Protein–RNA interactions for Protein: P53894

CBK1, Serine/threonine-protein kinase CBK1, yeastyeast

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBK1P53894 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.15□□□□□ -0.46
CBK1P53894 TAD3YLR316C 969 nt12.15□□□□□ -0.46
CBK1P53894 DDR2YOL052C-A 186 nt12.15□□□□□ -0.46
CBK1P53894 UBX6YJL048C 1191 nt12.12□□□□□ -0.47
CBK1P53894 STB1YNL309W 1263 nt12.12□□□□□ -0.47
CBK1P53894 SPC25YER018C 666 nt12.1□□□□□ -0.47
CBK1P53894 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.09□□□□□ -0.47
CBK1P53894 SNG1YGR197C 1644 nt12.08□□□□□ -0.48
CBK1P53894 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.08□□□□□ -0.48
CBK1P53894 HEM12YDR047W 1089 nt12.08□□□□□ -0.48
CBK1P53894 MIC10YCL057C-A 294 nt12.08□□□□□ -0.48
CBK1P53894 YDR094WYDR094W 336 nt12.07□□□□□ -0.48
CBK1P53894 CCT4YDL143W 1587 nt12.05□□□□□ -0.48
CBK1P53894 GPI16YHR188C 1833 nt12.04□□□□□ -0.48
CBK1P53894 ANP1YEL036C 1503 nt12.04□□□□□ -0.48
CBK1P53894 VPS60YDR486C 690 nt12.01□□□□□ -0.49
CBK1P53894 FEN2YCR028C 1539 nt12.01□□□□□ -0.49
CBK1P53894 YFL054CYFL054C 1941 nt11.99□□□□□ -0.49
CBK1P53894 BDH1YAL060W 1149 nt11.99□□□□□ -0.49
CBK1P53894 SWC5YBR231C 912 nt11.98□□□□□ -0.49
CBK1P53894 ALG3YBL082C 1377 nt11.95□□□□□ -0.5
CBK1P53894 YFR018CYFR018C 1092 nt11.94□□□□□ -0.5
CBK1P53894 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.94□□□□□ -0.5
CBK1P53894 YLR415CYLR415C 339 nt11.93□□□□□ -0.5
CBK1P53894 YSP3YOR003W 1437 nt11.91□□□□□ -0.5
CBK1P53894 YIR016WYIR016W 798 nt11.89□□□□□ -0.51
CBK1P53894 PRE6YOL038W 765 nt11.88□□□□□ -0.51
CBK1P53894 YFL066CYFL066C 1179 nt11.87□□□□□ -0.51
CBK1P53894 PEX25YPL112C 1185 nt11.87□□□□□ -0.51
CBK1P53894 SPT8YLR055C 1809 nt11.86□□□□□ -0.51
CBK1P53894 RAX1YOR301W 1308 nt11.86□□□□□ -0.51
CBK1P53894 YNL115CYNL115C 1935 nt11.85□□□□□ -0.51
CBK1P53894 BNA2YJR078W 1362 nt11.83□□□□□ -0.52
CBK1P53894 RRT5YFR032C 870 nt11.81□□□□□ -0.52
CBK1P53894 PAU16YKL224C 372 nt11.81□□□□□ -0.52
CBK1P53894 MIC12YBR262C 321 nt11.79□□□□□ -0.52
CBK1P53894 SWE1YJL187C 2460 nt11.74□□□□□ -0.53
CBK1P53894 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.73□□□□□ -0.53
CBK1P53894 XDJ1YLR090W 1380 nt11.7□□□□□ -0.54
CBK1P53894 HHO1YPL127C 777 nt11.69□□□□□ -0.54
CBK1P53894 TIM17YJL143W 477 nt11.68□□□□□ -0.54
CBK1P53894 VPS75YNL246W 795 nt11.68□□□□□ -0.54
CBK1P53894 CCA1YER168C 1641 nt11.68□□□□□ -0.54
CBK1P53894 SHM2YLR058C 1410 nt11.67□□□□□ -0.54
CBK1P53894 YGR201CYGR201C 678 nt11.65□□□□□ -0.54
CBK1P53894 GDH3YAL062W 1374 nt11.63□□□□□ -0.55
CBK1P53894 AGP1YCL025C 1902 nt11.6□□□□□ -0.55
CBK1P53894 NIT1YIL164C 600 nt11.56□□□□□ -0.56
CBK1P53894 MIR1YJR077C 936 nt11.55□□□□□ -0.56
CBK1P53894 PAC11YDR488C 1602 nt11.55□□□□□ -0.56
CBK1P53894 AVT6YER119C 1347 nt11.55□□□□□ -0.56
CBK1P53894 SGT2YOR007C 1041 nt11.54□□□□□ -0.56
CBK1P53894 NAT4YMR069W 858 nt11.53□□□□□ -0.56
CBK1P53894 GLK1YCL040W 1503 nt11.53□□□□□ -0.56
CBK1P53894 PAU7YAR020C 168 nt11.52□□□□□ -0.57
CBK1P53894 DUT1YBR252W 444 nt11.51□□□□□ -0.57
CBK1P53894 GOR1YNL274C 1053 nt11.5□□□□□ -0.57
CBK1P53894 THI74YDR438W 1113 nt11.48□□□□□ -0.57
CBK1P53894 YJL225CYJL225C 5277 nt11.45□□□□□ -0.58
CBK1P53894 MSF1YPR047W 1410 nt11.44□□□□□ -0.58
CBK1P53894 DUS1YML080W 1272 nt11.44□□□□□ -0.58
CBK1P53894 DAT1YML113W 747 nt11.44□□□□□ -0.58
CBK1P53894 SHB17YKR043C 816 nt11.43□□□□□ -0.58
CBK1P53894 YDR010CYDR010C 333 nt11.39□□□□□ -0.59
CBK1P53894 UBA4YHR111W 1323 nt11.38□□□□□ -0.59
CBK1P53894 FUR4YBR021W 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
CBK1P53894 YCR102CYCR102C 1107 nt11.35□□□□□ -0.59
CBK1P53894 YCL074WYCL074W 927 nt11.34□□□□□ -0.59
CBK1P53894 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.32□□□□□ -0.6
CBK1P53894 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.32□□□□□ -0.6
CBK1P53894 STR3YGL184C 1398 nt11.32□□□□□ -0.6
CBK1P53894 YSR3YKR053C 1215 nt11.31□□□□□ -0.6
CBK1P53894 SBA1YKL117W 651 nt11.3□□□□□ -0.6
CBK1P53894 RET2YFR051C 1641 nt11.3□□□□□ -0.6
CBK1P53894 AQY2YLL052C 450 nt11.29□□□□□ -0.6
CBK1P53894 YGL034CYGL034C 366 nt11.28□□□□□ -0.6
CBK1P53894 NVJ2YPR091C 2313 nt11.27□□□□□ -0.6
CBK1P53894 PHO89YBR296C 1725 nt11.26□□□□□ -0.61
CBK1P53894 NBP35YGL091C 987 nt11.26□□□□□ -0.61
CBK1P53894 XYL2YLR070C 1071 nt11.24□□□□□ -0.61
CBK1P53894 SFA1YDL168W 1161 nt11.21□□□□□ -0.61
CBK1P53894 HSP60YLR259C 1719 nt11.2□□□□□ -0.62
CBK1P53894 YCR087WYCR087W 516 nt11.19□□□□□ -0.62
CBK1P53894 SHH4YLR164W 507 nt11.18□□□□□ -0.62
CBK1P53894 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.17□□□□□ -0.62
CBK1P53894 TIR3YIL011W 810 nt11.16□□□□□ -0.62
CBK1P53894 COQ2YNR041C 1119 nt11.14□□□□□ -0.63
CBK1P53894 RBG1YAL036C 1110 nt11.13□□□□□ -0.63
CBK1P53894 AIM45YPR004C 1035 nt11.13□□□□□ -0.63
CBK1P53894 MRP20YDR405W 792 nt11.12□□□□□ -0.63
CBK1P53894 YKR005CYKR005C 1578 nt11.11□□□□□ -0.63
CBK1P53894 BOR1YNL275W 1731 nt11.1□□□□□ -0.63
CBK1P53894 NDI1YML120C 1542 nt11.09□□□□□ -0.63
CBK1P53894 PRP4YPR178W 1398 nt11.09□□□□□ -0.63
CBK1P53894 RTN2YDL204W 1182 nt11.09□□□□□ -0.63
CBK1P53894 YGR259CYGR259C 441 nt11.08□□□□□ -0.64
CBK1P53894 POM34YLR018C 900 nt11.07□□□□□ -0.64
CBK1P53894 ARP6YLR085C 1317 nt11.07□□□□□ -0.64
CBK1P53894 PRO1YDR300C 1287 nt11.06□□□□□ -0.64
CBK1P53894 LSC2YGR244C 1284 nt11.06□□□□□ -0.64
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