Protein–RNA interactions for Protein: P53297

PBP1, PAB1-binding protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PBP1P53297 YFR018CYFR018C 1092 nt9.9□□□□□ -0.82
PBP1P53297 TAD3YLR316C 969 nt9.9□□□□□ -0.82
PBP1P53297 WSC2YNL283C 1512 nt9.89□□□□□ -0.83
PBP1P53297 BIO4YNR057C 714 nt9.89□□□□□ -0.83
PBP1P53297 PTK1YKL198C 1989 nt9.88□□□□□ -0.83
PBP1P53297 AHT1YHR093W 549 nt9.88□□□□□ -0.83
PBP1P53297 YLL053CYLL053C 459 nt9.88□□□□□ -0.83
PBP1P53297 PAU16YKL224C 372 nt9.87□□□□□ -0.83
PBP1P53297 SIM1YIL123W 1431 nt9.87□□□□□ -0.83
PBP1P53297 NCP1YHR042W 2076 nt9.86□□□□□ -0.83
PBP1P53297 RRT5YFR032C 870 nt9.85□□□□□ -0.83
PBP1P53297 AQY1YPR192W 918 nt9.85□□□□□ -0.83
PBP1P53297 FTR1YER145C 1215 nt9.84□□□□□ -0.83
PBP1P53297 ALG12YNR030W 1656 nt9.83□□□□□ -0.84
PBP1P53297 PRE6YOL038W 765 nt9.82□□□□□ -0.84
PBP1P53297 GAL1YBR020W 1587 nt9.8□□□□□ -0.84
PBP1P53297 BSP1YPR171W 1731 nt9.79□□□□□ -0.84
PBP1P53297 TRM5YHR070W 1500 nt9.77□□□□□ -0.85
PBP1P53297 STB1YNL309W 1263 nt9.74□□□□□ -0.85
PBP1P53297 PEX25YPL112C 1185 nt9.74□□□□□ -0.85
PBP1P53297 ERF2YLR246W 1080 nt9.73□□□□□ -0.85
PBP1P53297 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.72□□□□□ -0.85
PBP1P53297 SPC25YER018C 666 nt9.72□□□□□ -0.85
PBP1P53297 BDH1YAL060W 1149 nt9.72□□□□□ -0.85
PBP1P53297 YFL066CYFL066C 1179 nt9.71□□□□□ -0.86
PBP1P53297 DDR2YOL052C-A 186 nt9.71□□□□□ -0.86
PBP1P53297 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.7□□□□□ -0.86
PBP1P53297 YFL067WYFL067W 528 nt9.7□□□□□ -0.86
PBP1P53297 YLR415CYLR415C 339 nt9.7□□□□□ -0.86
PBP1P53297 YSP3YOR003W 1437 nt9.7□□□□□ -0.86
PBP1P53297 CCT4YDL143W 1587 nt9.7□□□□□ -0.86
PBP1P53297 ATF2YGR177C 1608 nt9.7□□□□□ -0.86
PBP1P53297 GPI16YHR188C 1833 nt9.69□□□□□ -0.86
PBP1P53297 YNL115CYNL115C 1935 nt9.67□□□□□ -0.86
PBP1P53297 CRR1YLR213C 1269 nt9.67□□□□□ -0.86
PBP1P53297 CSM2YIL132C 642 nt9.65□□□□□ -0.86
PBP1P53297 SWC5YBR231C 912 nt9.65□□□□□ -0.86
PBP1P53297 Q0010Q0010 387 nt9.65□□□□□ -0.86
PBP1P53297 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.64□□□□□ -0.87
PBP1P53297 VPS60YDR486C 690 nt9.64□□□□□ -0.87
PBP1P53297 SBA1YKL117W 651 nt9.63□□□□□ -0.87
PBP1P53297 YFL054CYFL054C 1941 nt9.62□□□□□ -0.87
PBP1P53297 SPT8YLR055C 1809 nt9.61□□□□□ -0.87
PBP1P53297 NAT4YMR069W 858 nt9.6□□□□□ -0.87
PBP1P53297 FEN2YCR028C 1539 nt9.59□□□□□ -0.87
PBP1P53297 ANP1YEL036C 1503 nt9.59□□□□□ -0.87
PBP1P53297 HSP60YLR259C 1719 nt9.59□□□□□ -0.87
PBP1P53297 ALG3YBL082C 1377 nt9.58□□□□□ -0.88
PBP1P53297 GLK1YCL040W 1503 nt9.57□□□□□ -0.88
PBP1P53297 HEM12YDR047W 1089 nt9.57□□□□□ -0.88
PBP1P53297 LYS4YDR234W 2082 nt9.57□□□□□ -0.88
PBP1P53297 SNG1YGR197C 1644 nt9.56□□□□□ -0.88
PBP1P53297 SSN3YPL042C 1668 nt9.56□□□□□ -0.88
PBP1P53297 VPS75YNL246W 795 nt9.56□□□□□ -0.88
PBP1P53297 YJR154WYJR154W 1041 nt9.55□□□□□ -0.88
PBP1P53297 MIC10YCL057C-A 294 nt9.54□□□□□ -0.88
PBP1P53297 NAR1YNL240C 1476 nt9.52□□□□□ -0.89
PBP1P53297 MIR1YJR077C 936 nt9.51□□□□□ -0.89
PBP1P53297 MSF1YPR047W 1410 nt9.5□□□□□ -0.89
PBP1P53297 YIR016WYIR016W 798 nt9.5□□□□□ -0.89
PBP1P53297 THI74YDR438W 1113 nt9.49□□□□□ -0.89
PBP1P53297 MAS1YLR163C 1389 nt9.48□□□□□ -0.89
PBP1P53297 TIM17YJL143W 477 nt9.45□□□□□ -0.9
PBP1P53297 MET8YBR213W 825 nt9.44□□□□□ -0.9
PBP1P53297 SWE1YJL187C 2460 nt9.43□□□□□ -0.9
PBP1P53297 PAU7YAR020C 168 nt9.42□□□□□ -0.9
PBP1P53297 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.4□□□□□ -0.9
PBP1P53297 CMP2YML057W 1815 nt9.4□□□□□ -0.91
PBP1P53297 BNA2YJR078W 1362 nt9.39□□□□□ -0.91
PBP1P53297 DAT1YML113W 747 nt9.38□□□□□ -0.91
PBP1P53297 HSL7YBR133C 2484 nt9.38□□□□□ -0.91
PBP1P53297 XDJ1YLR090W 1380 nt9.37□□□□□ -0.91
PBP1P53297 SHM2YLR058C 1410 nt9.37□□□□□ -0.91
PBP1P53297 CLB6YGR109C 1143 nt9.36□□□□□ -0.91
PBP1P53297 MIC12YBR262C 321 nt9.36□□□□□ -0.91
PBP1P53297 MCM5YLR274W 2328 nt9.35□□□□□ -0.91
PBP1P53297 RAX1YOR301W 1308 nt9.34□□□□□ -0.91
PBP1P53297 UBA4YHR111W 1323 nt9.33□□□□□ -0.92
PBP1P53297 SHB17YKR043C 816 nt9.32□□□□□ -0.92
PBP1P53297 HEL2YDR266C 1920 nt9.31□□□□□ -0.92
PBP1P53297 PAU21YOR394W 495 nt9.31□□□□□ -0.92
PBP1P53297 PAU22YPL282C 495 nt9.31□□□□□ -0.92
PBP1P53297 GDH3YAL062W 1374 nt9.3□□□□□ -0.92
PBP1P53297 YGL034CYGL034C 366 nt9.3□□□□□ -0.92
PBP1P53297 YSR3YKR053C 1215 nt9.3□□□□□ -0.92
PBP1P53297 RSC4YKR008W 1878 nt9.3□□□□□ -0.92
PBP1P53297 SGT2YOR007C 1041 nt9.29□□□□□ -0.92
PBP1P53297 NIT1YIL164C 600 nt9.28□□□□□ -0.92
PBP1P53297 YGR201CYGR201C 678 nt9.27□□□□□ -0.93
PBP1P53297 YMR244WYMR244W 1068 nt9.27□□□□□ -0.93
PBP1P53297 HHO1YPL127C 777 nt9.27□□□□□ -0.93
PBP1P53297 YDR010CYDR010C 333 nt9.26□□□□□ -0.93
PBP1P53297 ARO7YPR060C 771 nt9.26□□□□□ -0.93
PBP1P53297 GLR1YPL091W 1452 nt9.24□□□□□ -0.93
PBP1P53297 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.23□□□□□ -0.93
PBP1P53297 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.23□□□□□ -0.93
PBP1P53297 XYL2YLR070C 1071 nt9.22□□□□□ -0.93
PBP1P53297 YDR306CYDR306C 1437 nt9.22□□□□□ -0.93
PBP1P53297 MET2YNL277W 1461 nt9.21□□□□□ -0.94
PBP1P53297 NDI1YML120C 1542 nt9.21□□□□□ -0.94
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