Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 FUR4YBR021W 1902 nt10.23□□□□□ -0.77
SNF12P53628 GAL1YBR020W 1587 nt10.2□□□□□ -0.78
SNF12P53628 TRM5YHR070W 1500 nt10.19□□□□□ -0.78
SNF12P53628 RAX1YOR301W 1308 nt10.19□□□□□ -0.78
SNF12P53628 YFL067WYFL067W 528 nt10.19□□□□□ -0.78
SNF12P53628 DIC1YLR348C 897 nt10.18□□□□□ -0.78
SNF12P53628 NAR1YNL240C 1476 nt10.14□□□□□ -0.79
SNF12P53628 DDR2YOL052C-A 186 nt10.12□□□□□ -0.79
SNF12P53628 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.11□□□□□ -0.79
SNF12P53628 ANP1YEL036C 1503 nt10.1□□□□□ -0.79
SNF12P53628 PTH1YHR189W 573 nt10.07□□□□□ -0.8
SNF12P53628 AAC1YMR056C 930 nt10.07□□□□□ -0.8
SNF12P53628 FRE6YLL051C 2139 nt10.06□□□□□ -0.8
SNF12P53628 PRP4YPR178W 1398 nt10.06□□□□□ -0.8
SNF12P53628 RTG1YOL067C 534 nt10.06□□□□□ -0.8
SNF12P53628 AGP1YCL025C 1902 nt10.04□□□□□ -0.8
SNF12P53628 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.04□□□□□ -0.8
SNF12P53628 YEL076CYEL076C 651 nt10.04□□□□□ -0.8
SNF12P53628 YLR235CYLR235C 399 nt10.04□□□□□ -0.8
SNF12P53628 YLR464WYLR464W 651 nt10.04□□□□□ -0.8
SNF12P53628 MIC12YBR262C 321 nt10.03□□□□□ -0.8
SNF12P53628 AQY1YPR192W 918 nt10.02□□□□□ -0.81
SNF12P53628 DPS1YLL018C 1674 nt10.02□□□□□ -0.81
SNF12P53628 SPC25YER018C 666 nt10□□□□□ -0.81
SNF12P53628 MRPL8YJL063C 717 nt10□□□□□ -0.81
SNF12P53628 STB1YNL309W 1263 nt10□□□□□ -0.81
SNF12P53628 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.99□□□□□ -0.81
SNF12P53628 BNA2YJR078W 1362 nt9.99□□□□□ -0.81
SNF12P53628 FEN2YCR028C 1539 nt9.98□□□□□ -0.81
SNF12P53628 YKL030WYKL030W 606 nt9.97□□□□□ -0.81
SNF12P53628 TIM23YNR017W 669 nt9.97□□□□□ -0.81
SNF12P53628 YKR005CYKR005C 1578 nt9.96□□□□□ -0.82
SNF12P53628 WSC2YNL283C 1512 nt9.94□□□□□ -0.82
SNF12P53628 YLR179CYLR179C 606 nt9.94□□□□□ -0.82
SNF12P53628 BMT6YLR063W 1098 nt9.93□□□□□ -0.82
SNF12P53628 SNF1YDR477W 1902 nt9.93□□□□□ -0.82
SNF12P53628 GPI16YHR188C 1833 nt9.91□□□□□ -0.82
SNF12P53628 VPS60YDR486C 690 nt9.91□□□□□ -0.82
SNF12P53628 YIR016WYIR016W 798 nt9.91□□□□□ -0.82
SNF12P53628 YCL074WYCL074W 927 nt9.9□□□□□ -0.82
SNF12P53628 ADO1YJR105W 1023 nt9.9□□□□□ -0.82
SNF12P53628 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.83
SNF12P53628 DUS1YML080W 1272 nt9.89□□□□□ -0.83
SNF12P53628 HHO1YPL127C 777 nt9.89□□□□□ -0.83
SNF12P53628 ALG3YBL082C 1377 nt9.88□□□□□ -0.83
SNF12P53628 AHT1YHR093W 549 nt9.88□□□□□ -0.83
SNF12P53628 CCT4YDL143W 1587 nt9.88□□□□□ -0.83
SNF12P53628 CMP2YML057W 1815 nt9.87□□□□□ -0.83
SNF12P53628 CYT2YKL087C 675 nt9.87□□□□□ -0.83
SNF12P53628 XDJ1YLR090W 1380 nt9.87□□□□□ -0.83
SNF12P53628 HUA1YGR268C 597 nt9.85□□□□□ -0.83
SNF12P53628 PBP1YGR178C 2169 nt9.85□□□□□ -0.83
SNF12P53628 YGR259CYGR259C 441 nt9.84□□□□□ -0.83
SNF12P53628 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.84□□□□□ -0.83
SNF12P53628 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.84□□□□□ -0.83
SNF12P53628 DUT1YBR252W 444 nt9.83□□□□□ -0.84
SNF12P53628 YGR201CYGR201C 678 nt9.8□□□□□ -0.84
SNF12P53628 STR3YGL184C 1398 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF12P53628 IRC24YIR036C 792 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF12P53628 YPR064WYPR064W 420 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF12P53628 SWC5YBR231C 912 nt9.78□□□□□ -0.84
SNF12P53628 TAD3YLR316C 969 nt9.73□□□□□ -0.85
SNF12P53628 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.71□□□□□ -0.86
SNF12P53628 AVT6YER119C 1347 nt9.67□□□□□ -0.86
SNF12P53628 GDH3YAL062W 1374 nt9.66□□□□□ -0.86
SNF12P53628 AQY2YLL052C 450 nt9.66□□□□□ -0.86
SNF12P53628 HSL7YBR133C 2484 nt9.65□□□□□ -0.86
SNF12P53628 BDH1YAL060W 1149 nt9.65□□□□□ -0.86
SNF12P53628 GOR1YNL274C 1053 nt9.64□□□□□ -0.87
SNF12P53628 NDI1YML120C 1542 nt9.6□□□□□ -0.87
SNF12P53628 SHM2YLR058C 1410 nt9.59□□□□□ -0.87
SNF12P53628 RTN2YDL204W 1182 nt9.59□□□□□ -0.87
SNF12P53628 YAT1YAR035W 2064 nt9.58□□□□□ -0.88
SNF12P53628 YDR094WYDR094W 336 nt9.56□□□□□ -0.88
SNF12P53628 YLR415CYLR415C 339 nt9.56□□□□□ -0.88
SNF12P53628 YSP3YOR003W 1437 nt9.56□□□□□ -0.88
SNF12P53628 UBX6YJL048C 1191 nt9.53□□□□□ -0.88
SNF12P53628 YFR018CYFR018C 1092 nt9.52□□□□□ -0.89
SNF12P53628 NIT1YIL164C 600 nt9.51□□□□□ -0.89
SNF12P53628 DAT1YML113W 747 nt9.5□□□□□ -0.89
SNF12P53628 BSP1YPR171W 1731 nt9.5□□□□□ -0.89
SNF12P53628 SSN3YPL042C 1668 nt9.49□□□□□ -0.89
SNF12P53628 PEX25YPL112C 1185 nt9.49□□□□□ -0.89
SNF12P53628 HEL2YDR266C 1920 nt9.48□□□□□ -0.89
SNF12P53628 PLB1YMR008C 1995 nt9.48□□□□□ -0.89
SNF12P53628 NBP35YGL091C 987 nt9.48□□□□□ -0.89
SNF12P53628 TIM17YJL143W 477 nt9.48□□□□□ -0.89
SNF12P53628 YNL115CYNL115C 1935 nt9.46□□□□□ -0.89
SNF12P53628 SPT20YOL148C 1815 nt9.46□□□□□ -0.9
SNF12P53628 PRE6YOL038W 765 nt9.45□□□□□ -0.9
SNF12P53628 YFL066CYFL066C 1179 nt9.44□□□□□ -0.9
SNF12P53628 NME1NME1 340 nt9.44□□□□□ -0.9
SNF12P53628 ARP6YLR085C 1317 nt9.44□□□□□ -0.9
SNF12P53628 SGT2YOR007C 1041 nt9.43□□□□□ -0.9
SNF12P53628 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.42□□□□□ -0.9
SNF12P53628 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.42□□□□□ -0.9
SNF12P53628 YCR102CYCR102C 1107 nt9.4□□□□□ -0.9
SNF12P53628 PRM5YIL117C 957 nt9.4□□□□□ -0.9
SNF12P53628 HIF1YLL022C 1158 nt9.4□□□□□ -0.9
SNF12P53628 RRT5YFR032C 870 nt9.38□□□□□ -0.91
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