Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdha1P35486 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdha1P35486 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdha1P35486 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdha1P35486 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdha1P35486 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdha1P35486 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdha1P35486 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdha1P35486 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdha1P35486 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdha1P35486 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdha1P35486 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdha1P35486 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdha1P35486 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdha1P35486 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdha1P35486 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdha1P35486 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdha1P35486 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdha1P35486 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdha1P35486 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdha1P35486 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdha1P35486 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdha1P35486 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdha1P35486 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdha1P35486 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdha1P35486 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdha1P35486 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdha1P35486 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdha1P35486 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdha1P35486 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdha1P35486 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdha1P35486 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdha1P35486 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdha1P35486 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdha1P35486 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdha1P35486 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdha1P35486 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms