Protein–RNA interactions for Protein: P38779

CIC1, Proteasome-interacting protein CIC1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIC1P38779 MIC10YCL057C-A 294 nt12.73□□□□□ -0.37
CIC1P38779 SNG1YGR197C 1644 nt12.71□□□□□ -0.37
CIC1P38779 DDR2YOL052C-A 186 nt12.71□□□□□ -0.37
CIC1P38779 STB1YNL309W 1263 nt12.7□□□□□ -0.38
CIC1P38779 SPC25YER018C 666 nt12.69□□□□□ -0.38
CIC1P38779 HEM12YDR047W 1089 nt12.68□□□□□ -0.38
CIC1P38779 TAD3YLR316C 969 nt12.68□□□□□ -0.38
CIC1P38779 NVJ2YPR091C 2313 nt12.68□□□□□ -0.38
CIC1P38779 YFL054CYFL054C 1941 nt12.67□□□□□ -0.38
CIC1P38779 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.67□□□□□ -0.38
CIC1P38779 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.67□□□□□ -0.38
CIC1P38779 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.66□□□□□ -0.38
CIC1P38779 ANP1YEL036C 1503 nt12.65□□□□□ -0.38
CIC1P38779 PAC11YDR488C 1602 nt12.63□□□□□ -0.39
CIC1P38779 CCT4YDL143W 1587 nt12.61□□□□□ -0.39
CIC1P38779 VPS60YDR486C 690 nt12.6□□□□□ -0.39
CIC1P38779 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.6□□□□□ -0.39
CIC1P38779 GPI16YHR188C 1833 nt12.6□□□□□ -0.39
CIC1P38779 FEN2YCR028C 1539 nt12.58□□□□□ -0.4
CIC1P38779 SPT8YLR055C 1809 nt12.57□□□□□ -0.4
CIC1P38779 ALG3YBL082C 1377 nt12.56□□□□□ -0.4
CIC1P38779 BDH1YAL060W 1149 nt12.56□□□□□ -0.4
CIC1P38779 UBX6YJL048C 1191 nt12.55□□□□□ -0.4
CIC1P38779 YDR094WYDR094W 336 nt12.5□□□□□ -0.41
CIC1P38779 SWC5YBR231C 912 nt12.5□□□□□ -0.41
CIC1P38779 YIR016WYIR016W 798 nt12.48□□□□□ -0.41
CIC1P38779 YSP3YOR003W 1437 nt12.47□□□□□ -0.41
CIC1P38779 RAX1YOR301W 1308 nt12.45□□□□□ -0.42
CIC1P38779 YLR415CYLR415C 339 nt12.45□□□□□ -0.42
CIC1P38779 SWE1YJL187C 2460 nt12.43□□□□□ -0.42
CIC1P38779 YFR018CYFR018C 1092 nt12.43□□□□□ -0.42
CIC1P38779 PRE6YOL038W 765 nt12.42□□□□□ -0.42
CIC1P38779 MIC12YBR262C 321 nt12.42□□□□□ -0.42
CIC1P38779 YFL066CYFL066C 1179 nt12.39□□□□□ -0.43
CIC1P38779 PEX25YPL112C 1185 nt12.37□□□□□ -0.43
CIC1P38779 BNA2YJR078W 1362 nt12.37□□□□□ -0.43
CIC1P38779 YNL115CYNL115C 1935 nt12.37□□□□□ -0.43
CIC1P38779 NME1NME1 340 nt12.36□□□□□ -0.43
CIC1P38779 CCA1YER168C 1641 nt12.33□□□□□ -0.43
CIC1P38779 PAU16YKL224C 372 nt12.28□□□□□ -0.44
CIC1P38779 XDJ1YLR090W 1380 nt12.27□□□□□ -0.45
CIC1P38779 AGP1YCL025C 1902 nt12.27□□□□□ -0.45
CIC1P38779 HHO1YPL127C 777 nt12.25□□□□□ -0.45
CIC1P38779 SHM2YLR058C 1410 nt12.22□□□□□ -0.45
CIC1P38779 RRT5YFR032C 870 nt12.22□□□□□ -0.45
CIC1P38779 YGR201CYGR201C 678 nt12.21□□□□□ -0.45
CIC1P38779 TIM17YJL143W 477 nt12.19□□□□□ -0.46
CIC1P38779 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.18□□□□□ -0.46
CIC1P38779 VPS75YNL246W 795 nt12.18□□□□□ -0.46
CIC1P38779 GDH3YAL062W 1374 nt12.17□□□□□ -0.46
CIC1P38779 DUT1YBR252W 444 nt12.16□□□□□ -0.46
CIC1P38779 NIT1YIL164C 600 nt12.14□□□□□ -0.47
CIC1P38779 AVT6YER119C 1347 nt12.1□□□□□ -0.47
CIC1P38779 SGT2YOR007C 1041 nt12.09□□□□□ -0.47
CIC1P38779 MIR1YJR077C 936 nt12.06□□□□□ -0.48
CIC1P38779 FUR4YBR021W 1902 nt12.02□□□□□ -0.49
CIC1P38779 GOR1YNL274C 1053 nt12.01□□□□□ -0.49
CIC1P38779 DUS1YML080W 1272 nt12□□□□□ -0.49
CIC1P38779 DAT1YML113W 747 nt12□□□□□ -0.49
CIC1P38779 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.95□□□□□ -0.5
CIC1P38779 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.95□□□□□ -0.5
CIC1P38779 PAU7YAR020C 168 nt11.95□□□□□ -0.5
CIC1P38779 YDR010CYDR010C 333 nt11.94□□□□□ -0.5
CIC1P38779 THI74YDR438W 1113 nt11.94□□□□□ -0.5
CIC1P38779 SHB17YKR043C 816 nt11.94□□□□□ -0.5
CIC1P38779 GLK1YCL040W 1503 nt11.94□□□□□ -0.5
CIC1P38779 STR3YGL184C 1398 nt11.93□□□□□ -0.5
CIC1P38779 YJL225CYJL225C 5277 nt11.93□□□□□ -0.5
CIC1P38779 YCL074WYCL074W 927 nt11.93□□□□□ -0.5
CIC1P38779 NAT4YMR069W 858 nt11.92□□□□□ -0.5
CIC1P38779 HSP60YLR259C 1719 nt11.9□□□□□ -0.5
CIC1P38779 MSF1YPR047W 1410 nt11.89□□□□□ -0.51
CIC1P38779 YCR102CYCR102C 1107 nt11.87□□□□□ -0.51
CIC1P38779 UBA4YHR111W 1323 nt11.86□□□□□ -0.51
CIC1P38779 YGR139WYGR139W 339 nt11.86□□□□□ -0.51
CIC1P38779 NBP35YGL091C 987 nt11.85□□□□□ -0.51
CIC1P38779 AQY2YLL052C 450 nt11.85□□□□□ -0.51
CIC1P38779 RET2YFR051C 1641 nt11.8□□□□□ -0.52
CIC1P38779 SHH4YLR164W 507 nt11.78□□□□□ -0.52
CIC1P38779 BOR1YNL275W 1731 nt11.77□□□□□ -0.52
CIC1P38779 SFA1YDL168W 1161 nt11.76□□□□□ -0.53
CIC1P38779 YSR3YKR053C 1215 nt11.76□□□□□ -0.53
CIC1P38779 YKR005CYKR005C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
CIC1P38779 PHO89YBR296C 1725 nt11.74□□□□□ -0.53
CIC1P38779 YGL034CYGL034C 366 nt11.73□□□□□ -0.53
CIC1P38779 PRP4YPR178W 1398 nt11.73□□□□□ -0.53
CIC1P38779 XYL2YLR070C 1071 nt11.72□□□□□ -0.53
CIC1P38779 UME6YDR207C 2511 nt11.7□□□□□ -0.54
CIC1P38779 TIR3YIL011W 810 nt11.7□□□□□ -0.54
CIC1P38779 SBA1YKL117W 651 nt11.7□□□□□ -0.54
CIC1P38779 YGR259CYGR259C 441 nt11.69□□□□□ -0.54
CIC1P38779 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.68□□□□□ -0.54
CIC1P38779 RTN2YDL204W 1182 nt11.67□□□□□ -0.54
CIC1P38779 DPS1YLL018C 1674 nt11.67□□□□□ -0.54
CIC1P38779 ARP6YLR085C 1317 nt11.65□□□□□ -0.54
CIC1P38779 COQ2YNR041C 1119 nt11.65□□□□□ -0.54
CIC1P38779 POM34YLR018C 900 nt11.62□□□□□ -0.55
CIC1P38779 YCR087WYCR087W 516 nt11.61□□□□□ -0.55
CIC1P38779 PRO1YDR300C 1287 nt11.61□□□□□ -0.55
CIC1P38779 PLB1YMR008C 1995 nt11.61□□□□□ -0.55
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