SNG1YGR197C 1644 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 YIR016WYIR016W 798 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 SEC11YIR022W 504 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 RBG2YGR173W 1107 nt13.37□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 HEM12YDR047W 1089 nt13.35□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 SHB17YKR043C 816 nt13.35□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 NDI1YML120C 1542 nt13.34□□□□□ -0.27
ATG13Q06628 YSR3YKR053C 1215 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG13Q06628 MIC10YCL057C-A 294 nt13.31□□□□□ -0.28
ATG13Q06628 RBG1YAL036C 1110 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG13Q06628 XYL2YLR070C 1071 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG13Q06628 SHM2YLR058C 1410 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG13Q06628 LYS4YDR234W 2082 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG13Q06628 NCP1YHR042W 2076 nt13.27□□□□□ -0.29
ATG13Q06628 YDR010CYDR010C 333 nt13.24□□□□□ -0.29
ATG13Q06628 BDF1YLR399C 2061 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 XDJ1YLR090W 1380 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 YCR087WYCR087W 516 nt13.18□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 SGT2YOR007C 1041 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 PCH2YBR186W 1695 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 NIT1YIL164C 600 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 YMR226CYMR226C 804 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 RET2YFR051C 1641 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 PHO89YBR296C 1725 nt13.15□□□□□ -0.3
ATG13Q06628 AIM45YPR004C 1035 nt13.13□□□□□ -0.31
ATG13Q06628 BNA2YJR078W 1362 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG13Q06628 GDH3YAL062W 1374 nt13.08□□□□□ -0.31
ATG13Q06628 MIC12YBR262C 321 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG13Q06628 BOP3YNL042W 1191 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG13Q06628 GUT2YIL155C 1950 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG13Q06628 SAM1YLR180W 1149 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG13Q06628 TAT1YBR069C 1860 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG13Q06628 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.03□□□□□ -0.32
ATG13Q06628 MRP20YDR405W 792 nt13□□□□□ -0.33
ATG13Q06628 YGR201CYGR201C 678 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG13Q06628 RTF1YGL244W 1677 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG13Q06628 COQ2YNR041C 1119 nt12.96□□□□□ -0.33
ATG13Q06628 RAX1YOR301W 1308 nt12.95□□□□□ -0.34
ATG13Q06628 HHO1YPL127C 777 nt12.95□□□□□ -0.34
ATG13Q06628 YLR111WYLR111W 333 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG13Q06628 AVT6YER119C 1347 nt12.89□□□□□ -0.35
ATG13Q06628 PIB2YGL023C 1908 nt12.89□□□□□ -0.35
ATG13Q06628 SFA1YDL168W 1161 nt12.86□□□□□ -0.35
ATG13Q06628 YCR102CYCR102C 1107 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG13Q06628 RPL4BYDR012W 1089 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG13Q06628 GOR1YNL274C 1053 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG13Q06628 RPL4AYBR031W 1089 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG13Q06628 RAD51YER095W 1203 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG13Q06628 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.78□□□□□ -0.36
ATG13Q06628 SDH5YOL071W 489 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG13Q06628 PTK1YKL198C 1989 nt12.77□□□□□ -0.37
ATG13Q06628 CLB6YGR109C 1143 nt12.76□□□□□ -0.37
ATG13Q06628 RAD23YEL037C 1197 nt12.75□□□□□ -0.37
ATG13Q06628 RPS14BYJL191W 417 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG13Q06628 RPM1RPM1 483 nt12.72□□□□□ -0.37
ATG13Q06628 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG13Q06628 DUT1YBR252W 444 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG13Q06628 UTH1YKR042W 1098 nt12.66□□□□□ -0.38
ATG13Q06628 STE4YOR212W 1272 nt12.66□□□□□ -0.38
ATG13Q06628 AGP1YCL025C 1902 nt12.65□□□□□ -0.38
ATG13Q06628 YNR029CYNR029C 1290 nt12.65□□□□□ -0.38
ATG13Q06628 TIR3YIL011W 810 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 SHH4YLR164W 507 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 YLR349WYLR349W 507 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 TSC10YBR265W 963 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 YFL054CYFL054C 1941 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 NBP35YGL091C 987 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 CAB5YDR196C 726 nt12.6□□□□□ -0.39
ATG13Q06628 RIB3YDR487C 627 nt12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1097.3 ms