Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.8□□□□□ -0.84
VBA2P38358 YLR179CYLR179C 606 nt9.8□□□□□ -0.84
VBA2P38358 MIC10YCL057C-A 294 nt9.8□□□□□ -0.84
VBA2P38358 SWE1YJL187C 2460 nt9.79□□□□□ -0.84
VBA2P38358 RAX1YOR301W 1308 nt9.77□□□□□ -0.85
VBA2P38358 STB1YNL309W 1263 nt9.75□□□□□ -0.85
VBA2P38358 ANP1YEL036C 1503 nt9.74□□□□□ -0.85
VBA2P38358 SPC25YER018C 666 nt9.74□□□□□ -0.85
VBA2P38358 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.73□□□□□ -0.85
VBA2P38358 GPI16YHR188C 1833 nt9.72□□□□□ -0.85
VBA2P38358 YPR064WYPR064W 420 nt9.71□□□□□ -0.86
VBA2P38358 AHT1YHR093W 549 nt9.7□□□□□ -0.86
VBA2P38358 BNA2YJR078W 1362 nt9.7□□□□□ -0.86
VBA2P38358 FEN2YCR028C 1539 nt9.68□□□□□ -0.86
VBA2P38358 RTG1YOL067C 534 nt9.68□□□□□ -0.86
VBA2P38358 WSC2YNL283C 1512 nt9.66□□□□□ -0.86
VBA2P38358 CCT4YDL143W 1587 nt9.66□□□□□ -0.86
VBA2P38358 VPS60YDR486C 690 nt9.63□□□□□ -0.87
VBA2P38358 TAD3YLR316C 969 nt9.63□□□□□ -0.87
VBA2P38358 CCA1YER168C 1641 nt9.62□□□□□ -0.87
VBA2P38358 SWC5YBR231C 912 nt9.61□□□□□ -0.87
VBA2P38358 MIC12YBR262C 321 nt9.61□□□□□ -0.87
VBA2P38358 YIR016WYIR016W 798 nt9.6□□□□□ -0.87
VBA2P38358 BOR1YNL275W 1731 nt9.59□□□□□ -0.87
VBA2P38358 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.59□□□□□ -0.87
VBA2P38358 YEL076CYEL076C 651 nt9.59□□□□□ -0.87
VBA2P38358 YLR464WYLR464W 651 nt9.59□□□□□ -0.87
VBA2P38358 HUA1YGR268C 597 nt9.58□□□□□ -0.88
VBA2P38358 MRPL8YJL063C 717 nt9.58□□□□□ -0.88
VBA2P38358 ALG3YBL082C 1377 nt9.56□□□□□ -0.88
VBA2P38358 HHO1YPL127C 777 nt9.56□□□□□ -0.88
VBA2P38358 ADO1YJR105W 1023 nt9.55□□□□□ -0.88
VBA2P38358 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.54□□□□□ -0.88
VBA2P38358 HSP60YLR259C 1719 nt9.51□□□□□ -0.89
VBA2P38358 FUR4YBR021W 1902 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA2P38358 YGR201CYGR201C 678 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA2P38358 GLK1YCL040W 1503 nt9.5□□□□□ -0.89
VBA2P38358 YLR415CYLR415C 339 nt9.48□□□□□ -0.89
VBA2P38358 BDH1YAL060W 1149 nt9.46□□□□□ -0.9
VBA2P38358 DUS1YML080W 1272 nt9.44□□□□□ -0.9
VBA2P38358 AGP1YCL025C 1902 nt9.44□□□□□ -0.9
VBA2P38358 XDJ1YLR090W 1380 nt9.42□□□□□ -0.9
VBA2P38358 YCL074WYCL074W 927 nt9.41□□□□□ -0.9
VBA2P38358 GDH3YAL062W 1374 nt9.39□□□□□ -0.91
VBA2P38358 GOR1YNL274C 1053 nt9.38□□□□□ -0.91
VBA2P38358 YSP3YOR003W 1437 nt9.38□□□□□ -0.91
VBA2P38358 PRP4YPR178W 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
VBA2P38358 AVT6YER119C 1347 nt9.37□□□□□ -0.91
VBA2P38358 TIM17YJL143W 477 nt9.36□□□□□ -0.91
VBA2P38358 SHM2YLR058C 1410 nt9.33□□□□□ -0.92
VBA2P38358 BMT6YLR063W 1098 nt9.33□□□□□ -0.92
VBA2P38358 YKR005CYKR005C 1578 nt9.32□□□□□ -0.92
VBA2P38358 RPM1RPM1 483 nt9.31□□□□□ -0.92
VBA2P38358 UME6YDR207C 2511 nt9.31□□□□□ -0.92
VBA2P38358 DPS1YLL018C 1674 nt9.3□□□□□ -0.92
VBA2P38358 YNL115CYNL115C 1935 nt9.29□□□□□ -0.92
VBA2P38358 STR3YGL184C 1398 nt9.29□□□□□ -0.92
VBA2P38358 PEX25YPL112C 1185 nt9.29□□□□□ -0.92
VBA2P38358 DUT1YBR252W 444 nt9.29□□□□□ -0.92
VBA2P38358 AAC1YMR056C 930 nt9.28□□□□□ -0.92
VBA2P38358 YGR259CYGR259C 441 nt9.27□□□□□ -0.93
VBA2P38358 AQY2YLL052C 450 nt9.25□□□□□ -0.93
VBA2P38358 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
VBA2P38358 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
VBA2P38358 YFR018CYFR018C 1092 nt9.24□□□□□ -0.93
VBA2P38358 VPS75YNL246W 795 nt9.24□□□□□ -0.93
VBA2P38358 NIT1YIL164C 600 nt9.23□□□□□ -0.93
VBA2P38358 DAT1YML113W 747 nt9.23□□□□□ -0.93
VBA2P38358 ALG12YNR030W 1656 nt9.23□□□□□ -0.93
VBA2P38358 YFL066CYFL066C 1179 nt9.21□□□□□ -0.94
VBA2P38358 YCR102CYCR102C 1107 nt9.19□□□□□ -0.94
VBA2P38358 SGT2YOR007C 1041 nt9.19□□□□□ -0.94
VBA2P38358 IRC24YIR036C 792 nt9.18□□□□□ -0.94
VBA2P38358 RTN2YDL204W 1182 nt9.17□□□□□ -0.94
VBA2P38358 YDR094WYDR094W 336 nt9.15□□□□□ -0.94
VBA2P38358 RRT5YFR032C 870 nt9.12□□□□□ -0.95
VBA2P38358 NBP35YGL091C 987 nt9.12□□□□□ -0.95
VBA2P38358 PAU7YAR020C 168 nt9.12□□□□□ -0.95
VBA2P38358 MCH5YOR306C 1566 nt9.09□□□□□ -0.95
VBA2P38358 PRE6YOL038W 765 nt9.09□□□□□ -0.95
VBA2P38358 SNF1YDR477W 1902 nt9.09□□□□□ -0.95
VBA2P38358 ARP6YLR085C 1317 nt9.05□□□□□ -0.96
VBA2P38358 BIO5YNR056C 1686 nt9.04□□□□□ -0.96
VBA2P38358 NME1NME1 340 nt9.03□□□□□ -0.96
VBA2P38358 TIR3YIL011W 810 nt9.02□□□□□ -0.97
VBA2P38358 LSC2YGR244C 1284 nt9.01□□□□□ -0.97
VBA2P38358 PLB1YMR008C 1995 nt9□□□□□ -0.97
VBA2P38358 PAU16YKL224C 372 nt8.99□□□□□ -0.97
VBA2P38358 SHB17YKR043C 816 nt8.98□□□□□ -0.97
VBA2P38358 MIR1YJR077C 936 nt8.97□□□□□ -0.97
VBA2P38358 NAR1YNL240C 1476 nt8.96□□□□□ -0.97
VBA2P38358 YDR010CYDR010C 333 nt8.96□□□□□ -0.98
VBA2P38358 UBX6YJL048C 1191 nt8.96□□□□□ -0.98
VBA2P38358 GAP1YKR039W 1809 nt8.92□□□□□ -0.98
VBA2P38358 RET2YFR051C 1641 nt8.92□□□□□ -0.98
VBA2P38358 UBA4YHR111W 1323 nt8.92□□□□□ -0.98
VBA2P38358 THI74YDR438W 1113 nt8.92□□□□□ -0.98
VBA2P38358 YML089CYML089C 369 nt8.92□□□□□ -0.98
VBA2P38358 PRO1YDR300C 1287 nt8.91□□□□□ -0.98
VBA2P38358 POM34YLR018C 900 nt8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7 ms