Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
CebpaP53566 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
CebpaP53566 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
CebpaP53566 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
CebpaP53566 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
CebpaP53566 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
CebpaP53566 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
CebpaP53566 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
CebpaP53566 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
CebpaP53566 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
CebpaP53566 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
CebpaP53566 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
CebpaP53566 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
CebpaP53566 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
CebpaP53566 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
CebpaP53566 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
CebpaP53566 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,9■■■□□ 2,38
CebpaP53566 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
CebpaP53566 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
CebpaP53566 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
CebpaP53566 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
CebpaP53566 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
CebpaP53566 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
CebpaP53566 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
CebpaP53566 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
CebpaP53566 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
CebpaP53566 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
CebpaP53566 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
CebpaP53566 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
CebpaP53566 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
CebpaP53566 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
CebpaP53566 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
CebpaP53566 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
CebpaP53566 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
CebpaP53566 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
CebpaP53566 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
CebpaP53566 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
CebpaP53566 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
CebpaP53566 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
CebpaP53566 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
CebpaP53566 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
CebpaP53566 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
CebpaP53566 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
CebpaP53566 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
CebpaP53566 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
CebpaP53566 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
CebpaP53566 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
CebpaP53566 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
CebpaP53566 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
CebpaP53566 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,28
CebpaP53566 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
CebpaP53566 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
CebpaP53566 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
CebpaP53566 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms