Protein–RNA interactions for Protein: P38348

HSM3, DNA mismatch repair protein HSM3, yeastyeast

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSM3P38348 DIC1YLR348C 897 nt11.01□□□□□ -0.65
HSM3P38348 GAL1YBR020W 1587 nt11.01□□□□□ -0.65
HSM3P38348 DDR2YOL052C-A 186 nt11□□□□□ -0.65
HSM3P38348 ALG12YNR030W 1656 nt10.99□□□□□ -0.65
HSM3P38348 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.94□□□□□ -0.66
HSM3P38348 PRP4YPR178W 1398 nt10.92□□□□□ -0.66
HSM3P38348 ANP1YEL036C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
HSM3P38348 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.89□□□□□ -0.67
HSM3P38348 YEL076CYEL076C 651 nt10.89□□□□□ -0.67
HSM3P38348 YLR464WYLR464W 651 nt10.89□□□□□ -0.67
HSM3P38348 BNA2YJR078W 1362 nt10.89□□□□□ -0.67
HSM3P38348 DPS1YLL018C 1674 nt10.86□□□□□ -0.67
HSM3P38348 PTH1YHR189W 573 nt10.84□□□□□ -0.67
HSM3P38348 AAC1YMR056C 930 nt10.84□□□□□ -0.67
HSM3P38348 AQY1YPR192W 918 nt10.84□□□□□ -0.67
HSM3P38348 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.83□□□□□ -0.68
HSM3P38348 AGP1YCL025C 1902 nt10.82□□□□□ -0.68
HSM3P38348 STB1YNL309W 1263 nt10.81□□□□□ -0.68
HSM3P38348 MIC12YBR262C 321 nt10.81□□□□□ -0.68
HSM3P38348 FEN2YCR028C 1539 nt10.8□□□□□ -0.68
HSM3P38348 DUS1YML080W 1272 nt10.8□□□□□ -0.68
HSM3P38348 YKR005CYKR005C 1578 nt10.79□□□□□ -0.68
HSM3P38348 BMT6YLR063W 1098 nt10.79□□□□□ -0.68
HSM3P38348 SPC25YER018C 666 nt10.78□□□□□ -0.68
HSM3P38348 SPP1YPL138C 1062 nt10.78□□□□□ -0.68
HSM3P38348 WSC2YNL283C 1512 nt10.78□□□□□ -0.68
HSM3P38348 TIM23YNR017W 669 nt10.77□□□□□ -0.69
HSM3P38348 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.77□□□□□ -0.69
HSM3P38348 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.77□□□□□ -0.69
HSM3P38348 YLR179CYLR179C 606 nt10.76□□□□□ -0.69
HSM3P38348 GPI16YHR188C 1833 nt10.75□□□□□ -0.69
HSM3P38348 HHO1YPL127C 777 nt10.75□□□□□ -0.69
HSM3P38348 YCL074WYCL074W 927 nt10.74□□□□□ -0.69
HSM3P38348 YLR235CYLR235C 399 nt10.74□□□□□ -0.69
HSM3P38348 SNF1YDR477W 1902 nt10.71□□□□□ -0.69
HSM3P38348 YIR016WYIR016W 798 nt10.71□□□□□ -0.69
HSM3P38348 NAR1YNL240C 1476 nt10.71□□□□□ -0.69
HSM3P38348 VPS60YDR486C 690 nt10.7□□□□□ -0.7
HSM3P38348 BIO5YNR056C 1686 nt10.69□□□□□ -0.7
HSM3P38348 YGR259CYGR259C 441 nt10.69□□□□□ -0.7
HSM3P38348 CCT4YDL143W 1587 nt10.68□□□□□ -0.7
HSM3P38348 AHT1YHR093W 549 nt10.66□□□□□ -0.7
HSM3P38348 ALG3YBL082C 1377 nt10.65□□□□□ -0.71
HSM3P38348 XDJ1YLR090W 1380 nt10.63□□□□□ -0.71
HSM3P38348 SWC5YBR231C 912 nt10.62□□□□□ -0.71
HSM3P38348 YGR201CYGR201C 678 nt10.61□□□□□ -0.71
HSM3P38348 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.61□□□□□ -0.71
HSM3P38348 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.61□□□□□ -0.71
HSM3P38348 IRC24YIR036C 792 nt10.6□□□□□ -0.71
HSM3P38348 YKL030WYKL030W 606 nt10.6□□□□□ -0.71
HSM3P38348 DUT1YBR252W 444 nt10.59□□□□□ -0.71
HSM3P38348 STR3YGL184C 1398 nt10.57□□□□□ -0.72
HSM3P38348 PBP1YGR178C 2169 nt10.57□□□□□ -0.72
HSM3P38348 YPR064WYPR064W 420 nt10.56□□□□□ -0.72
HSM3P38348 MRPL8YJL063C 717 nt10.53□□□□□ -0.72
HSM3P38348 AQY2YLL052C 450 nt10.52□□□□□ -0.73
HSM3P38348 AVT6YER119C 1347 nt10.52□□□□□ -0.73
HSM3P38348 CYT2YKL087C 675 nt10.51□□□□□ -0.73
HSM3P38348 TAD3YLR316C 969 nt10.49□□□□□ -0.73
HSM3P38348 GOR1YNL274C 1053 nt10.49□□□□□ -0.73
HSM3P38348 GDH3YAL062W 1374 nt10.47□□□□□ -0.73
HSM3P38348 FRE6YLL051C 2139 nt10.46□□□□□ -0.73
HSM3P38348 ADO1YJR105W 1023 nt10.44□□□□□ -0.74
HSM3P38348 BDH1YAL060W 1149 nt10.41□□□□□ -0.74
HSM3P38348 RTN2YDL204W 1182 nt10.4□□□□□ -0.74
HSM3P38348 RTG1YOL067C 534 nt10.39□□□□□ -0.75
HSM3P38348 CMP2YML057W 1815 nt10.39□□□□□ -0.75
HSM3P38348 SHM2YLR058C 1410 nt10.36□□□□□ -0.75
HSM3P38348 YLR415CYLR415C 339 nt10.35□□□□□ -0.75
HSM3P38348 HSL7YBR133C 2484 nt10.31□□□□□ -0.76
HSM3P38348 YAT1YAR035W 2064 nt10.31□□□□□ -0.76
HSM3P38348 TIM17YJL143W 477 nt10.29□□□□□ -0.76
HSM3P38348 YSP3YOR003W 1437 nt10.27□□□□□ -0.77
HSM3P38348 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.27□□□□□ -0.77
HSM3P38348 HUA1YGR268C 597 nt10.27□□□□□ -0.77
HSM3P38348 HEL2YDR266C 1920 nt10.25□□□□□ -0.77
HSM3P38348 PLB1YMR008C 1995 nt10.25□□□□□ -0.77
HSM3P38348 NIT1YIL164C 600 nt10.25□□□□□ -0.77
HSM3P38348 DAT1YML113W 747 nt10.25□□□□□ -0.77
HSM3P38348 NBP35YGL091C 987 nt10.22□□□□□ -0.77
HSM3P38348 YCR102CYCR102C 1107 nt10.19□□□□□ -0.78
HSM3P38348 SGT2YOR007C 1041 nt10.19□□□□□ -0.78
HSM3P38348 PRM5YIL117C 957 nt10.18□□□□□ -0.78
HSM3P38348 NDI1YML120C 1542 nt10.17□□□□□ -0.78
HSM3P38348 ARP6YLR085C 1317 nt10.17□□□□□ -0.78
HSM3P38348 SSN3YPL042C 1668 nt10.17□□□□□ -0.78
HSM3P38348 HIF1YLL022C 1158 nt10.16□□□□□ -0.78
HSM3P38348 ALD4YOR374W 1560 nt10.14□□□□□ -0.79
HSM3P38348 YNL115CYNL115C 1935 nt10.13□□□□□ -0.79
HSM3P38348 MET2YNL277W 1461 nt10.1□□□□□ -0.79
HSM3P38348 UTR1YJR049C 1593 nt10.08□□□□□ -0.8
HSM3P38348 SPT20YOL148C 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
HSM3P38348 PEX25YPL112C 1185 nt10.07□□□□□ -0.8
HSM3P38348 INA1YLR413W 2028 nt10.07□□□□□ -0.8
HSM3P38348 RPC82YPR190C 1965 nt10.06□□□□□ -0.8
HSM3P38348 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.06□□□□□ -0.8
HSM3P38348 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.06□□□□□ -0.8
HSM3P38348 YFL066CYFL066C 1179 nt10.02□□□□□ -0.81
HSM3P38348 GAP1YKR039W 1809 nt10.02□□□□□ -0.81
HSM3P38348 VPS75YNL246W 795 nt10.01□□□□□ -0.81
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