Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd1Q01822 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd1Q01822 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd1Q01822 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd1Q01822 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd1Q01822 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd1Q01822 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd1Q01822 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxd1Q01822 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd1Q01822 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd1Q01822 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd1Q01822 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxd1Q01822 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd1Q01822 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd1Q01822 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxd1Q01822 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1Q01822 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxd1Q01822 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxd1Q01822 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd1Q01822 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd1Q01822 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms