Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Gli1P47806 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gli1P47806 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gli1P47806 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gli1P47806 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gli1P47806 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gli1P47806 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gli1P47806 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gli1P47806 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gli1P47806 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gli1P47806 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gli1P47806 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gli1P47806 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gli1P47806 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gli1P47806 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gli1P47806 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gli1P47806 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gli1P47806 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gli1P47806 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Gli1P47806 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Gli1P47806 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Gli1P47806 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Gli1P47806 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Gli1P47806 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gli1P47806 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Gli1P47806 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Gli1P47806 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gli1P47806 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gli1P47806 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gli1P47806 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gli1P47806 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Gli1P47806 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,63■■□□□ 1,53
Gli1P47806 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Gli1P47806 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Gli1P47806 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Gli1P47806 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Gli1P47806 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Gli1P47806 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Gli1P47806 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Gli1P47806 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Gli1P47806 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gli1P47806 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Gli1P47806 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Gli1P47806 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Gli1P47806 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Gli1P47806 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Gli1P47806 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Gli1P47806 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,1 ms