Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uba1Q02053 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uba1Q02053 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Uba1Q02053 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uba1Q02053 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uba1Q02053 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uba1Q02053 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uba1Q02053 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uba1Q02053 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uba1Q02053 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uba1Q02053 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Uba1Q02053 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uba1Q02053 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uba1Q02053 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uba1Q02053 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uba1Q02053 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uba1Q02053 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uba1Q02053 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uba1Q02053 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uba1Q02053 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uba1Q02053 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uba1Q02053 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uba1Q02053 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uba1Q02053 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Uba1Q02053 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uba1Q02053 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uba1Q02053 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Uba1Q02053 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Uba1Q02053 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uba1Q02053 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uba1Q02053 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uba1Q02053 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uba1Q02053 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Uba1Q02053 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uba1Q02053 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uba1Q02053 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Uba1Q02053 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uba1Q02053 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uba1Q02053 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uba1Q02053 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uba1Q02053 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uba1Q02053 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Uba1Q02053 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uba1Q02053 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uba1Q02053 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Uba1Q02053 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms