Protein–RNA interactions for Protein: Q02629

NUP100, Nucleoporin NUP100/NSP100, yeastyeast

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Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP100Q02629 PAC11YDR488C 1602 nt11.01□□□□□ -0.65
NUP100Q02629 TAD3YLR316C 969 nt10.98□□□□□ -0.65
NUP100Q02629 STB1YNL309W 1263 nt10.97□□□□□ -0.65
NUP100Q02629 HEM12YDR047W 1089 nt10.96□□□□□ -0.65
NUP100Q02629 MIC10YCL057C-A 294 nt10.96□□□□□ -0.65
NUP100Q02629 SNG1YGR197C 1644 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 SPC25YER018C 666 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.95□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 YFL054CYFL054C 1941 nt10.92□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 CCT4YDL143W 1587 nt10.9□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 ANP1YEL036C 1503 nt10.9□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 GPI16YHR188C 1833 nt10.9□□□□□ -0.66
NUP100Q02629 UBX6YJL048C 1191 nt10.88□□□□□ -0.67
NUP100Q02629 VPS60YDR486C 690 nt10.87□□□□□ -0.67
NUP100Q02629 FEN2YCR028C 1539 nt10.87□□□□□ -0.67
NUP100Q02629 YDR094WYDR094W 336 nt10.84□□□□□ -0.67
NUP100Q02629 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.84□□□□□ -0.67
NUP100Q02629 ALG3YBL082C 1377 nt10.83□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 BDH1YAL060W 1149 nt10.83□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 SWC5YBR231C 912 nt10.83□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 Q0182Q0182 405 nt10.82□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 SPT8YLR055C 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 YIR016WYIR016W 798 nt10.78□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 YLR415CYLR415C 339 nt10.78□□□□□ -0.68
NUP100Q02629 YSP3YOR003W 1437 nt10.76□□□□□ -0.69
NUP100Q02629 YFR018CYFR018C 1092 nt10.76□□□□□ -0.69
NUP100Q02629 RAX1YOR301W 1308 nt10.75□□□□□ -0.69
NUP100Q02629 YFL066CYFL066C 1179 nt10.71□□□□□ -0.69
NUP100Q02629 BNA2YJR078W 1362 nt10.71□□□□□ -0.69
NUP100Q02629 PRE6YOL038W 765 nt10.71□□□□□ -0.69
NUP100Q02629 PEX25YPL112C 1185 nt10.7□□□□□ -0.7
NUP100Q02629 YNL115CYNL115C 1935 nt10.7□□□□□ -0.7
NUP100Q02629 MIC12YBR262C 321 nt10.68□□□□□ -0.7
NUP100Q02629 SWE1YJL187C 2460 nt10.67□□□□□ -0.7
NUP100Q02629 NVJ2YPR091C 2313 nt10.63□□□□□ -0.71
NUP100Q02629 PAU16YKL224C 372 nt10.62□□□□□ -0.71
NUP100Q02629 RRT5YFR032C 870 nt10.61□□□□□ -0.71
NUP100Q02629 CCA1YER168C 1641 nt10.61□□□□□ -0.71
NUP100Q02629 HHO1YPL127C 777 nt10.6□□□□□ -0.71
NUP100Q02629 XDJ1YLR090W 1380 nt10.59□□□□□ -0.71
NUP100Q02629 TIM17YJL143W 477 nt10.56□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 SHM2YLR058C 1410 nt10.56□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 YGR201CYGR201C 678 nt10.54□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 GDH3YAL062W 1374 nt10.53□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 AGP1YCL025C 1902 nt10.53□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.53□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 VPS75YNL246W 795 nt10.53□□□□□ -0.72
NUP100Q02629 AVT6YER119C 1347 nt10.48□□□□□ -0.73
NUP100Q02629 NIT1YIL164C 600 nt10.46□□□□□ -0.73
NUP100Q02629 DUT1YBR252W 444 nt10.46□□□□□ -0.73
NUP100Q02629 SGT2YOR007C 1041 nt10.44□□□□□ -0.74
NUP100Q02629 MIR1YJR077C 936 nt10.42□□□□□ -0.74
NUP100Q02629 GOR1YNL274C 1053 nt10.41□□□□□ -0.74
NUP100Q02629 PAU7YAR020C 168 nt10.39□□□□□ -0.75
NUP100Q02629 GLK1YCL040W 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
NUP100Q02629 DUS1YML080W 1272 nt10.38□□□□□ -0.75
NUP100Q02629 NAT4YMR069W 858 nt10.36□□□□□ -0.75
NUP100Q02629 THI74YDR438W 1113 nt10.35□□□□□ -0.75
NUP100Q02629 DAT1YML113W 747 nt10.34□□□□□ -0.75
NUP100Q02629 FUR4YBR021W 1902 nt10.33□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 SHB17YKR043C 816 nt10.33□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 MSF1YPR047W 1410 nt10.31□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 YDR010CYDR010C 333 nt10.3□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 STR3YGL184C 1398 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 YCL074WYCL074W 927 nt10.29□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 YJL225CYJL225C 5277 nt10.28□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 UBA4YHR111W 1323 nt10.28□□□□□ -0.76
NUP100Q02629 YCR102CYCR102C 1107 nt10.27□□□□□ -0.77
NUP100Q02629 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.27□□□□□ -0.77
NUP100Q02629 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.27□□□□□ -0.77
NUP100Q02629 AQY2YLL052C 450 nt10.25□□□□□ -0.77
NUP100Q02629 NBP35YGL091C 987 nt10.22□□□□□ -0.77
NUP100Q02629 HSP60YLR259C 1719 nt10.21□□□□□ -0.78
NUP100Q02629 YSR3YKR053C 1215 nt10.2□□□□□ -0.78
NUP100Q02629 RET2YFR051C 1641 nt10.19□□□□□ -0.78
NUP100Q02629 YGL034CYGL034C 366 nt10.18□□□□□ -0.78
NUP100Q02629 PHO89YBR296C 1725 nt10.17□□□□□ -0.78
NUP100Q02629 XYL2YLR070C 1071 nt10.16□□□□□ -0.78
NUP100Q02629 SFA1YDL168W 1161 nt10.14□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 SHH4YLR164W 507 nt10.14□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 BOR1YNL275W 1731 nt10.13□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 SBA1YKL117W 651 nt10.13□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 YKR005CYKR005C 1578 nt10.11□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 TIR3YIL011W 810 nt10.11□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.1□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 PRP4YPR178W 1398 nt10.1□□□□□ -0.79
NUP100Q02629 COQ2YNR041C 1119 nt10.08□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 YCR087WYCR087W 516 nt10.07□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 YGR259CYGR259C 441 nt10.07□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 RTN2YDL204W 1182 nt10.05□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 MRP20YDR405W 792 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 ARP6YLR085C 1317 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 DPS1YLL018C 1674 nt10.03□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 RBG1YAL036C 1110 nt10.03□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 POM34YLR018C 900 nt10.03□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 AIM45YPR004C 1035 nt10.03□□□□□ -0.8
NUP100Q02629 PRO1YDR300C 1287 nt10.02□□□□□ -0.81
NUP100Q02629 LSC2YGR244C 1284 nt10.01□□□□□ -0.81
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