Protein–RNA interactions for Protein: Q01846

MDM1, Structural protein MDM1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDM1Q01846 BOP3YNL042W 1191 nt12.39□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.38□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 YFL067WYFL067W 528 nt12.38□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 PRE6YOL038W 765 nt12.38□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 SPC25YER018C 666 nt12.37□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 CRR1YLR213C 1269 nt12.37□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 RTF1YGL244W 1677 nt12.37□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.36□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 PIB2YGL023C 1908 nt12.36□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 CCT4YDL143W 1587 nt12.35□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 PAU16YKL224C 372 nt12.34□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 BDH1YAL060W 1149 nt12.34□□□□□ -0.43
MDM1Q01846 LYS4YDR234W 2082 nt12.33□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.32□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 YFL066CYFL066C 1179 nt12.32□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 GPI16YHR188C 1833 nt12.31□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 RRT5YFR032C 870 nt12.3□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 VPS60YDR486C 690 nt12.29□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 YSP3YOR003W 1437 nt12.28□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 YLR415CYLR415C 339 nt12.28□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 SNG1YGR197C 1644 nt12.27□□□□□ -0.44
MDM1Q01846 MIC10YCL057C-A 294 nt12.27□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 HEM12YDR047W 1089 nt12.26□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 PEX25YPL112C 1185 nt12.26□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 SWC5YBR231C 912 nt12.26□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 FEN2YCR028C 1539 nt12.26□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 ANP1YEL036C 1503 nt12.26□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 ALG3YBL082C 1377 nt12.24□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 YNL115CYNL115C 1935 nt12.23□□□□□ -0.45
MDM1Q01846 PTK1YKL198C 1989 nt12.19□□□□□ -0.46
MDM1Q01846 YIR016WYIR016W 798 nt12.15□□□□□ -0.46
MDM1Q01846 PAC11YDR488C 1602 nt12.12□□□□□ -0.47
MDM1Q01846 SPT8YLR055C 1809 nt12.08□□□□□ -0.48
MDM1Q01846 NVJ2YPR091C 2313 nt12.08□□□□□ -0.48
MDM1Q01846 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.07□□□□□ -0.48
MDM1Q01846 VPS75YNL246W 795 nt12.03□□□□□ -0.48
MDM1Q01846 YFL054CYFL054C 1941 nt12.02□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 BNA2YJR078W 1362 nt12.02□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 NAT4YMR069W 858 nt12□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 GLK1YCL040W 1503 nt12□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 RAX1YOR301W 1308 nt11.99□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 TIM17YJL143W 477 nt11.97□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 MIR1YJR077C 936 nt11.97□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 SBA1YKL117W 651 nt11.97□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 MIC12YBR262C 321 nt11.97□□□□□ -0.49
MDM1Q01846 XDJ1YLR090W 1380 nt11.95□□□□□ -0.5
MDM1Q01846 SHM2YLR058C 1410 nt11.94□□□□□ -0.5
MDM1Q01846 THI74YDR438W 1113 nt11.92□□□□□ -0.5
MDM1Q01846 MSF1YPR047W 1410 nt11.91□□□□□ -0.5
MDM1Q01846 HHO1YPL127C 777 nt11.9□□□□□ -0.5
MDM1Q01846 PAU7YAR020C 168 nt11.89□□□□□ -0.51
MDM1Q01846 GDH3YAL062W 1374 nt11.89□□□□□ -0.51
MDM1Q01846 NIT1YIL164C 600 nt11.84□□□□□ -0.51
MDM1Q01846 YGR201CYGR201C 678 nt11.82□□□□□ -0.52
MDM1Q01846 DAT1YML113W 747 nt11.82□□□□□ -0.52
MDM1Q01846 SGT2YOR007C 1041 nt11.82□□□□□ -0.52
MDM1Q01846 SHB17YKR043C 816 nt11.8□□□□□ -0.52
MDM1Q01846 RPM1RPM1 483 nt11.8□□□□□ -0.52
MDM1Q01846 UBA4YHR111W 1323 nt11.78□□□□□ -0.52
MDM1Q01846 CCA1YER168C 1641 nt11.77□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 AVT6YER119C 1347 nt11.77□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 SWE1YJL187C 2460 nt11.76□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 YDR010CYDR010C 333 nt11.74□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 AGP1YCL025C 1902 nt11.74□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 DUT1YBR252W 444 nt11.73□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 YGL034CYGL034C 366 nt11.72□□□□□ -0.53
MDM1Q01846 YSR3YKR053C 1215 nt11.7□□□□□ -0.54
MDM1Q01846 GOR1YNL274C 1053 nt11.7□□□□□ -0.54
MDM1Q01846 XYL2YLR070C 1071 nt11.66□□□□□ -0.54
MDM1Q01846 PHO89YBR296C 1725 nt11.63□□□□□ -0.55
MDM1Q01846 RET2YFR051C 1641 nt11.63□□□□□ -0.55
MDM1Q01846 YCR102CYCR102C 1107 nt11.59□□□□□ -0.55
MDM1Q01846 RBG1YAL036C 1110 nt11.58□□□□□ -0.56
MDM1Q01846 YMR244WYMR244W 1068 nt11.56□□□□□ -0.56
MDM1Q01846 NDI1YML120C 1542 nt11.55□□□□□ -0.56
MDM1Q01846 DUS1YML080W 1272 nt11.55□□□□□ -0.56
MDM1Q01846 GLR1YPL091W 1452 nt11.53□□□□□ -0.56
MDM1Q01846 YCR087WYCR087W 516 nt11.53□□□□□ -0.56
MDM1Q01846 SFA1YDL168W 1161 nt11.52□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 COQ2YNR041C 1119 nt11.5□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 AIM45YPR004C 1035 nt11.5□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 MRP20YDR405W 792 nt11.48□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 NBP35YGL091C 987 nt11.48□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 STR3YGL184C 1398 nt11.47□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.46□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 AQY2YLL052C 450 nt11.46□□□□□ -0.57
MDM1Q01846 SHH4YLR164W 507 nt11.44□□□□□ -0.58
MDM1Q01846 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.44□□□□□ -0.58
MDM1Q01846 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.44□□□□□ -0.58
MDM1Q01846 YCL074WYCL074W 927 nt11.42□□□□□ -0.58
MDM1Q01846 TIR3YIL011W 810 nt11.4□□□□□ -0.58
MDM1Q01846 FRE6YLL051C 2139 nt11.37□□□□□ -0.59
MDM1Q01846 FUR4YBR021W 1902 nt11.37□□□□□ -0.59
MDM1Q01846 YJL225CYJL225C 5277 nt11.36□□□□□ -0.59
MDM1Q01846 BOR1YNL275W 1731 nt11.35□□□□□ -0.59
MDM1Q01846 TOM6YOR045W 186 nt11.35□□□□□ -0.59
MDM1Q01846 RBG2YGR173W 1107 nt11.34□□□□□ -0.59
MDM1Q01846 POM34YLR018C 900 nt11.33□□□□□ -0.6
MDM1Q01846 RPL4BYDR012W 1089 nt11.32□□□□□ -0.6
MDM1Q01846 RPL4AYBR031W 1089 nt11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms