Protein–RNA interactions for Protein: Q04779

RCO1, Transcriptional regulatory protein RCO1, yeastyeast

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCO1Q04779 TRM5YHR070W 1500 nt10.88□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 YDR094WYDR094W 336 nt10.87□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.86□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 WSC2YNL283C 1512 nt10.85□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 YPR064WYPR064W 420 nt10.85□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.84□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 YFL067WYFL067W 528 nt10.84□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 AHT1YHR093W 549 nt10.84□□□□□ -0.67
RCO1Q04779 DDR2YOL052C-A 186 nt10.81□□□□□ -0.68
RCO1Q04779 MIC10YCL057C-A 294 nt10.81□□□□□ -0.68
RCO1Q04779 HEM12YDR047W 1089 nt10.8□□□□□ -0.68
RCO1Q04779 TAD3YLR316C 969 nt10.79□□□□□ -0.68
RCO1Q04779 SNG1YGR197C 1644 nt10.79□□□□□ -0.68
RCO1Q04779 SPT8YLR055C 1809 nt10.77□□□□□ -0.68
RCO1Q04779 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.76□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 STB1YNL309W 1263 nt10.76□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.74□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 SPC25YER018C 666 nt10.74□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.72□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 ANP1YEL036C 1503 nt10.72□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 YFR018CYFR018C 1092 nt10.71□□□□□ -0.69
RCO1Q04779 GPI16YHR188C 1833 nt10.68□□□□□ -0.7
RCO1Q04779 CCT4YDL143W 1587 nt10.67□□□□□ -0.7
RCO1Q04779 FEN2YCR028C 1539 nt10.67□□□□□ -0.7
RCO1Q04779 VPS60YDR486C 690 nt10.66□□□□□ -0.7
RCO1Q04779 SWE1YJL187C 2460 nt10.64□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 RAX1YOR301W 1308 nt10.63□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 BDH1YAL060W 1149 nt10.63□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 ALG3YBL082C 1377 nt10.61□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 SWC5YBR231C 912 nt10.6□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 YSP3YOR003W 1437 nt10.59□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.59□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 YLR415CYLR415C 339 nt10.59□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 PEX25YPL112C 1185 nt10.59□□□□□ -0.71
RCO1Q04779 YIR016WYIR016W 798 nt10.58□□□□□ -0.72
RCO1Q04779 PAU16YKL224C 372 nt10.58□□□□□ -0.72
RCO1Q04779 PRE6YOL038W 765 nt10.58□□□□□ -0.72
RCO1Q04779 RRT5YFR032C 870 nt10.57□□□□□ -0.72
RCO1Q04779 BNA2YJR078W 1362 nt10.56□□□□□ -0.72
RCO1Q04779 MIC12YBR262C 321 nt10.54□□□□□ -0.72
RCO1Q04779 CCA1YER168C 1641 nt10.51□□□□□ -0.73
RCO1Q04779 YNL115CYNL115C 1935 nt10.51□□□□□ -0.73
RCO1Q04779 BOR1YNL275W 1731 nt10.49□□□□□ -0.73
RCO1Q04779 YFL066CYFL066C 1179 nt10.48□□□□□ -0.73
RCO1Q04779 HHO1YPL127C 777 nt10.45□□□□□ -0.74
RCO1Q04779 VPS75YNL246W 795 nt10.43□□□□□ -0.74
RCO1Q04779 AGP1YCL025C 1902 nt10.41□□□□□ -0.74
RCO1Q04779 XDJ1YLR090W 1380 nt10.39□□□□□ -0.75
RCO1Q04779 YGR201CYGR201C 678 nt10.38□□□□□ -0.75
RCO1Q04779 UME6YDR207C 2511 nt10.38□□□□□ -0.75
RCO1Q04779 TIM17YJL143W 477 nt10.36□□□□□ -0.75
RCO1Q04779 SHM2YLR058C 1410 nt10.34□□□□□ -0.75
RCO1Q04779 GDH3YAL062W 1374 nt10.34□□□□□ -0.75
RCO1Q04779 HSP60YLR259C 1719 nt10.32□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 MIR1YJR077C 936 nt10.31□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 FUR4YBR021W 1902 nt10.31□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 NAT4YMR069W 858 nt10.3□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 DUT1YBR252W 444 nt10.3□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 AVT6YER119C 1347 nt10.3□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 GLK1YCL040W 1503 nt10.28□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 DUS1YML080W 1272 nt10.28□□□□□ -0.76
RCO1Q04779 NIT1YIL164C 600 nt10.25□□□□□ -0.77
RCO1Q04779 GOR1YNL274C 1053 nt10.25□□□□□ -0.77
RCO1Q04779 THI74YDR438W 1113 nt10.24□□□□□ -0.77
RCO1Q04779 MSF1YPR047W 1410 nt10.24□□□□□ -0.77
RCO1Q04779 YCL074WYCL074W 927 nt10.21□□□□□ -0.77
RCO1Q04779 SGT2YOR007C 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
RCO1Q04779 PAU7YAR020C 168 nt10.2□□□□□ -0.78
RCO1Q04779 STR3YGL184C 1398 nt10.17□□□□□ -0.78
RCO1Q04779 DAT1YML113W 747 nt10.17□□□□□ -0.78
RCO1Q04779 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.17□□□□□ -0.78
RCO1Q04779 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.17□□□□□ -0.78
RCO1Q04779 SBA1YKL117W 651 nt10.15□□□□□ -0.78
RCO1Q04779 SHB17YKR043C 816 nt10.14□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 UBA4YHR111W 1323 nt10.13□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 AQY2YLL052C 450 nt10.13□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 ALG12YNR030W 1656 nt10.12□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 YDR010CYDR010C 333 nt10.11□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 PRP4YPR178W 1398 nt10.1□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 YCR102CYCR102C 1107 nt10.09□□□□□ -0.79
RCO1Q04779 YKR005CYKR005C 1578 nt10.08□□□□□ -0.8
RCO1Q04779 YSR3YKR053C 1215 nt10.06□□□□□ -0.8
RCO1Q04779 RET2YFR051C 1641 nt10.06□□□□□ -0.8
RCO1Q04779 YGL034CYGL034C 366 nt10.05□□□□□ -0.8
RCO1Q04779 NBP35YGL091C 987 nt10.04□□□□□ -0.8
RCO1Q04779 DPS1YLL018C 1674 nt10.03□□□□□ -0.8
RCO1Q04779 YGR259CYGR259C 441 nt10.02□□□□□ -0.81
RCO1Q04779 YCR087WYCR087W 516 nt10.01□□□□□ -0.81
RCO1Q04779 PHO89YBR296C 1725 nt9.99□□□□□ -0.81
RCO1Q04779 MCH5YOR306C 1566 nt9.98□□□□□ -0.81
RCO1Q04779 BMT6YLR063W 1098 nt9.98□□□□□ -0.81
RCO1Q04779 AAC1YMR056C 930 nt9.98□□□□□ -0.81
RCO1Q04779 XYL2YLR070C 1071 nt9.96□□□□□ -0.82
RCO1Q04779 RTN2YDL204W 1182 nt9.95□□□□□ -0.82
RCO1Q04779 AIM45YPR004C 1035 nt9.94□□□□□ -0.82
RCO1Q04779 SHH4YLR164W 507 nt9.93□□□□□ -0.82
RCO1Q04779 TIR3YIL011W 810 nt9.92□□□□□ -0.82
RCO1Q04779 SFA1YDL168W 1161 nt9.91□□□□□ -0.82
RCO1Q04779 ARP6YLR085C 1317 nt9.9□□□□□ -0.82
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