Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Capza3P70190 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Capza3P70190 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capza3P70190 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capza3P70190 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Capza3P70190 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Capza3P70190 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capza3P70190 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capza3P70190 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Capza3P70190 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capza3P70190 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Capza3P70190 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capza3P70190 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capza3P70190 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Capza3P70190 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Capza3P70190 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Capza3P70190 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Capza3P70190 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capza3P70190 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capza3P70190 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Capza3P70190 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capza3P70190 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capza3P70190 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capza3P70190 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capza3P70190 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Capza3P70190 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capza3P70190 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capza3P70190 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capza3P70190 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Capza3P70190 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Capza3P70190 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capza3P70190 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Capza3P70190 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Capza3P70190 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 806.5 ms