Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA108	P40462	HEM12	YDR047W	1089 nt		11.39	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	AQY1	YPR192W	918 nt		11.38	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	MIC10	YCL057C-A	294 nt		11.38	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	PAC11	YDR488C	1602 nt		11.38	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	AHT1	YHR093W	549 nt		11.36	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	SNG1	YGR197C	1644 nt		11.35	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	SPT8	YLR055C	1809 nt		11.35	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	tL(GAG)G	tL(GAG)G	82 nt		11.34	□□□□□ -0.59
TMA108	P40462	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		11.33	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	TAD3	YLR316C	969 nt		11.33	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	STB1	YNL309W	1263 nt		11.32	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		11.31	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	SPC25	YER018C	666 nt		11.28	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	YHR056W-A	YHR056W-A	435 nt		11.28	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	UBX6	YJL048C	1191 nt		11.28	□□□□□ -0.6
TMA108	P40462	ANP1	YEL036C	1503 nt		11.27	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	GPI16	YHR188C	1833 nt		11.25	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	CCT4	YDL143W	1587 nt		11.24	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	FEN2	YCR028C	1539 nt		11.23	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	YDR094W	YDR094W	336 nt		11.22	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	VPS60	YDR486C	690 nt		11.22	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	SWC5	YBR231C	912 nt		11.22	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	RAX1	YOR301W	1308 nt		11.21	□□□□□ -0.61
TMA108	P40462	SWE1	YJL187C	2460 nt		11.2	□□□□□ -0.62
TMA108	P40462	BNA2	YJR078W	1362 nt		11.17	□□□□□ -0.62
TMA108	P40462	ALG3	YBL082C	1377 nt		11.17	□□□□□ -0.62
TMA108	P40462	BDH1	YAL060W	1149 nt		11.16	□□□□□ -0.62
TMA108	P40462	YLR415C	YLR415C	339 nt		11.14	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	YIR016W	YIR016W	798 nt		11.13	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	NVJ2	YPR091C	2313 nt		11.11	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	PRE6	YOL038W	765 nt		11.11	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	YFR018C	YFR018C	1092 nt		11.1	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	YSP3	YOR003W	1437 nt		11.09	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	CCA1	YER168C	1641 nt		11.09	□□□□□ -0.63
TMA108	P40462	PEX25	YPL112C	1185 nt		11.08	□□□□□ -0.64
TMA108	P40462	MIC12	YBR262C	321 nt		11.07	□□□□□ -0.64
TMA108	P40462	YNL115C	YNL115C	1935 nt		11.06	□□□□□ -0.64
TMA108	P40462	YFL066C	YFL066C	1179 nt		11.06	□□□□□ -0.64
TMA108	P40462	PAU16	YKL224C	372 nt		11.04	□□□□□ -0.64
TMA108	P40462	HHO1	YPL127C	777 nt		11.03	□□□□□ -0.64
TMA108	P40462	RRT5	YFR032C	870 nt		11	□□□□□ -0.65
TMA108	P40462	RPM1	RPM1	483 nt		10.99	□□□□□ -0.65
TMA108	P40462	XDJ1	YLR090W	1380 nt		10.95	□□□□□ -0.66
TMA108	P40462	AGP1	YCL025C	1902 nt		10.95	□□□□□ -0.66
TMA108	P40462	YGR201C	YGR201C	678 nt		10.93	□□□□□ -0.66
TMA108	P40462	TIM17	YJL143W	477 nt		10.92	□□□□□ -0.66
TMA108	P40462	YFL015W-A	YFL015W-A	318 nt		10.9	□□□□□ -0.66
TMA108	P40462	SHM2	YLR058C	1410 nt		10.9	□□□□□ -0.66
TMA108	P40462	GDH3	YAL062W	1374 nt		10.9	□□□□□ -0.67
TMA108	P40462	DUS1	YML080W	1272 nt		10.89	□□□□□ -0.67
TMA108	P40462	VPS75	YNL246W	795 nt		10.89	□□□□□ -0.67
TMA108	P40462	FUR4	YBR021W	1902 nt		10.88	□□□□□ -0.67
TMA108	P40462	AVT6	YER119C	1347 nt		10.86	□□□□□ -0.67
TMA108	P40462	GOR1	YNL274C	1053 nt		10.83	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	DUT1	YBR252W	444 nt		10.83	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	BOR1	YNL275W	1731 nt		10.82	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	HSP60	YLR259C	1719 nt		10.81	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	SGT2	YOR007C	1041 nt		10.8	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	GLK1	YCL040W	1503 nt		10.79	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	NIT1	YIL164C	600 nt		10.78	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	PAU7	YAR020C	168 nt		10.78	□□□□□ -0.68
TMA108	P40462	YCL074W	YCL074W	927 nt		10.77	□□□□□ -0.69
TMA108	P40462	MIR1	YJR077C	936 nt		10.77	□□□□□ -0.69
TMA108	P40462	YJL225C	YJL225C	5277 nt		10.76	□□□□□ -0.69
TMA108	P40462	NAT4	YMR069W	858 nt		10.75	□□□□□ -0.69
TMA108	P40462	THI74	YDR438W	1113 nt		10.71	□□□□□ -0.69
TMA108	P40462	AQY2	YLL052C	450 nt		10.71	□□□□□ -0.69
TMA108	P40462	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		10.7	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		10.7	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	STR3	YGL184C	1398 nt		10.7	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	FRE6	YLL051C	2139 nt		10.69	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	SHB17	YKR043C	816 nt		10.68	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	MSF1	YPR047W	1410 nt		10.67	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	DAT1	YML113W	747 nt		10.67	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	PRP4	YPR178W	1398 nt		10.66	□□□□□ -0.7
TMA108	P40462	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.64	□□□□□ -0.71
TMA108	P40462	UBA4	YHR111W	1323 nt		10.62	□□□□□ -0.71
TMA108	P40462	YCR102C	YCR102C	1107 nt		10.62	□□□□□ -0.71
TMA108	P40462	YDR010C	YDR010C	333 nt		10.61	□□□□□ -0.71
TMA108	P40462	DPS1	YLL018C	1674 nt		10.59	□□□□□ -0.71
TMA108	P40462	YGR259C	YGR259C	441 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	YSR3	YKR053C	1215 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	BMT6	YLR063W	1098 nt		10.58	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		10.56	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		10.56	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	NBP35	YGL091C	987 nt		10.55	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	PHO89	YBR296C	1725 nt		10.54	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	RET2	YFR051C	1641 nt		10.53	□□□□□ -0.72
TMA108	P40462	YGL034C	YGL034C	366 nt		10.52	□□□□□ -0.73
TMA108	P40462	SBA1	YKL117W	651 nt		10.52	□□□□□ -0.73
TMA108	P40462	RTN2	YDL204W	1182 nt		10.5	□□□□□ -0.73
TMA108	P40462	XYL2	YLR070C	1071 nt		10.5	□□□□□ -0.73
TMA108	P40462	AAC1	YMR056C	930 nt		10.49	□□□□□ -0.73
TMA108	P40462	SFA1	YDL168W	1161 nt		10.45	□□□□□ -0.74
TMA108	P40462	YHL019W-A	YHL019W-A	594 nt		10.45	□□□□□ -0.74
TMA108	P40462	SHH4	YLR164W	507 nt		10.45	□□□□□ -0.74
TMA108	P40462	YCR087W	YCR087W	516 nt		10.43	□□□□□ -0.74
TMA108	P40462	TIR3	YIL011W	810 nt		10.43	□□□□□ -0.74
TMA108	P40462	SNF1	YDR477W	1902 nt		10.41	□□□□□ -0.74
TMA108	P40462	IRC24	YIR036C	792 nt		10.41	□□□□□ -0.74

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