Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5EP56381 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5EP56381 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5EP56381 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP5EP56381 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5EP56381 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5EP56381 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5EP56381 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5EP56381 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5EP56381 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms