Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 HEM12YDR047W 1089 nt11.81□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 AHT1YHR093W 549 nt11.8□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 MIC10YCL057C-A 294 nt11.8□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 Q0182Q0182 405 nt11.79□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 YPR064WYPR064W 420 nt11.79□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 SNG1YGR197C 1644 nt11.78□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.77□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 STB1YNL309W 1263 nt11.77□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.75□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 SPC25YER018C 666 nt11.75□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 TAD3YLR316C 969 nt11.73□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 SPT8YLR055C 1809 nt11.72□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 ANP1YEL036C 1503 nt11.71□□□□□ -0.53
YLR297WQ05899 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR297WQ05899 CCT4YDL143W 1587 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR297WQ05899 GPI16YHR188C 1833 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR297WQ05899 FEN2YCR028C 1539 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR297WQ05899 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR297WQ05899 VPS60YDR486C 690 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR297WQ05899 SWC5YBR231C 912 nt11.62□□□□□ -0.55
YLR297WQ05899 ALG3YBL082C 1377 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR297WQ05899 RAX1YOR301W 1308 nt11.6□□□□□ -0.55
YLR297WQ05899 SWE1YJL187C 2460 nt11.58□□□□□ -0.56
YLR297WQ05899 YIR016WYIR016W 798 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR297WQ05899 BDH1YAL060W 1149 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR297WQ05899 BNA2YJR078W 1362 nt11.56□□□□□ -0.56
YLR297WQ05899 YLR415CYLR415C 339 nt11.52□□□□□ -0.57
YLR297WQ05899 MIC12YBR262C 321 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR297WQ05899 YSP3YOR003W 1437 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR297WQ05899 CCA1YER168C 1641 nt11.46□□□□□ -0.57
YLR297WQ05899 YDR094WYDR094W 336 nt11.44□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 UBX6YJL048C 1191 nt11.44□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 HHO1YPL127C 777 nt11.43□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 NVJ2YPR091C 2313 nt11.42□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 YFL066CYFL066C 1179 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 YFR018CYFR018C 1092 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 YNL115CYNL115C 1935 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 PEX25YPL112C 1185 nt11.4□□□□□ -0.58
YLR297WQ05899 XDJ1YLR090W 1380 nt11.38□□□□□ -0.59
YLR297WQ05899 PRE6YOL038W 765 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR297WQ05899 YJL225CYJL225C 5277 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR297WQ05899 YGR201CYGR201C 678 nt11.35□□□□□ -0.59
YLR297WQ05899 AGP1YCL025C 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
YLR297WQ05899 GDH3YAL062W 1374 nt11.32□□□□□ -0.6
YLR297WQ05899 SHM2YLR058C 1410 nt11.32□□□□□ -0.6
YLR297WQ05899 TIM17YJL143W 477 nt11.31□□□□□ -0.6
YLR297WQ05899 RRT5YFR032C 870 nt11.27□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 AVT6YER119C 1347 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 DUT1YBR252W 444 nt11.25□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 PAU16YKL224C 372 nt11.24□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 VPS75YNL246W 795 nt11.24□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 DUS1YML080W 1272 nt11.23□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 GOR1YNL274C 1053 nt11.22□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 FUR4YBR021W 1902 nt11.22□□□□□ -0.61
YLR297WQ05899 NIT1YIL164C 600 nt11.2□□□□□ -0.62
YLR297WQ05899 SGT2YOR007C 1041 nt11.18□□□□□ -0.62
YLR297WQ05899 YCL074WYCL074W 927 nt11.13□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 HSP60YLR259C 1719 nt11.12□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 GLK1YCL040W 1503 nt11.12□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 PAU7YAR020C 168 nt11.11□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 BOR1YNL275W 1731 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 DAT1YML113W 747 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 STR3YGL184C 1398 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.09□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.09□□□□□ -0.63
YLR297WQ05899 MIR1YJR077C 936 nt11.07□□□□□ -0.64
YLR297WQ05899 AQY2YLL052C 450 nt11.07□□□□□ -0.64
YLR297WQ05899 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR297WQ05899 YCR102CYCR102C 1107 nt11.04□□□□□ -0.64
YLR297WQ05899 SHB17YKR043C 816 nt11.01□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 NAT4YMR069W 858 nt11□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 PRP4YPR178W 1398 nt11□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 YDR010CYDR010C 333 nt10.99□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 THI74YDR438W 1113 nt10.99□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 YKR005CYKR005C 1578 nt10.98□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 NBP35YGL091C 987 nt10.97□□□□□ -0.65
YLR297WQ05899 UBA4YHR111W 1323 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR297WQ05899 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR297WQ05899 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR297WQ05899 MSF1YPR047W 1410 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR297WQ05899 YGR259CYGR259C 441 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR297WQ05899 DPS1YLL018C 1674 nt10.92□□□□□ -0.66
YLR297WQ05899 RET2YFR051C 1641 nt10.88□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 BMT6YLR063W 1098 nt10.88□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 YSR3YKR053C 1215 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 PHO89YBR296C 1725 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 RTN2YDL204W 1182 nt10.86□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 SHH4YLR164W 507 nt10.86□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 SFA1YDL168W 1161 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 TIR3YIL011W 810 nt10.84□□□□□ -0.67
YLR297WQ05899 YGL034CYGL034C 366 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR297WQ05899 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR297WQ05899 XYL2YLR070C 1071 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR297WQ05899 AAC1YMR056C 930 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR297WQ05899 ARP6YLR085C 1317 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR297WQ05899 PLB1YMR008C 1995 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR297WQ05899 PRO1YDR300C 1287 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 LSC2YGR244C 1284 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 POM34YLR018C 900 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR297WQ05899 IRC24YIR036C 792 nt10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms