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Protein–RNA interactions for Protein: P41834
UFE1, Syntaxin UFE1, yeast
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346 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
UFE1
P41834
STB1
YNL309W
1263 nt
11.17
□□□□□ -0.62
UFE1
P41834
SPC25
YER018C
666 nt
11.16
□□□□□ -0.62
UFE1
P41834
YFL067W
YFL067W
528 nt
11.15
□□□□□ -0.62
UFE1
P41834
ATF2
YGR177C
1608 nt
11.14
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
BDH1
YAL060W
1149 nt
11.14
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
PEX25
YPL112C
1185 nt
11.14
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
DDR2
YOL052C-A
186 nt
11.13
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
CCT4
YDL143W
1587 nt
11.12
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
CRR1
YLR213C
1269 nt
11.12
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
GPI16
YHR188C
1833 nt
11.12
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
YSP3
YOR003W
1437 nt
11.11
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
11.11
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
YLR415C
YLR415C
339 nt
11.11
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
GUT2
YIL155C
1950 nt
11.1
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
NCP1
YHR042W
2076 nt
11.09
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
YFL066C
YFL066C
1179 nt
11.09
□□□□□ -0.63
UFE1
P41834
YDL086C-A
YDL086C-A
435 nt
11.07
□□□□□ -0.64
UFE1
P41834
YNL115C
YNL115C
1935 nt
11.05
□□□□□ -0.64
UFE1
P41834
VPS60
YDR486C
690 nt
11.05
□□□□□ -0.64
UFE1
P41834
SWC5
YBR231C
912 nt
11.05
□□□□□ -0.64
UFE1
P41834
BOP3
YNL042W
1191 nt
11.03
□□□□□ -0.64
UFE1
P41834
ANP1
YEL036C
1503 nt
11.03
□□□□□ -0.64
UFE1
P41834
FEN2
YCR028C
1539 nt
11.01
□□□□□ -0.65
UFE1
P41834
LYS4
YDR234W
2082 nt
11
□□□□□ -0.65
UFE1
P41834
SNG1
YGR197C
1644 nt
10.99
□□□□□ -0.65
UFE1
P41834
RTF1
YGL244W
1677 nt
10.99
□□□□□ -0.65
UFE1
P41834
HEM12
YDR047W
1089 nt
10.99
□□□□□ -0.65
UFE1
P41834
ALG3
YBL082C
1377 nt
10.99
□□□□□ -0.65
UFE1
P41834
SBA1
YKL117W
651 nt
10.95
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
NAT4
YMR069W
858 nt
10.95
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
VPS75
YNL246W
795 nt
10.95
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
MIC10
YCL057C-A
294 nt
10.94
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
PIB2
YGL023C
1908 nt
10.94
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
YJL225C
YJL225C
5277 nt
10.93
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
SPT8
YLR055C
1809 nt
10.92
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
GLK1
YCL040W
1503 nt
10.91
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
YIR016W
YIR016W
798 nt
10.9
□□□□□ -0.66
UFE1
P41834
MIR1
YJR077C
936 nt
10.87
□□□□□ -0.67
UFE1
P41834
MSF1
YPR047W
1410 nt
10.85
□□□□□ -0.67
UFE1
P41834
THI74
YDR438W
1113 nt
10.84
□□□□□ -0.67
UFE1
P41834
TIM17
YJL143W
477 nt
10.82
□□□□□ -0.68
UFE1
P41834
YHR056W-A
YHR056W-A
435 nt
10.81
□□□□□ -0.68
UFE1
P41834
PTK1
YKL198C
1989 nt
10.8
□□□□□ -0.68
UFE1
P41834
BNA2
YJR078W
1362 nt
10.78
□□□□□ -0.68
UFE1
P41834
MIC12
YBR262C
321 nt
10.77
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
PAU7
YAR020C
168 nt
10.76
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
SHM2
YLR058C
1410 nt
10.75
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
RAX1
YOR301W
1308 nt
10.74
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
XDJ1
YLR090W
1380 nt
10.74
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
10.72
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
10.72
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
DAT1
YML113W
747 nt
10.71
□□□□□ -0.69
UFE1
P41834
UBA4
YHR111W
1323 nt
10.67
□□□□□ -0.7
UFE1
P41834
YGR201C
YGR201C
678 nt
10.67
□□□□□ -0.7
UFE1
P41834
SHB17
YKR043C
816 nt
10.67
□□□□□ -0.7
UFE1
P41834
GDH3
YAL062W
1374 nt
10.65
□□□□□ -0.7
UFE1
P41834
NIT1
YIL164C
600 nt
10.65
□□□□□ -0.7
UFE1
P41834
SGT2
YOR007C
1041 nt
10.65
□□□□□ -0.7
UFE1
P41834
YFL054C
YFL054C
1941 nt
10.64
□□□□□ -0.71
UFE1
P41834
HHO1
YPL127C
777 nt
10.64
□□□□□ -0.71
UFE1
P41834
YGL034C
YGL034C
366 nt
10.63
□□□□□ -0.71
UFE1
P41834
YDR010C
YDR010C
333 nt
10.61
□□□□□ -0.71
UFE1
P41834
YSR3
YKR053C
1215 nt
10.61
□□□□□ -0.71
UFE1
P41834
UME6
YDR207C
2511 nt
10.57
□□□□□ -0.72
UFE1
P41834
YMR244W
YMR244W
1068 nt
10.57
□□□□□ -0.72
UFE1
P41834
RET2
YFR051C
1641 nt
10.55
□□□□□ -0.72
UFE1
P41834
GLR1
YPL091W
1452 nt
10.54
□□□□□ -0.72
UFE1
P41834
AVT6
YER119C
1347 nt
10.54
□□□□□ -0.72
UFE1
P41834
YCR087W
YCR087W
516 nt
10.53
□□□□□ -0.72
UFE1
P41834
XYL2
YLR070C
1071 nt
10.52
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
PHO89
YBR296C
1725 nt
10.51
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
GOR1
YNL274C
1053 nt
10.5
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
NDI1
YML120C
1542 nt
10.49
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
CCA1
YER168C
1641 nt
10.48
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
RBG1
YAL036C
1110 nt
10.47
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
AIM45
YPR004C
1035 nt
10.46
□□□□□ -0.73
UFE1
P41834
AGP1
YCL025C
1902 nt
10.46
□□□□□ -0.74
UFE1
P41834
YCR102C
YCR102C
1107 nt
10.45
□□□□□ -0.74
UFE1
P41834
SWE1
YJL187C
2460 nt
10.44
□□□□□ -0.74
UFE1
P41834
DUT1
YBR252W
444 nt
10.41
□□□□□ -0.74
UFE1
P41834
MRP20
YDR405W
792 nt
10.4
□□□□□ -0.74
UFE1
P41834
RBG2
YGR173W
1107 nt
10.38
□□□□□ -0.75
UFE1
P41834
COQ2
YNR041C
1119 nt
10.37
□□□□□ -0.75
UFE1
P41834
SFA1
YDL168W
1161 nt
10.36
□□□□□ -0.75
UFE1
P41834
YHL019W-A
YHL019W-A
594 nt
10.32
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
YMR226C
YMR226C
804 nt
10.31
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
NBP35
YGL091C
987 nt
10.3
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
TIR3
YIL011W
810 nt
10.29
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
DUS1
YML080W
1272 nt
10.29
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
RPL4B
YDR012W
1089 nt
10.28
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
RPL4A
YBR031W
1089 nt
10.28
□□□□□ -0.76
UFE1
P41834
CLB6
YGR109C
1143 nt
10.24
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
SHH4
YLR164W
507 nt
10.24
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
STR3
YGL184C
1398 nt
10.24
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
YCL074W
YCL074W
927 nt
10.22
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
RPS14B
YJL191W
417 nt
10.21
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
AQY2
YLL052C
450 nt
10.21
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
YLR111W
YLR111W
333 nt
10.21
□□□□□ -0.77
UFE1
P41834
LSC2
YGR244C
1284 nt
10.19
□□□□□ -0.78
UFE1
P41834
UTH1
YKR042W
1098 nt
10.19
□□□□□ -0.78
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