Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab8bP61028 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab8bP61028 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab8bP61028 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab8bP61028 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab8bP61028 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab8bP61028 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab8bP61028 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab8bP61028 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab8bP61028 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab8bP61028 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab8bP61028 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab8bP61028 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab8bP61028 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab8bP61028 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab8bP61028 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab8bP61028 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab8bP61028 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab8bP61028 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab8bP61028 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab8bP61028 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab8bP61028 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab8bP61028 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab8bP61028 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab8bP61028 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab8bP61028 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab8bP61028 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab8bP61028 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab8bP61028 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab8bP61028 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab8bP61028 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab8bP61028 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab8bP61028 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab8bP61028 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab8bP61028 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab8bP61028 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab8bP61028 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab8bP61028 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms