Protein–RNA interactions for Protein: P38187

UBP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, yeastyeast

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP13P38187 ATF2YGR177C 1608 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP13P38187 YFL067WYFL067W 528 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP13P38187 DDR2YOL052C-A 186 nt11.97□□□□□ -0.49
UBP13P38187 YDR094WYDR094W 336 nt11.96□□□□□ -0.49
UBP13P38187 CRR1YLR213C 1269 nt11.95□□□□□ -0.5
UBP13P38187 STB1YNL309W 1263 nt11.93□□□□□ -0.5
UBP13P38187 LYS4YDR234W 2082 nt11.92□□□□□ -0.5
UBP13P38187 SPC25YER018C 666 nt11.91□□□□□ -0.5
UBP13P38187 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.89□□□□□ -0.51
UBP13P38187 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.88□□□□□ -0.51
UBP13P38187 PTK1YKL198C 1989 nt11.88□□□□□ -0.51
UBP13P38187 GPI16YHR188C 1833 nt11.86□□□□□ -0.51
UBP13P38187 CCT4YDL143W 1587 nt11.86□□□□□ -0.51
UBP13P38187 HEM12YDR047W 1089 nt11.85□□□□□ -0.51
UBP13P38187 UME6YDR207C 2511 nt11.84□□□□□ -0.51
UBP13P38187 SNG1YGR197C 1644 nt11.83□□□□□ -0.52
UBP13P38187 ANP1YEL036C 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP13P38187 YFR018CYFR018C 1092 nt11.81□□□□□ -0.52
UBP13P38187 VPS60YDR486C 690 nt11.8□□□□□ -0.52
UBP13P38187 MIC10YCL057C-A 294 nt11.8□□□□□ -0.52
UBP13P38187 FEN2YCR028C 1539 nt11.8□□□□□ -0.52
UBP13P38187 BDH1YAL060W 1149 nt11.79□□□□□ -0.52
UBP13P38187 SWC5YBR231C 912 nt11.79□□□□□ -0.52
UBP13P38187 YLR415CYLR415C 339 nt11.77□□□□□ -0.53
UBP13P38187 ALG3YBL082C 1377 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP13P38187 YSP3YOR003W 1437 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP13P38187 YFL054CYFL054C 1941 nt11.71□□□□□ -0.53
UBP13P38187 RRT5YFR032C 870 nt11.71□□□□□ -0.53
UBP13P38187 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP13P38187 YIR016WYIR016W 798 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP13P38187 PRE6YOL038W 765 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP13P38187 PEX25YPL112C 1185 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP13P38187 YFL066CYFL066C 1179 nt11.68□□□□□ -0.54
UBP13P38187 YJL225CYJL225C 5277 nt11.68□□□□□ -0.54
UBP13P38187 YNL115CYNL115C 1935 nt11.66□□□□□ -0.54
UBP13P38187 PAU16YKL224C 372 nt11.65□□□□□ -0.54
UBP13P38187 BNA2YJR078W 1362 nt11.65□□□□□ -0.55
UBP13P38187 RAX1YOR301W 1308 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP13P38187 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP13P38187 SPT8YLR055C 1809 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP13P38187 MIC12YBR262C 321 nt11.57□□□□□ -0.56
UBP13P38187 VPS75YNL246W 795 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP13P38187 TIM17YJL143W 477 nt11.52□□□□□ -0.57
UBP13P38187 HHO1YPL127C 777 nt11.49□□□□□ -0.57
UBP13P38187 XDJ1YLR090W 1380 nt11.49□□□□□ -0.57
UBP13P38187 SHM2YLR058C 1410 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP13P38187 YGR201CYGR201C 678 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP13P38187 GDH3YAL062W 1374 nt11.44□□□□□ -0.58
UBP13P38187 SWE1YJL187C 2460 nt11.43□□□□□ -0.58
UBP13P38187 GLK1YCL040W 1503 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP13P38187 NAT4YMR069W 858 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP13P38187 PAU7YAR020C 168 nt11.4□□□□□ -0.58
UBP13P38187 CCA1YER168C 1641 nt11.39□□□□□ -0.59
UBP13P38187 MIR1YJR077C 936 nt11.38□□□□□ -0.59
UBP13P38187 THI74YDR438W 1113 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP13P38187 NIT1YIL164C 600 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP13P38187 AVT6YER119C 1347 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP13P38187 SGT2YOR007C 1041 nt11.33□□□□□ -0.6
UBP13P38187 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.33□□□□□ -0.6
UBP13P38187 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.33□□□□□ -0.6
UBP13P38187 GOR1YNL274C 1053 nt11.32□□□□□ -0.6
UBP13P38187 MSF1YPR047W 1410 nt11.32□□□□□ -0.6
UBP13P38187 AGP1YCL025C 1902 nt11.31□□□□□ -0.6
UBP13P38187 SHB17YKR043C 816 nt11.25□□□□□ -0.61
UBP13P38187 DAT1YML113W 747 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP13P38187 DUT1YBR252W 444 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP13P38187 UBA4YHR111W 1323 nt11.23□□□□□ -0.61
UBP13P38187 DUS1YML080W 1272 nt11.21□□□□□ -0.61
UBP13P38187 YDR010CYDR010C 333 nt11.2□□□□□ -0.62
UBP13P38187 YCR102CYCR102C 1107 nt11.19□□□□□ -0.62
UBP13P38187 SBA1YKL117W 651 nt11.17□□□□□ -0.62
UBP13P38187 YSR3YKR053C 1215 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP13P38187 YGL034CYGL034C 366 nt11.15□□□□□ -0.62
UBP13P38187 RET2YFR051C 1641 nt11.13□□□□□ -0.63
UBP13P38187 BOR1YNL275W 1731 nt11.12□□□□□ -0.63
UBP13P38187 YCL074WYCL074W 927 nt11.11□□□□□ -0.63
UBP13P38187 PHO89YBR296C 1725 nt11.11□□□□□ -0.63
UBP13P38187 STR3YGL184C 1398 nt11.1□□□□□ -0.63
UBP13P38187 MCH5YOR306C 1566 nt11.1□□□□□ -0.63
UBP13P38187 XYL2YLR070C 1071 nt11.08□□□□□ -0.64
UBP13P38187 YCR087WYCR087W 516 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP13P38187 AQY2YLL052C 450 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP13P38187 FUR4YBR021W 1902 nt11.06□□□□□ -0.64
UBP13P38187 NBP35YGL091C 987 nt11.06□□□□□ -0.64
UBP13P38187 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP13P38187 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP13P38187 HSP60YLR259C 1719 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP13P38187 SFA1YDL168W 1161 nt11□□□□□ -0.65
UBP13P38187 MRP20YDR405W 792 nt11□□□□□ -0.65
UBP13P38187 RBG1YAL036C 1110 nt11□□□□□ -0.65
UBP13P38187 TIR3YIL011W 810 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP13P38187 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP13P38187 AIM45YPR004C 1035 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP13P38187 NDI1YML120C 1542 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP13P38187 COQ2YNR041C 1119 nt10.97□□□□□ -0.65
UBP13P38187 SHH4YLR164W 507 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP13P38187 GLR1YPL091W 1452 nt10.93□□□□□ -0.66
UBP13P38187 LSC2YGR244C 1284 nt10.91□□□□□ -0.66
UBP13P38187 POM34YLR018C 900 nt10.89□□□□□ -0.67
UBP13P38187 YMR244WYMR244W 1068 nt10.89□□□□□ -0.67
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