Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 NME1NME1 340 nt11.16□□□□□ -0.62
RTA1P53047 STB1YNL309W 1263 nt11.15□□□□□ -0.62
RTA1P53047 RTG1YOL067C 534 nt11.15□□□□□ -0.62
RTA1P53047 SWE1YJL187C 2460 nt11.14□□□□□ -0.63
RTA1P53047 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.13□□□□□ -0.63
RTA1P53047 YPR064WYPR064W 420 nt11.13□□□□□ -0.63
RTA1P53047 RAX1YOR301W 1308 nt11.12□□□□□ -0.63
RTA1P53047 SPC25YER018C 666 nt11.12□□□□□ -0.63
RTA1P53047 ANP1YEL036C 1503 nt11.11□□□□□ -0.63
RTA1P53047 NVJ2YPR091C 2313 nt11.11□□□□□ -0.63
RTA1P53047 GPI16YHR188C 1833 nt11.1□□□□□ -0.63
RTA1P53047 AHT1YHR093W 549 nt11.1□□□□□ -0.63
RTA1P53047 WSC2YNL283C 1512 nt11.09□□□□□ -0.63
RTA1P53047 BNA2YJR078W 1362 nt11.06□□□□□ -0.64
RTA1P53047 FEN2YCR028C 1539 nt11.06□□□□□ -0.64
RTA1P53047 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.06□□□□□ -0.64
RTA1P53047 YEL076CYEL076C 651 nt11.06□□□□□ -0.64
RTA1P53047 YLR464WYLR464W 651 nt11.06□□□□□ -0.64
RTA1P53047 CCT4YDL143W 1587 nt11.04□□□□□ -0.64
RTA1P53047 HUA1YGR268C 597 nt11.03□□□□□ -0.64
RTA1P53047 MRPL8YJL063C 717 nt11.03□□□□□ -0.64
RTA1P53047 TAD3YLR316C 969 nt11.03□□□□□ -0.64
RTA1P53047 VPS60YDR486C 690 nt11.02□□□□□ -0.65
RTA1P53047 SWC5YBR231C 912 nt11.01□□□□□ -0.65
RTA1P53047 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.01□□□□□ -0.65
RTA1P53047 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.01□□□□□ -0.65
RTA1P53047 ADO1YJR105W 1023 nt11□□□□□ -0.65
RTA1P53047 CCA1YER168C 1641 nt10.96□□□□□ -0.65
RTA1P53047 YIR016WYIR016W 798 nt10.96□□□□□ -0.65
RTA1P53047 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.95□□□□□ -0.66
RTA1P53047 MIC12YBR262C 321 nt10.95□□□□□ -0.66
RTA1P53047 ALG3YBL082C 1377 nt10.94□□□□□ -0.66
RTA1P53047 HHO1YPL127C 777 nt10.9□□□□□ -0.66
RTA1P53047 YLR415CYLR415C 339 nt10.87□□□□□ -0.67
RTA1P53047 BOR1YNL275W 1731 nt10.86□□□□□ -0.67
RTA1P53047 BDH1YAL060W 1149 nt10.85□□□□□ -0.67
RTA1P53047 YGR201CYGR201C 678 nt10.83□□□□□ -0.68
RTA1P53047 FUR4YBR021W 1902 nt10.81□□□□□ -0.68
RTA1P53047 HSP60YLR259C 1719 nt10.78□□□□□ -0.68
RTA1P53047 AGP1YCL025C 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
RTA1P53047 DUS1YML080W 1272 nt10.78□□□□□ -0.68
RTA1P53047 XDJ1YLR090W 1380 nt10.77□□□□□ -0.68
RTA1P53047 GLK1YCL040W 1503 nt10.77□□□□□ -0.69
RTA1P53047 YSP3YOR003W 1437 nt10.75□□□□□ -0.69
RTA1P53047 GDH3YAL062W 1374 nt10.74□□□□□ -0.69
RTA1P53047 TIM17YJL143W 477 nt10.72□□□□□ -0.69
RTA1P53047 AVT6YER119C 1347 nt10.71□□□□□ -0.69
RTA1P53047 GOR1YNL274C 1053 nt10.71□□□□□ -0.69
RTA1P53047 YCL074WYCL074W 927 nt10.7□□□□□ -0.7
RTA1P53047 SHM2YLR058C 1410 nt10.69□□□□□ -0.7
RTA1P53047 YNL115CYNL115C 1935 nt10.68□□□□□ -0.7
RTA1P53047 PEX25YPL112C 1185 nt10.67□□□□□ -0.7
RTA1P53047 DUT1YBR252W 444 nt10.64□□□□□ -0.71
RTA1P53047 PRP4YPR178W 1398 nt10.64□□□□□ -0.71
RTA1P53047 YFR018CYFR018C 1092 nt10.61□□□□□ -0.71
RTA1P53047 YFL066CYFL066C 1179 nt10.6□□□□□ -0.71
RTA1P53047 YKR005CYKR005C 1578 nt10.58□□□□□ -0.72
RTA1P53047 STR3YGL184C 1398 nt10.58□□□□□ -0.72
RTA1P53047 BMT6YLR063W 1098 nt10.58□□□□□ -0.72
RTA1P53047 VPS75YNL246W 795 nt10.58□□□□□ -0.72
RTA1P53047 AQY2YLL052C 450 nt10.57□□□□□ -0.72
RTA1P53047 NIT1YIL164C 600 nt10.56□□□□□ -0.72
RTA1P53047 FRE6YLL051C 2139 nt10.56□□□□□ -0.72
RTA1P53047 DPS1YLL018C 1674 nt10.55□□□□□ -0.72
RTA1P53047 YDR094WYDR094W 336 nt10.55□□□□□ -0.72
RTA1P53047 DAT1YML113W 747 nt10.55□□□□□ -0.72
RTA1P53047 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.55□□□□□ -0.72
RTA1P53047 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.55□□□□□ -0.72
RTA1P53047 SGT2YOR007C 1041 nt10.54□□□□□ -0.72
RTA1P53047 YGR259CYGR259C 441 nt10.53□□□□□ -0.72
RTA1P53047 AAC1YMR056C 930 nt10.51□□□□□ -0.73
RTA1P53047 RRT5YFR032C 870 nt10.5□□□□□ -0.73
RTA1P53047 PRE6YOL038W 765 nt10.5□□□□□ -0.73
RTA1P53047 YCR102CYCR102C 1107 nt10.49□□□□□ -0.73
RTA1P53047 PAU7YAR020C 168 nt10.47□□□□□ -0.73
RTA1P53047 RTN2YDL204W 1182 nt10.44□□□□□ -0.74
RTA1P53047 ALG12YNR030W 1656 nt10.41□□□□□ -0.74
RTA1P53047 UME6YDR207C 2511 nt10.41□□□□□ -0.74
RTA1P53047 NBP35YGL091C 987 nt10.4□□□□□ -0.74
RTA1P53047 IRC24YIR036C 792 nt10.4□□□□□ -0.74
RTA1P53047 UBX6YJL048C 1191 nt10.4□□□□□ -0.74
RTA1P53047 PAU16YKL224C 372 nt10.38□□□□□ -0.75
RTA1P53047 SNF1YDR477W 1902 nt10.33□□□□□ -0.76
RTA1P53047 MIR1YJR077C 936 nt10.32□□□□□ -0.76
RTA1P53047 SHB17YKR043C 816 nt10.32□□□□□ -0.76
RTA1P53047 RPM1RPM1 483 nt10.31□□□□□ -0.76
RTA1P53047 TIR3YIL011W 810 nt10.3□□□□□ -0.76
RTA1P53047 ARP6YLR085C 1317 nt10.3□□□□□ -0.76
RTA1P53047 YDR010CYDR010C 333 nt10.28□□□□□ -0.76
RTA1P53047 PLB1YMR008C 1995 nt10.27□□□□□ -0.77
RTA1P53047 BIO5YNR056C 1686 nt10.26□□□□□ -0.77
RTA1P53047 THI74YDR438W 1113 nt10.26□□□□□ -0.77
RTA1P53047 LSC2YGR244C 1284 nt10.26□□□□□ -0.77
RTA1P53047 NAT4YMR069W 858 nt10.25□□□□□ -0.77
RTA1P53047 UBA4YHR111W 1323 nt10.25□□□□□ -0.77
RTA1P53047 RET2YFR051C 1641 nt10.23□□□□□ -0.77
RTA1P53047 SHH4YLR164W 507 nt10.21□□□□□ -0.77
RTA1P53047 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.2□□□□□ -0.78
RTA1P53047 PHO89YBR296C 1725 nt10.2□□□□□ -0.78
RTA1P53047 PRO1YDR300C 1287 nt10.19□□□□□ -0.78
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