Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gjb4Q02738 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Gjb4Q02738 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gjb4Q02738 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gjb4Q02738 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gjb4Q02738 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gjb4Q02738 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gjb4Q02738 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gjb4Q02738 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gjb4Q02738 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gjb4Q02738 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gjb4Q02738 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gjb4Q02738 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gjb4Q02738 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gjb4Q02738 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gjb4Q02738 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gjb4Q02738 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gjb4Q02738 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Gjb4Q02738 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gjb4Q02738 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gjb4Q02738 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gjb4Q02738 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gjb4Q02738 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gjb4Q02738 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gjb4Q02738 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Gjb4Q02738 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gjb4Q02738 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjb4Q02738 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb4Q02738 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gjb4Q02738 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gjb4Q02738 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gjb4Q02738 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gjb4Q02738 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb4Q02738 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjb4Q02738 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjb4Q02738 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb4Q02738 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb4Q02738 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjb4Q02738 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gjb4Q02738 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjb4Q02738 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gjb4Q02738 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjb4Q02738 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjb4Q02738 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms