Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.05□□□□□ -0.8
SEH1P53011 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.05□□□□□ -0.8
SEH1P53011 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.05□□□□□ -0.8
SEH1P53011 ERF2YLR246W 1080 nt10.05□□□□□ -0.8
SEH1P53011 TRM5YHR070W 1500 nt10.05□□□□□ -0.8
SEH1P53011 BOR1YNL275W 1731 nt10.04□□□□□ -0.8
SEH1P53011 TAD3YLR316C 969 nt10.03□□□□□ -0.8
SEH1P53011 ATF2YGR177C 1608 nt10.03□□□□□ -0.8
SEH1P53011 LYS4YDR234W 2082 nt10□□□□□ -0.81
SEH1P53011 YFL067WYFL067W 528 nt10□□□□□ -0.81
SEH1P53011 CRR1YLR213C 1269 nt10□□□□□ -0.81
SEH1P53011 DDR2YOL052C-A 186 nt9.99□□□□□ -0.81
SEH1P53011 SPC25YER018C 666 nt9.97□□□□□ -0.81
SEH1P53011 STB1YNL309W 1263 nt9.97□□□□□ -0.81
SEH1P53011 PTK1YKL198C 1989 nt9.95□□□□□ -0.82
SEH1P53011 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.95□□□□□ -0.82
SEH1P53011 YFR018CYFR018C 1092 nt9.95□□□□□ -0.82
SEH1P53011 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.94□□□□□ -0.82
SEH1P53011 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.94□□□□□ -0.82
SEH1P53011 CCT4YDL143W 1587 nt9.92□□□□□ -0.82
SEH1P53011 GPI16YHR188C 1833 nt9.91□□□□□ -0.82
SEH1P53011 HEM12YDR047W 1089 nt9.91□□□□□ -0.82
SEH1P53011 SNG1YGR197C 1644 nt9.9□□□□□ -0.82
SEH1P53011 RRT5YFR032C 870 nt9.9□□□□□ -0.82
SEH1P53011 ANP1YEL036C 1503 nt9.89□□□□□ -0.83
SEH1P53011 MIC10YCL057C-A 294 nt9.89□□□□□ -0.83
SEH1P53011 FEN2YCR028C 1539 nt9.87□□□□□ -0.83
SEH1P53011 VPS60YDR486C 690 nt9.87□□□□□ -0.83
SEH1P53011 PAU16YKL224C 372 nt9.87□□□□□ -0.83
SEH1P53011 BDH1YAL060W 1149 nt9.87□□□□□ -0.83
SEH1P53011 SWC5YBR231C 912 nt9.85□□□□□ -0.83
SEH1P53011 YLR415CYLR415C 339 nt9.84□□□□□ -0.83
SEH1P53011 YSP3YOR003W 1437 nt9.82□□□□□ -0.84
SEH1P53011 ALG3YBL082C 1377 nt9.82□□□□□ -0.84
SEH1P53011 PRE6YOL038W 765 nt9.81□□□□□ -0.84
SEH1P53011 PEX25YPL112C 1185 nt9.8□□□□□ -0.84
SEH1P53011 YFL066CYFL066C 1179 nt9.79□□□□□ -0.84
SEH1P53011 YFL054CYFL054C 1941 nt9.79□□□□□ -0.84
SEH1P53011 YIR016WYIR016W 798 nt9.78□□□□□ -0.84
SEH1P53011 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.77□□□□□ -0.85
SEH1P53011 YNL115CYNL115C 1935 nt9.76□□□□□ -0.85
SEH1P53011 ALG12YNR030W 1656 nt9.74□□□□□ -0.85
SEH1P53011 BNA2YJR078W 1362 nt9.72□□□□□ -0.85
SEH1P53011 RAX1YOR301W 1308 nt9.71□□□□□ -0.86
SEH1P53011 SPT8YLR055C 1809 nt9.7□□□□□ -0.86
SEH1P53011 MIC12YBR262C 321 nt9.68□□□□□ -0.86
SEH1P53011 NAT4YMR069W 858 nt9.65□□□□□ -0.86
SEH1P53011 VPS75YNL246W 795 nt9.65□□□□□ -0.86
SEH1P53011 GLK1YCL040W 1503 nt9.63□□□□□ -0.87
SEH1P53011 TIM17YJL143W 477 nt9.62□□□□□ -0.87
SEH1P53011 XDJ1YLR090W 1380 nt9.61□□□□□ -0.87
SEH1P53011 SHM2YLR058C 1410 nt9.6□□□□□ -0.87
SEH1P53011 SBA1YKL117W 651 nt9.6□□□□□ -0.87
SEH1P53011 HHO1YPL127C 777 nt9.6□□□□□ -0.87
SEH1P53011 SWE1YJL187C 2460 nt9.57□□□□□ -0.88
SEH1P53011 YGR201CYGR201C 678 nt9.57□□□□□ -0.88
SEH1P53011 RPM1RPM1 483 nt9.57□□□□□ -0.88
SEH1P53011 HSL7YBR133C 2484 nt9.57□□□□□ -0.88
SEH1P53011 GDH3YAL062W 1374 nt9.56□□□□□ -0.88
SEH1P53011 THI74YDR438W 1113 nt9.54□□□□□ -0.88
SEH1P53011 MIR1YJR077C 936 nt9.54□□□□□ -0.88
SEH1P53011 MSF1YPR047W 1410 nt9.54□□□□□ -0.88
SEH1P53011 CCA1YER168C 1641 nt9.53□□□□□ -0.88
SEH1P53011 PAU7YAR020C 168 nt9.52□□□□□ -0.89
SEH1P53011 NIT1YIL164C 600 nt9.5□□□□□ -0.89
SEH1P53011 AGP1YCL025C 1902 nt9.48□□□□□ -0.89
SEH1P53011 SGT2YOR007C 1041 nt9.48□□□□□ -0.89
SEH1P53011 AVT6YER119C 1347 nt9.48□□□□□ -0.89
SEH1P53011 HSP60YLR259C 1719 nt9.48□□□□□ -0.89
SEH1P53011 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.46□□□□□ -0.9
SEH1P53011 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.46□□□□□ -0.9
SEH1P53011 GOR1YNL274C 1053 nt9.45□□□□□ -0.9
SEH1P53011 DAT1YML113W 747 nt9.42□□□□□ -0.9
SEH1P53011 DUT1YBR252W 444 nt9.42□□□□□ -0.9
SEH1P53011 SHB17YKR043C 816 nt9.41□□□□□ -0.9
SEH1P53011 UBA4YHR111W 1323 nt9.4□□□□□ -0.9
SEH1P53011 NAR1YNL240C 1476 nt9.4□□□□□ -0.91
SEH1P53011 YDR010CYDR010C 333 nt9.38□□□□□ -0.91
SEH1P53011 YCR102CYCR102C 1107 nt9.35□□□□□ -0.91
SEH1P53011 YGL034CYGL034C 366 nt9.35□□□□□ -0.91
SEH1P53011 DUS1YML080W 1272 nt9.35□□□□□ -0.91
SEH1P53011 YSR3YKR053C 1215 nt9.34□□□□□ -0.91
SEH1P53011 RET2YFR051C 1641 nt9.32□□□□□ -0.92
SEH1P53011 HEL2YDR266C 1920 nt9.31□□□□□ -0.92
SEH1P53011 STR3YGL184C 1398 nt9.29□□□□□ -0.92
SEH1P53011 PHO89YBR296C 1725 nt9.28□□□□□ -0.92
SEH1P53011 YCL074WYCL074W 927 nt9.28□□□□□ -0.92
SEH1P53011 XYL2YLR070C 1071 nt9.28□□□□□ -0.92
SEH1P53011 YMR244WYMR244W 1068 nt9.28□□□□□ -0.92
SEH1P53011 GLR1YPL091W 1452 nt9.28□□□□□ -0.92
SEH1P53011 YCR087WYCR087W 516 nt9.27□□□□□ -0.93
SEH1P53011 NBP35YGL091C 987 nt9.26□□□□□ -0.93
SEH1P53011 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.26□□□□□ -0.93
SEH1P53011 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.26□□□□□ -0.93
SEH1P53011 FUR4YBR021W 1902 nt9.25□□□□□ -0.93
SEH1P53011 AQY2YLL052C 450 nt9.25□□□□□ -0.93
SEH1P53011 CMP2YML057W 1815 nt9.25□□□□□ -0.93
SEH1P53011 NDI1YML120C 1542 nt9.25□□□□□ -0.93
SEH1P53011 RBG1YAL036C 1110 nt9.22□□□□□ -0.93
SEH1P53011 SFA1YDL168W 1161 nt9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms