Protein–RNA interactions for Protein: P48561

TRF5, Poly(A) RNA polymerase protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRF5P48561 AQY1YPR192W 918 nt11.18□□□□□ -0.62
TRF5P48561 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.18□□□□□ -0.62
TRF5P48561 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.18□□□□□ -0.62
TRF5P48561 ATF2YGR177C 1608 nt11.17□□□□□ -0.62
TRF5P48561 YPR064WYPR064W 420 nt11.17□□□□□ -0.62
TRF5P48561 TRM5YHR070W 1500 nt11.17□□□□□ -0.62
TRF5P48561 BOR1YNL275W 1731 nt11.17□□□□□ -0.62
TRF5P48561 SPT8YLR055C 1809 nt11.16□□□□□ -0.62
TRF5P48561 YDR094WYDR094W 336 nt11.14□□□□□ -0.63
TRF5P48561 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.14□□□□□ -0.63
TRF5P48561 TAD3YLR316C 969 nt11.14□□□□□ -0.63
TRF5P48561 SPC25YER018C 666 nt11.1□□□□□ -0.63
TRF5P48561 YFL067WYFL067W 528 nt11.1□□□□□ -0.63
TRF5P48561 STB1YNL309W 1263 nt11.08□□□□□ -0.64
TRF5P48561 DDR2YOL052C-A 186 nt11.05□□□□□ -0.64
TRF5P48561 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.04□□□□□ -0.64
TRF5P48561 SNG1YGR197C 1644 nt11.04□□□□□ -0.64
TRF5P48561 ANP1YEL036C 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
TRF5P48561 UME6YDR207C 2511 nt11.03□□□□□ -0.64
TRF5P48561 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.03□□□□□ -0.64
TRF5P48561 BDH1YAL060W 1149 nt11.03□□□□□ -0.64
TRF5P48561 MIC10YCL057C-A 294 nt11.03□□□□□ -0.64
TRF5P48561 CCT4YDL143W 1587 nt11.02□□□□□ -0.65
TRF5P48561 HEM12YDR047W 1089 nt11.01□□□□□ -0.65
TRF5P48561 YFR018CYFR018C 1092 nt11.01□□□□□ -0.65
TRF5P48561 GPI16YHR188C 1833 nt11□□□□□ -0.65
TRF5P48561 VPS60YDR486C 690 nt10.99□□□□□ -0.65
TRF5P48561 SWE1YJL187C 2460 nt10.98□□□□□ -0.65
TRF5P48561 FEN2YCR028C 1539 nt10.96□□□□□ -0.65
TRF5P48561 YSP3YOR003W 1437 nt10.96□□□□□ -0.65
TRF5P48561 ALG3YBL082C 1377 nt10.96□□□□□ -0.65
TRF5P48561 RPM1RPM1 483 nt10.95□□□□□ -0.66
TRF5P48561 PRE6YOL038W 765 nt10.94□□□□□ -0.66
TRF5P48561 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.93□□□□□ -0.66
TRF5P48561 PEX25YPL112C 1185 nt10.91□□□□□ -0.66
TRF5P48561 YLR415CYLR415C 339 nt10.9□□□□□ -0.66
TRF5P48561 SWC5YBR231C 912 nt10.9□□□□□ -0.66
TRF5P48561 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.89□□□□□ -0.67
TRF5P48561 YFL066CYFL066C 1179 nt10.88□□□□□ -0.67
TRF5P48561 YIR016WYIR016W 798 nt10.87□□□□□ -0.67
TRF5P48561 PAU16YKL224C 372 nt10.87□□□□□ -0.67
TRF5P48561 YNL115CYNL115C 1935 nt10.85□□□□□ -0.67
TRF5P48561 MIC12YBR262C 321 nt10.82□□□□□ -0.68
TRF5P48561 RRT5YFR032C 870 nt10.81□□□□□ -0.68
TRF5P48561 RAX1YOR301W 1308 nt10.8□□□□□ -0.68
TRF5P48561 HSP60YLR259C 1719 nt10.77□□□□□ -0.69
TRF5P48561 MCH5YOR306C 1566 nt10.77□□□□□ -0.69
TRF5P48561 BNA2YJR078W 1362 nt10.73□□□□□ -0.69
TRF5P48561 VPS75YNL246W 795 nt10.72□□□□□ -0.69
TRF5P48561 ALG12YNR030W 1656 nt10.71□□□□□ -0.69
TRF5P48561 CCA1YER168C 1641 nt10.7□□□□□ -0.7
TRF5P48561 GLK1YCL040W 1503 nt10.69□□□□□ -0.7
TRF5P48561 XDJ1YLR090W 1380 nt10.68□□□□□ -0.7
TRF5P48561 FUR4YBR021W 1902 nt10.68□□□□□ -0.7
TRF5P48561 SHM2YLR058C 1410 nt10.67□□□□□ -0.7
TRF5P48561 YGR201CYGR201C 678 nt10.65□□□□□ -0.7
TRF5P48561 TIM17YJL143W 477 nt10.65□□□□□ -0.7
TRF5P48561 MIR1YJR077C 936 nt10.63□□□□□ -0.71
TRF5P48561 AGP1YCL025C 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
TRF5P48561 NIT1YIL164C 600 nt10.62□□□□□ -0.71
TRF5P48561 HHO1YPL127C 777 nt10.62□□□□□ -0.71
TRF5P48561 GDH3YAL062W 1374 nt10.59□□□□□ -0.71
TRF5P48561 SGT2YOR007C 1041 nt10.55□□□□□ -0.72
TRF5P48561 NAT4YMR069W 858 nt10.54□□□□□ -0.72
TRF5P48561 THI74YDR438W 1113 nt10.53□□□□□ -0.72
TRF5P48561 PRP4YPR178W 1398 nt10.52□□□□□ -0.72
TRF5P48561 DUT1YBR252W 444 nt10.52□□□□□ -0.73
TRF5P48561 MSF1YPR047W 1410 nt10.51□□□□□ -0.73
TRF5P48561 DAT1YML113W 747 nt10.5□□□□□ -0.73
TRF5P48561 AVT6YER119C 1347 nt10.5□□□□□ -0.73
TRF5P48561 YDR010CYDR010C 333 nt10.47□□□□□ -0.73
TRF5P48561 SHB17YKR043C 816 nt10.47□□□□□ -0.73
TRF5P48561 PAU7YAR020C 168 nt10.46□□□□□ -0.73
TRF5P48561 DUS1YML080W 1272 nt10.46□□□□□ -0.73
TRF5P48561 SBA1YKL117W 651 nt10.45□□□□□ -0.74
TRF5P48561 AAC1YMR056C 930 nt10.45□□□□□ -0.74
TRF5P48561 DPS1YLL018C 1674 nt10.44□□□□□ -0.74
TRF5P48561 UBA4YHR111W 1323 nt10.44□□□□□ -0.74
TRF5P48561 YCL074WYCL074W 927 nt10.44□□□□□ -0.74
TRF5P48561 BMT6YLR063W 1098 nt10.44□□□□□ -0.74
TRF5P48561 GOR1YNL274C 1053 nt10.44□□□□□ -0.74
TRF5P48561 NAR1YNL240C 1476 nt10.43□□□□□ -0.74
TRF5P48561 YKR005CYKR005C 1578 nt10.42□□□□□ -0.74
TRF5P48561 RET2YFR051C 1641 nt10.36□□□□□ -0.75
TRF5P48561 YCR102CYCR102C 1107 nt10.36□□□□□ -0.75
TRF5P48561 YGL034CYGL034C 366 nt10.35□□□□□ -0.75
TRF5P48561 STR3YGL184C 1398 nt10.35□□□□□ -0.75
TRF5P48561 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.35□□□□□ -0.75
TRF5P48561 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.35□□□□□ -0.75
TRF5P48561 YGR259CYGR259C 441 nt10.34□□□□□ -0.75
TRF5P48561 NBP35YGL091C 987 nt10.33□□□□□ -0.76
TRF5P48561 YSR3YKR053C 1215 nt10.33□□□□□ -0.76
TRF5P48561 PHO89YBR296C 1725 nt10.3□□□□□ -0.76
TRF5P48561 SFA1YDL168W 1161 nt10.29□□□□□ -0.76
TRF5P48561 XYL2YLR070C 1071 nt10.28□□□□□ -0.76
TRF5P48561 IRC24YIR036C 792 nt10.27□□□□□ -0.77
TRF5P48561 SNF1YDR477W 1902 nt10.27□□□□□ -0.77
TRF5P48561 SHH4YLR164W 507 nt10.25□□□□□ -0.77
TRF5P48561 BIO5YNR056C 1686 nt10.23□□□□□ -0.77
TRF5P48561 YCR087WYCR087W 516 nt10.23□□□□□ -0.77
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