Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tlr7P58681 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tlr7P58681 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tlr7P58681 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tlr7P58681 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Tlr7P58681 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Tlr7P58681 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tlr7P58681 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Tlr7P58681 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tlr7P58681 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tlr7P58681 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Tlr7P58681 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Tlr7P58681 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Tlr7P58681 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Tlr7P58681 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Tlr7P58681 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Tlr7P58681 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Tlr7P58681 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Tlr7P58681 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tlr7P58681 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tlr7P58681 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tlr7P58681 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Tlr7P58681 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tlr7P58681 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Tlr7P58681 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Tlr7P58681 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tlr7P58681 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Tlr7P58681 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Tlr7P58681 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tlr7P58681 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tlr7P58681 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tlr7P58681 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tlr7P58681 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tlr7P58681 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tlr7P58681 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tlr7P58681 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tlr7P58681 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Tlr7P58681 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tlr7P58681 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tlr7P58681 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Tlr7P58681 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tlr7P58681 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tlr7P58681 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tlr7P58681 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tlr7P58681 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Tlr7P58681 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tlr7P58681 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms