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Protein–RNA interactions for Protein: P53250
TWF1, Twinfilin-1, yeast
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332 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
TWF1
P53250
GAL1
YBR020W
1587 nt
10.26
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
HEM12
YDR047W
1089 nt
10.24
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
TIM23
YNR017W
669 nt
10.24
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
AQY1
YPR192W
918 nt
10.24
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
TRM5
YHR070W
1500 nt
10.23
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
DDR2
YOL052C-A
186 nt
10.22
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
CCA1
YER168C
1641 nt
10.22
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
YKL030W
YKL030W
606 nt
10.21
□□□□□ -0.77
TWF1
P53250
PRP4
YPR178W
1398 nt
10.21
□□□□□ -0.78
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P53250
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YGR197C
1644 nt
10.19
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
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YLR179C
606 nt
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□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
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YOR301W
1308 nt
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□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
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YEL076C-A
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10.18
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TWF1
P53250
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YEL076C
651 nt
10.18
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
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YLR464W
651 nt
10.18
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
AAC1
YMR056C
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10.18
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
MIC10
YCL057C-A
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10.18
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
NAR1
YNL240C
1476 nt
10.17
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
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YDL086C-A
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10.17
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
DPS1
YLL018C
1674 nt
10.16
□□□□□ -0.78
TWF1
P53250
SPC25
YER018C
666 nt
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TWF1
P53250
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YNL309W
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10.13
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TWF1
P53250
RTG1
YOL067C
534 nt
10.13
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TWF1
P53250
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YEL036C
1503 nt
10.12
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TWF1
P53250
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YDR524C-B
201 nt
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TWF1
P53250
AHT1
YHR093W
549 nt
10.11
□□□□□ -0.79
TWF1
P53250
YPR064W
YPR064W
420 nt
10.09
□□□□□ -0.79
TWF1
P53250
GPI16
YHR188C
1833 nt
10.09
□□□□□ -0.79
TWF1
P53250
WSC2
YNL283C
1512 nt
10.08
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
BIO5
YNR056C
1686 nt
10.08
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
BNA2
YJR078W
1362 nt
10.06
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
FEN2
YCR028C
1539 nt
10.06
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
BMT6
YLR063W
1098 nt
10.05
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
SNF1
YDR477W
1902 nt
10.05
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
YKR005C
YKR005C
1578 nt
10.05
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
CCT4
YDL143W
1587 nt
10.04
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
MRPL8
YJL063C
717 nt
10.03
□□□□□ -0.8
TWF1
P53250
TAD3
YLR316C
969 nt
10.02
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
VPS60
YDR486C
690 nt
10.01
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
PBP1
YGR178C
2169 nt
9.99
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
HUA1
YGR268C
597 nt
9.99
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
MIC12
YBR262C
321 nt
9.99
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
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YIR016W
798 nt
9.98
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
RPM1
RPM1
483 nt
9.98
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
SWC5
YBR231C
912 nt
9.98
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
ADO1
YJR105W
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9.97
□□□□□ -0.81
TWF1
P53250
CYT2
YKL087C
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9.96
□□□□□ -0.82
TWF1
P53250
ALG3
YBL082C
1377 nt
9.95
□□□□□ -0.82
TWF1
P53250
DUS1
YML080W
1272 nt
9.94
□□□□□ -0.82
TWF1
P53250
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
9.93
□□□□□ -0.82
TWF1
P53250
AGP1
YCL025C
1902 nt
9.93
□□□□□ -0.82
TWF1
P53250
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YGR259C
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TWF1
P53250
HHO1
YPL127C
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TWF1
P53250
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YCL074W
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□□□□□ -0.82
TWF1
P53250
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YIR036C
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□□□□□ -0.83
TWF1
P53250
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□□□□□ -0.83
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YGR201C
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TWF1
P53250
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YLR415C
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TWF1
P53250
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P53250
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YLR090W
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P53250
YSP3
YOR003W
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YAR035W
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P53250
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RDN18-1
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□□□□□ -0.85
TWF1
P53250
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RDN18-2
1800 nt
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□□□□□ -0.85
TWF1
P53250
GDH3
YAL062W
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□□□□□ -0.85
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P53250
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YJL143W
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□□□□□ -0.85
TWF1
P53250
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YNL274C
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□□□□□ -0.85
TWF1
P53250
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YER119C
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□□□□□ -0.85
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P53250
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YNL115C
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P53250
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YGL184C
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YFR018C
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YFL066C
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P53250
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YDR094W
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YCR102C
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□□□□□ -0.9
TWF1
P53250
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RDN25-2
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P53250
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TWF1
P53250
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YJL048C
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□□□□□ -0.9
TWF1
P53250
ARP6
YLR085C
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□□□□□ -0.9
TWF1
P53250
PAU16
YKL224C
372 nt
9.4
□□□□□ -0.9
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