Protein–RNA interactions for Protein: P38065

APL3, AP-2 complex subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL3P38065 YEL076CYEL076C 651 nt9.7□□□□□ -0.86
APL3P38065 YLR464WYLR464W 651 nt9.7□□□□□ -0.86
APL3P38065 RTG1YOL067C 534 nt9.7□□□□□ -0.86
APL3P38065 NAR1YNL240C 1476 nt9.69□□□□□ -0.86
APL3P38065 YKL030WYKL030W 606 nt9.68□□□□□ -0.86
APL3P38065 DPS1YLL018C 1674 nt9.67□□□□□ -0.86
APL3P38065 CCA1YER168C 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
APL3P38065 ADO1YJR105W 1023 nt9.65□□□□□ -0.86
APL3P38065 RAX1YOR301W 1308 nt9.64□□□□□ -0.87
APL3P38065 HEM12YDR047W 1089 nt9.63□□□□□ -0.87
APL3P38065 YLL053CYLL053C 459 nt9.63□□□□□ -0.87
APL3P38065 BMT6YLR063W 1098 nt9.63□□□□□ -0.87
APL3P38065 TIM23YNR017W 669 nt9.63□□□□□ -0.87
APL3P38065 MIC10YCL057C-A 294 nt9.6□□□□□ -0.87
APL3P38065 HUA1YGR268C 597 nt9.59□□□□□ -0.87
APL3P38065 FTR1YER145C 1215 nt9.58□□□□□ -0.88
APL3P38065 YLR179CYLR179C 606 nt9.58□□□□□ -0.88
APL3P38065 AQY1YPR192W 918 nt9.57□□□□□ -0.88
APL3P38065 BIO5YNR056C 1686 nt9.56□□□□□ -0.88
APL3P38065 YKR005CYKR005C 1578 nt9.56□□□□□ -0.88
APL3P38065 ATF2YGR177C 1608 nt9.55□□□□□ -0.88
APL3P38065 SNG1YGR197C 1644 nt9.55□□□□□ -0.88
APL3P38065 GAL1YBR020W 1587 nt9.54□□□□□ -0.88
APL3P38065 SNF1YDR477W 1902 nt9.52□□□□□ -0.88
APL3P38065 YFL067WYFL067W 528 nt9.52□□□□□ -0.89
APL3P38065 TRM5YHR070W 1500 nt9.51□□□□□ -0.89
APL3P38065 YPR064WYPR064W 420 nt9.51□□□□□ -0.89
APL3P38065 NME1NME1 340 nt9.51□□□□□ -0.89
APL3P38065 CYT2YKL087C 675 nt9.49□□□□□ -0.89
APL3P38065 DDR2YOL052C-A 186 nt9.49□□□□□ -0.89
APL3P38065 WSC2YNL283C 1512 nt9.49□□□□□ -0.89
APL3P38065 AHT1YHR093W 549 nt9.48□□□□□ -0.89
APL3P38065 PBP1YGR178C 2169 nt9.48□□□□□ -0.89
APL3P38065 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.44□□□□□ -0.9
APL3P38065 YGR259CYGR259C 441 nt9.44□□□□□ -0.9
APL3P38065 STB1YNL309W 1263 nt9.44□□□□□ -0.9
APL3P38065 BNA2YJR078W 1362 nt9.43□□□□□ -0.9
APL3P38065 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.43□□□□□ -0.9
APL3P38065 SPC25YER018C 666 nt9.43□□□□□ -0.9
APL3P38065 TAD3YLR316C 969 nt9.43□□□□□ -0.9
APL3P38065 DUS1YML080W 1272 nt9.43□□□□□ -0.9
APL3P38065 YCL074WYCL074W 927 nt9.42□□□□□ -0.9
APL3P38065 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.42□□□□□ -0.9
APL3P38065 IRC24YIR036C 792 nt9.42□□□□□ -0.9
APL3P38065 GPI16YHR188C 1833 nt9.41□□□□□ -0.9
APL3P38065 ANP1YEL036C 1503 nt9.39□□□□□ -0.91
APL3P38065 AGP1YCL025C 1902 nt9.39□□□□□ -0.91
APL3P38065 CMP2YML057W 1815 nt9.38□□□□□ -0.91
APL3P38065 CCT4YDL143W 1587 nt9.37□□□□□ -0.91
APL3P38065 MIC12YBR262C 321 nt9.35□□□□□ -0.91
APL3P38065 FEN2YCR028C 1539 nt9.35□□□□□ -0.91
APL3P38065 VPS60YDR486C 690 nt9.34□□□□□ -0.91
APL3P38065 SWC5YBR231C 912 nt9.34□□□□□ -0.91
APL3P38065 YDR094WYDR094W 336 nt9.28□□□□□ -0.92
APL3P38065 BDH1YAL060W 1149 nt9.28□□□□□ -0.92
APL3P38065 YLR415CYLR415C 339 nt9.28□□□□□ -0.92
APL3P38065 ALG3YBL082C 1377 nt9.27□□□□□ -0.93
APL3P38065 RPM1RPM1 483 nt9.27□□□□□ -0.93
APL3P38065 HHO1YPL127C 777 nt9.27□□□□□ -0.93
APL3P38065 YIR016WYIR016W 798 nt9.25□□□□□ -0.93
APL3P38065 YAT1YAR035W 2064 nt9.24□□□□□ -0.93
APL3P38065 YFR018CYFR018C 1092 nt9.23□□□□□ -0.93
APL3P38065 YSP3YOR003W 1437 nt9.22□□□□□ -0.93
APL3P38065 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.21□□□□□ -0.93
APL3P38065 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.21□□□□□ -0.93
APL3P38065 NDI1YML120C 1542 nt9.21□□□□□ -0.93
APL3P38065 PEX25YPL112C 1185 nt9.21□□□□□ -0.94
APL3P38065 UBX6YJL048C 1191 nt9.2□□□□□ -0.94
APL3P38065 XDJ1YLR090W 1380 nt9.2□□□□□ -0.94
APL3P38065 YGR201CYGR201C 678 nt9.18□□□□□ -0.94
APL3P38065 HSL7YBR133C 2484 nt9.17□□□□□ -0.94
APL3P38065 STR3YGL184C 1398 nt9.17□□□□□ -0.94
APL3P38065 YNL115CYNL115C 1935 nt9.15□□□□□ -0.94
APL3P38065 RRT5YFR032C 870 nt9.14□□□□□ -0.95
APL3P38065 RTN2YDL204W 1182 nt9.12□□□□□ -0.95
APL3P38065 TIM17YJL143W 477 nt9.12□□□□□ -0.95
APL3P38065 AQY2YLL052C 450 nt9.12□□□□□ -0.95
APL3P38065 DUT1YBR252W 444 nt9.11□□□□□ -0.95
APL3P38065 YFL066CYFL066C 1179 nt9.1□□□□□ -0.95
APL3P38065 PRE6YOL038W 765 nt9.1□□□□□ -0.95
APL3P38065 VPS75YNL246W 795 nt9.08□□□□□ -0.96
APL3P38065 SPT20YOL148C 1815 nt9.08□□□□□ -0.96
APL3P38065 SHM2YLR058C 1410 nt9.07□□□□□ -0.96
APL3P38065 GDH3YAL062W 1374 nt9.07□□□□□ -0.96
APL3P38065 PAU16YKL224C 372 nt9.06□□□□□ -0.96
APL3P38065 GOR1YNL274C 1053 nt9.03□□□□□ -0.96
APL3P38065 AVT6YER119C 1347 nt9.03□□□□□ -0.96
APL3P38065 INA1YLR413W 2028 nt9.01□□□□□ -0.97
APL3P38065 RPC82YPR190C 1965 nt8.99□□□□□ -0.97
APL3P38065 NIT1YIL164C 600 nt8.97□□□□□ -0.97
APL3P38065 YGR139WYGR139W 339 nt8.96□□□□□ -0.98
APL3P38065 PAU7YAR020C 168 nt8.96□□□□□ -0.98
APL3P38065 SGT2YOR007C 1041 nt8.96□□□□□ -0.98
APL3P38065 DAT1YML113W 747 nt8.95□□□□□ -0.98
APL3P38065 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.94□□□□□ -0.98
APL3P38065 HIF1YLL022C 1158 nt8.94□□□□□ -0.98
APL3P38065 HEL2YDR266C 1920 nt8.93□□□□□ -0.98
APL3P38065 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.92□□□□□ -0.98
APL3P38065 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.92□□□□□ -0.98
APL3P38065 ALD4YOR374W 1560 nt8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms