Protein–RNA interactions for Protein: Q02863

UBP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, yeastyeast

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP16Q02863 TRM5YHR070W 1500 nt13.2□□□□□ -0.3
UBP16Q02863 GLK1YCL040W 1503 nt13.2□□□□□ -0.3
UBP16Q02863 SEC11YIR022W 504 nt13.18□□□□□ -0.3
UBP16Q02863 AQY1YPR192W 918 nt13.18□□□□□ -0.3
UBP16Q02863 YLR415CYLR415C 339 nt13.17□□□□□ -0.3
UBP16Q02863 ATF2YGR177C 1608 nt13.15□□□□□ -0.3
UBP16Q02863 PCH2YBR186W 1695 nt13.15□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 MSF1YPR047W 1410 nt13.14□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 NCP1YHR042W 2076 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 STB1YNL309W 1263 nt13.11□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 MIR1YJR077C 936 nt13.1□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 CCT4YDL143W 1587 nt13.09□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 THI74YDR438W 1113 nt13.09□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 GUT2YIL155C 1950 nt13.09□□□□□ -0.31
UBP16Q02863 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.06□□□□□ -0.32
UBP16Q02863 SPC25YER018C 666 nt13.05□□□□□ -0.32
UBP16Q02863 CRR1YLR213C 1269 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP16Q02863 ERF2YLR246W 1080 nt13.03□□□□□ -0.32
UBP16Q02863 DDR2YOL052C-A 186 nt13.03□□□□□ -0.32
UBP16Q02863 SWC5YBR231C 912 nt13.03□□□□□ -0.32
UBP16Q02863 YMR244WYMR244W 1068 nt13.02□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 VPS60YDR486C 690 nt13.01□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 LYS4YDR234W 2082 nt13□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 GPI16YHR188C 1833 nt12.99□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 ALG3YBL082C 1377 nt12.99□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 PIB2YGL023C 1908 nt12.99□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 YFL067WYFL067W 528 nt12.98□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 VPS75YNL246W 795 nt12.98□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 MIC10YCL057C-A 294 nt12.98□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.96□□□□□ -0.33
UBP16Q02863 SNG1YGR197C 1644 nt12.95□□□□□ -0.34
UBP16Q02863 DAT1YML113W 747 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP16Q02863 ANP1YEL036C 1503 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP16Q02863 FEN2YCR028C 1539 nt12.92□□□□□ -0.34
UBP16Q02863 RTF1YGL244W 1677 nt12.91□□□□□ -0.34
UBP16Q02863 BOP3YNL042W 1191 nt12.9□□□□□ -0.34
UBP16Q02863 SPT8YLR055C 1809 nt12.89□□□□□ -0.35
UBP16Q02863 HEM12YDR047W 1089 nt12.88□□□□□ -0.35
UBP16Q02863 GLR1YPL091W 1452 nt12.87□□□□□ -0.35
UBP16Q02863 PAU7YAR020C 168 nt12.86□□□□□ -0.35
UBP16Q02863 YGL034CYGL034C 366 nt12.84□□□□□ -0.35
UBP16Q02863 UBA4YHR111W 1323 nt12.81□□□□□ -0.36
UBP16Q02863 YIR016WYIR016W 798 nt12.8□□□□□ -0.36
UBP16Q02863 PTK1YKL198C 1989 nt12.78□□□□□ -0.36
UBP16Q02863 SHB17YKR043C 816 nt12.77□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 RBG2YGR173W 1107 nt12.75□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 NDI1YML120C 1542 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 TIM17YJL143W 477 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 YSR3YKR053C 1215 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 XYL2YLR070C 1071 nt12.73□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 RBG1YAL036C 1110 nt12.72□□□□□ -0.37
UBP16Q02863 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.69□□□□□ -0.38
UBP16Q02863 SHM2YLR058C 1410 nt12.68□□□□□ -0.38
UBP16Q02863 YDR010CYDR010C 333 nt12.65□□□□□ -0.38
UBP16Q02863 XDJ1YLR090W 1380 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP16Q02863 SGT2YOR007C 1041 nt12.61□□□□□ -0.39
UBP16Q02863 MIC12YBR262C 321 nt12.6□□□□□ -0.39
UBP16Q02863 PHO89YBR296C 1725 nt12.58□□□□□ -0.4
UBP16Q02863 NIT1YIL164C 600 nt12.57□□□□□ -0.4
UBP16Q02863 BNA2YJR078W 1362 nt12.56□□□□□ -0.4
UBP16Q02863 YFL054CYFL054C 1941 nt12.56□□□□□ -0.4
UBP16Q02863 RAX1YOR301W 1308 nt12.55□□□□□ -0.4
UBP16Q02863 RET2YFR051C 1641 nt12.52□□□□□ -0.4
UBP16Q02863 AIM45YPR004C 1035 nt12.51□□□□□ -0.41
UBP16Q02863 GDH3YAL062W 1374 nt12.51□□□□□ -0.41
UBP16Q02863 YCR087WYCR087W 516 nt12.48□□□□□ -0.41
UBP16Q02863 HHO1YPL127C 777 nt12.46□□□□□ -0.41
UBP16Q02863 YMR226CYMR226C 804 nt12.44□□□□□ -0.42
UBP16Q02863 DUT1YBR252W 444 nt12.43□□□□□ -0.42
UBP16Q02863 SAM1YLR180W 1149 nt12.42□□□□□ -0.42
UBP16Q02863 AGP1YCL025C 1902 nt12.41□□□□□ -0.42
UBP16Q02863 YGR201CYGR201C 678 nt12.4□□□□□ -0.42
UBP16Q02863 MRP20YDR405W 792 nt12.39□□□□□ -0.43
UBP16Q02863 COQ2YNR041C 1119 nt12.39□□□□□ -0.43
UBP16Q02863 AVT6YER119C 1347 nt12.38□□□□□ -0.43
UBP16Q02863 CCA1YER168C 1641 nt12.38□□□□□ -0.43
UBP16Q02863 RAD51YER095W 1203 nt12.35□□□□□ -0.43
UBP16Q02863 YLR111WYLR111W 333 nt12.33□□□□□ -0.44
UBP16Q02863 SWE1YJL187C 2460 nt12.31□□□□□ -0.44
UBP16Q02863 SFA1YDL168W 1161 nt12.3□□□□□ -0.44
UBP16Q02863 GOR1YNL274C 1053 nt12.26□□□□□ -0.45
UBP16Q02863 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.24□□□□□ -0.45
UBP16Q02863 SDH5YOL071W 489 nt12.22□□□□□ -0.45
UBP16Q02863 YCR102CYCR102C 1107 nt12.18□□□□□ -0.46
UBP16Q02863 RPL4BYDR012W 1089 nt12.18□□□□□ -0.46
UBP16Q02863 RPM1RPM1 483 nt12.18□□□□□ -0.46
UBP16Q02863 RPL4AYBR031W 1089 nt12.18□□□□□ -0.46
UBP16Q02863 SHH4YLR164W 507 nt12.17□□□□□ -0.46
UBP16Q02863 CAB5YDR196C 726 nt12.15□□□□□ -0.46
UBP16Q02863 RPS14BYJL191W 417 nt12.14□□□□□ -0.47
UBP16Q02863 YNR029CYNR029C 1290 nt12.13□□□□□ -0.47
UBP16Q02863 NBP35YGL091C 987 nt12.1□□□□□ -0.47
UBP16Q02863 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.1□□□□□ -0.47
UBP16Q02863 STE4YOR212W 1272 nt12.09□□□□□ -0.47
UBP16Q02863 RAD23YEL037C 1197 nt12.08□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 CLB6YGR109C 1143 nt12.08□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 DUS1YML080W 1272 nt12.08□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.08□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.08□□□□□ -0.48
UBP16Q02863 YLR349WYLR349W 507 nt12.07□□□□□ -0.48
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