Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fgd1P52734 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fgd1P52734 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fgd1P52734 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fgd1P52734 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fgd1P52734 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fgd1P52734 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fgd1P52734 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fgd1P52734 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Fgd1P52734 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fgd1P52734 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fgd1P52734 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fgd1P52734 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fgd1P52734 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fgd1P52734 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fgd1P52734 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fgd1P52734 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fgd1P52734 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fgd1P52734 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fgd1P52734 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fgd1P52734 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fgd1P52734 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fgd1P52734 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fgd1P52734 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fgd1P52734 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fgd1P52734 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fgd1P52734 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Fgd1P52734 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fgd1P52734 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Fgd1P52734 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Fgd1P52734 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Fgd1P52734 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fgd1P52734 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Fgd1P52734 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Fgd1P52734 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd1P52734 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fgd1P52734 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fgd1P52734 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fgd1P52734 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fgd1P52734 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fgd1P52734 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fgd1P52734 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fgd1P52734 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fgd1P52734 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fgd1P52734 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fgd1P52734 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fgd1P52734 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fgd1P52734 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fgd1P52734 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fgd1P52734 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fgd1P52734 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fgd1P52734 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fgd1P52734 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fgd1P52734 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fgd1P52734 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fgd1P52734 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fgd1P52734 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fgd1P52734 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fgd1P52734 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fgd1P52734 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Fgd1P52734 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fgd1P52734 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fgd1P52734 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fgd1P52734 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Fgd1P52734 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Fgd1P52734 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fgd1P52734 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms