Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 ANP1YEL036C 1503 nt10.49□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 YKL030WYKL030W 606 nt10.48□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 RAX1YOR301W 1308 nt10.48□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 SPC25YER018C 666 nt10.46□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 STB1YNL309W 1263 nt10.46□□□□□ -0.73
YHC1Q05900 WSC2YNL283C 1512 nt10.44□□□□□ -0.74
YHC1Q05900 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.44□□□□□ -0.74
YHC1Q05900 AHT1YHR093W 549 nt10.43□□□□□ -0.74
YHC1Q05900 RTG1YOL067C 534 nt10.42□□□□□ -0.74
YHC1Q05900 CCA1YER168C 1641 nt10.42□□□□□ -0.74
YHC1Q05900 FEN2YCR028C 1539 nt10.4□□□□□ -0.74
YHC1Q05900 GPI16YHR188C 1833 nt10.39□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 BOR1YNL275W 1731 nt10.36□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 CCT4YDL143W 1587 nt10.36□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 VPS60YDR486C 690 nt10.36□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 YPR064WYPR064W 420 nt10.36□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 MIC12YBR262C 321 nt10.36□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 BNA2YJR078W 1362 nt10.35□□□□□ -0.75
YHC1Q05900 ALG3YBL082C 1377 nt10.32□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 YIR016WYIR016W 798 nt10.32□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 HSP60YLR259C 1719 nt10.32□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 UME6YDR207C 2511 nt10.32□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 TAD3YLR316C 969 nt10.3□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 FUR4YBR021W 1902 nt10.3□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 AGP1YCL025C 1902 nt10.28□□□□□ -0.76
YHC1Q05900 SWC5YBR231C 912 nt10.27□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 GLK1YCL040W 1503 nt10.26□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.25□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 YEL076CYEL076C 651 nt10.25□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 YLR464WYLR464W 651 nt10.25□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 HHO1YPL127C 777 nt10.23□□□□□ -0.77
YHC1Q05900 BDH1YAL060W 1149 nt10.2□□□□□ -0.78
YHC1Q05900 HUA1YGR268C 597 nt10.19□□□□□ -0.78
YHC1Q05900 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.18□□□□□ -0.78
YHC1Q05900 YGR201CYGR201C 678 nt10.18□□□□□ -0.78
YHC1Q05900 MRPL8YJL063C 717 nt10.18□□□□□ -0.78
YHC1Q05900 XDJ1YLR090W 1380 nt10.14□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 YLR415CYLR415C 339 nt10.13□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 DUS1YML080W 1272 nt10.13□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 YCL074WYCL074W 927 nt10.11□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 ADO1YJR105W 1023 nt10.11□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 DUT1YBR252W 444 nt10.11□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 YSP3YOR003W 1437 nt10.1□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 PRP4YPR178W 1398 nt10.1□□□□□ -0.79
YHC1Q05900 GDH3YAL062W 1374 nt10.06□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 DPS1YLL018C 1674 nt10.06□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 YKR005CYKR005C 1578 nt10.05□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.05□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.05□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 AVT6YER119C 1347 nt10.05□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 SHM2YLR058C 1410 nt10.04□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 STR3YGL184C 1398 nt10.03□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 Q0182Q0182 405 nt10.03□□□□□ -0.8
YHC1Q05900 GOR1YNL274C 1053 nt10.02□□□□□ -0.81
YHC1Q05900 ALG12YNR030W 1656 nt10.02□□□□□ -0.81
YHC1Q05900 TIM17YJL143W 477 nt10□□□□□ -0.81
YHC1Q05900 YNL115CYNL115C 1935 nt9.98□□□□□ -0.81
YHC1Q05900 AAC1YMR056C 930 nt9.98□□□□□ -0.81
YHC1Q05900 YGR259CYGR259C 441 nt9.97□□□□□ -0.81
YHC1Q05900 NIT1YIL164C 600 nt9.96□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 BMT6YLR063W 1098 nt9.96□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 PEX25YPL112C 1185 nt9.96□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 SNF1YDR477W 1902 nt9.94□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 AQY2YLL052C 450 nt9.93□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 YFL066CYFL066C 1179 nt9.92□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 DAT1YML113W 747 nt9.92□□□□□ -0.82
YHC1Q05900 YFR018CYFR018C 1092 nt9.89□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 SGT2YOR007C 1041 nt9.89□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 MCH5YOR306C 1566 nt9.88□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 IRC24YIR036C 792 nt9.87□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 VPS75YNL246W 795 nt9.86□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 BIO5YNR056C 1686 nt9.86□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 RTN2YDL204W 1182 nt9.84□□□□□ -0.83
YHC1Q05900 YCR102CYCR102C 1107 nt9.83□□□□□ -0.84
YHC1Q05900 NBP35YGL091C 987 nt9.83□□□□□ -0.84
YHC1Q05900 PRE6YOL038W 765 nt9.83□□□□□ -0.84
YHC1Q05900 YDR094WYDR094W 336 nt9.76□□□□□ -0.85
YHC1Q05900 ARP6YLR085C 1317 nt9.74□□□□□ -0.85
YHC1Q05900 PBP1YGR178C 2169 nt9.74□□□□□ -0.85
YHC1Q05900 PLB1YMR008C 1995 nt9.74□□□□□ -0.85
YHC1Q05900 NAR1YNL240C 1476 nt9.73□□□□□ -0.85
YHC1Q05900 RRT5YFR032C 870 nt9.68□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 PAU7YAR020C 168 nt9.68□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 SHH4YLR164W 507 nt9.68□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 YDR010CYDR010C 333 nt9.66□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 TIR3YIL011W 810 nt9.66□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 MIR1YJR077C 936 nt9.65□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 CYT2YKL087C 675 nt9.65□□□□□ -0.86
YHC1Q05900 SHB17YKR043C 816 nt9.64□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 LSC2YGR244C 1284 nt9.63□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 UBX6YJL048C 1191 nt9.63□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 PAU16YKL224C 372 nt9.63□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 SFA1YDL168W 1161 nt9.59□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 PRO1YDR300C 1287 nt9.59□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 PRM5YIL117C 957 nt9.59□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 POM34YLR018C 900 nt9.59□□□□□ -0.87
YHC1Q05900 GAP1YKR039W 1809 nt9.59□□□□□ -0.88
YHC1Q05900 UTR1YJR049C 1593 nt9.58□□□□□ -0.88
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