Protein–RNA interactions for Protein: Q04629

SWF1, Palmitoyltransferase SWF1, yeastyeast

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWF1Q04629 DDR2YOL052C-A 186 nt10.47□□□□□ -0.73
SWF1Q04629 HUA1YGR268C 597 nt10.45□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 AHT1YHR093W 549 nt10.44□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 HEM12YDR047W 1089 nt10.43□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 YPR064WYPR064W 420 nt10.43□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 WSC2YNL283C 1512 nt10.43□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 SNG1YGR197C 1644 nt10.41□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.41□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 MIC10YCL057C-A 294 nt10.41□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 SPC25YER018C 666 nt10.4□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 STB1YNL309W 1263 nt10.4□□□□□ -0.74
SWF1Q04629 SPT8YLR055C 1809 nt10.38□□□□□ -0.75
SWF1Q04629 YJL225CYJL225C 5277 nt10.38□□□□□ -0.75
SWF1Q04629 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.37□□□□□ -0.75
SWF1Q04629 ANP1YEL036C 1503 nt10.37□□□□□ -0.75
SWF1Q04629 TAD3YLR316C 969 nt10.36□□□□□ -0.75
SWF1Q04629 GPI16YHR188C 1833 nt10.35□□□□□ -0.75
SWF1Q04629 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.33□□□□□ -0.76
SWF1Q04629 CCT4YDL143W 1587 nt10.33□□□□□ -0.76
SWF1Q04629 FEN2YCR028C 1539 nt10.32□□□□□ -0.76
SWF1Q04629 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.31□□□□□ -0.76
SWF1Q04629 VPS60YDR486C 690 nt10.29□□□□□ -0.76
SWF1Q04629 RAX1YOR301W 1308 nt10.27□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 SWC5YBR231C 912 nt10.25□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 SWE1YJL187C 2460 nt10.24□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 ALG3YBL082C 1377 nt10.24□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 YIR016WYIR016W 798 nt10.23□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 BDH1YAL060W 1149 nt10.22□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 BNA2YJR078W 1362 nt10.22□□□□□ -0.77
SWF1Q04629 YLR415CYLR415C 339 nt10.18□□□□□ -0.78
SWF1Q04629 MIC12YBR262C 321 nt10.18□□□□□ -0.78
SWF1Q04629 YSP3YOR003W 1437 nt10.15□□□□□ -0.79
SWF1Q04629 CCA1YER168C 1641 nt10.13□□□□□ -0.79
SWF1Q04629 YDR094WYDR094W 336 nt10.11□□□□□ -0.79
SWF1Q04629 HHO1YPL127C 777 nt10.1□□□□□ -0.79
SWF1Q04629 BOR1YNL275W 1731 nt10.1□□□□□ -0.79
SWF1Q04629 YFR018CYFR018C 1092 nt10.09□□□□□ -0.79
SWF1Q04629 MCH5YOR306C 1566 nt10.08□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 PEX25YPL112C 1185 nt10.06□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 YNL115CYNL115C 1935 nt10.05□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 YGR201CYGR201C 678 nt10.05□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 UBX6YJL048C 1191 nt10.05□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 XDJ1YLR090W 1380 nt10.04□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 YFL066CYFL066C 1179 nt10.04□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.04□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.04□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 AGP1YCL025C 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
SWF1Q04629 TIM17YJL143W 477 nt9.99□□□□□ -0.81
SWF1Q04629 PRE6YOL038W 765 nt9.99□□□□□ -0.81
SWF1Q04629 GDH3YAL062W 1374 nt9.99□□□□□ -0.81
SWF1Q04629 SHM2YLR058C 1410 nt9.99□□□□□ -0.81
SWF1Q04629 VPS75YNL246W 795 nt9.95□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 RRT5YFR032C 870 nt9.94□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 AVT6YER119C 1347 nt9.93□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 FUR4YBR021W 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 GOR1YNL274C 1053 nt9.91□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 NIT1YIL164C 600 nt9.9□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 DUS1YML080W 1272 nt9.9□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 DUT1YBR252W 444 nt9.9□□□□□ -0.82
SWF1Q04629 PAU16YKL224C 372 nt9.89□□□□□ -0.83
SWF1Q04629 YCL074WYCL074W 927 nt9.86□□□□□ -0.83
SWF1Q04629 SGT2YOR007C 1041 nt9.86□□□□□ -0.83
SWF1Q04629 HSP60YLR259C 1719 nt9.85□□□□□ -0.83
SWF1Q04629 GLK1YCL040W 1503 nt9.83□□□□□ -0.84
SWF1Q04629 DAT1YML113W 747 nt9.83□□□□□ -0.84
SWF1Q04629 STR3YGL184C 1398 nt9.81□□□□□ -0.84
SWF1Q04629 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.8□□□□□ -0.84
SWF1Q04629 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.8□□□□□ -0.84
SWF1Q04629 PAU7YAR020C 168 nt9.79□□□□□ -0.84
SWF1Q04629 YCR102CYCR102C 1107 nt9.77□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 MIR1YJR077C 936 nt9.77□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 RPM1RPM1 483 nt9.77□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 AQY2YLL052C 450 nt9.75□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.74□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 PRP4YPR178W 1398 nt9.72□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 YKR005CYKR005C 1578 nt9.71□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 ALG12YNR030W 1656 nt9.71□□□□□ -0.85
SWF1Q04629 NBP35YGL091C 987 nt9.71□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 SHB17YKR043C 816 nt9.71□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 YDR010CYDR010C 333 nt9.7□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 THI74YDR438W 1113 nt9.7□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 NAT4YMR069W 858 nt9.7□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 DPS1YLL018C 1674 nt9.67□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 YGR259CYGR259C 441 nt9.66□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 MSF1YPR047W 1410 nt9.65□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 UBA4YHR111W 1323 nt9.65□□□□□ -0.86
SWF1Q04629 BMT6YLR063W 1098 nt9.63□□□□□ -0.87
SWF1Q04629 RTN2YDL204W 1182 nt9.62□□□□□ -0.87
SWF1Q04629 RET2YFR051C 1641 nt9.62□□□□□ -0.87
SWF1Q04629 TIR3YIL011W 810 nt9.6□□□□□ -0.87
SWF1Q04629 YSR3YKR053C 1215 nt9.58□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 ARP6YLR085C 1317 nt9.57□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 PHO89YBR296C 1725 nt9.57□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 SFA1YDL168W 1161 nt9.57□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 SHH4YLR164W 507 nt9.57□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 AAC1YMR056C 930 nt9.57□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 LSC2YGR244C 1284 nt9.55□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 YGL034CYGL034C 366 nt9.54□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 PLB1YMR008C 1995 nt9.54□□□□□ -0.88
SWF1Q04629 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 941.1 ms