Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
ClgnP52194 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
ClgnP52194 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
ClgnP52194 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
ClgnP52194 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
ClgnP52194 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
ClgnP52194 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
ClgnP52194 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
ClgnP52194 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
ClgnP52194 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
ClgnP52194 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
ClgnP52194 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
ClgnP52194 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
ClgnP52194 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
ClgnP52194 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
ClgnP52194 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
ClgnP52194 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
ClgnP52194 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
ClgnP52194 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,74
ClgnP52194 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
ClgnP52194 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
ClgnP52194 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
ClgnP52194 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
ClgnP52194 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
ClgnP52194 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
ClgnP52194 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
ClgnP52194 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
ClgnP52194 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
ClgnP52194 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,75■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
ClgnP52194 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
ClgnP52194 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
ClgnP52194 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
ClgnP52194 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
ClgnP52194 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
ClgnP52194 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
ClgnP52194 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,57■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
ClgnP52194 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
ClgnP52194 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
ClgnP52194 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
ClgnP52194 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
ClgnP52194 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,41■■□□□ 1,66
ClgnP52194 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
ClgnP52194 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,7 ms